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非标记定量方法研究糖尿病患者血清 差异 蛋白 2024年 血清 中差异 表达蛋白,筛选特异性蛋白质标志物。方法收集2023年深圳市糖尿病患者和健康对照者的血清 各3例,应用免疫亲和层析和纳升液相色谱-四极杆-静电场轨道线性离子阱三合一质谱法,利用分级(fraction,FC)和不分级(no fraction,NF)2种方法对糖尿病患者和健康对照者的血清 蛋白质组进行非标记定量分析,质谱数据经MaxQuant1.6.1.0进行检索,对分级方法鉴定的差异 蛋白质进行GO(gene oncology)功能聚类分析和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析。结果未分级方法鉴定可信蛋白251种,筛选差异 蛋白17种;分级方法鉴定可信蛋白494种,筛选差异 蛋白74种。其中7种蛋白在2种方法中变化趋势完全一致。有5种蛋白下调,分别是妊娠区带蛋白(pregnancy zone protein,PZP)、碳酸酐酶1(carbonic anhydrase 1,CAH1)、甘露糖结合蛋白C(mannose-binding protein C,MBL2)、纤维蛋白原α链(fibrinogen alpha chain,FIBA)和触珠蛋白(haptoglobin,HPT);2种蛋白上调,分别是脂蛋白a[apolipoprotein(a),LPA]和补体因子H相关蛋白4(complement fac‐tor H-related protein 4,CFH4)。GO分析显示差异 蛋白的分子功能主要集中在糖胺聚糖结合、肝素结合等过程。KEGG通路分析显示差异 蛋白主要集中在补体和级联凝血、细胞黏附、PI3K-Akt信号通路等通路上。结论基于分级的非标记定量蛋白质组学分析技术可有效分析糖尿病患者血清 蛋白的差异 表达,为筛选大规模队列疾病血清 样本的特异性蛋白质标志物提供了有效技术手段。关键词：糖尿病 血清 蛋白组学 发育性颈椎管狭窄与脊髓型颈椎病血清 差异 蛋白组学分析 被引量：1 2024年 血清 蛋白组学差异 质,寻找并鉴定两者之间的潜在血清 生物学标志物。方法:分别采集气虚血瘀证脊髓型颈椎病患者(实验组)血清 9例、气虚血瘀证发育性颈椎管狭窄(对照组)血清 9例,选用同位素相对标记与绝对定量技术(TMT)联合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术进行蛋白组学分析,以此寻找并鉴定差异 表达的蛋白质。结果与结论:①TMT技术共筛选出有意义差异 蛋白1027种,最终鉴定出显著性差异 蛋白89种(P<0.05),其中与对照组比较,实验组中α-肌动蛋白4、α-肌动蛋白1、细胞分裂控制蛋白42同系物、整合素连接蛋白激酶、Β-肌动蛋白等45种蛋白表达上调;纤维连接蛋白、纤维蛋白原γ链、纤维蛋白原α链、纤维蛋白原β链等44种蛋白表达下调;②基于GO富集分析,这些差异 蛋白参与了信号受体结合、激酶结合、蛋白激酶活性、整合素结合、肌动蛋白丝结合等分子功能;③KEGG通路分析,筛选20条主要共同差异 信号/代谢通路,分别为粘着斑、紧密连接、Rap1信号通路、血小板活化、肌动蛋白细胞骨架的调节等信号通路;④PPI分析表明,气虚血瘀证发育性颈椎管狭窄与脊髓型颈椎病之间的共同差异 蛋白中ILK,FGA,FGB,FGG,FN1,CDC42,ACTN1,ACTN4,ACTB等位于蛋白质互作网络的节点,且与骨生成与破坏系统、神经系统、凝血系统、细胞炎症等系统关系密切;⑤结论:采用TMT联合LC-MS/MS技术成功筛选出了气虚血瘀证发育性颈椎管狭窄与脊髓型颈椎病之间的血清 差异 表达蛋白质,明确了ILK、FN1、CDC42、ACTN4是气虚血瘀证发育性颈椎管狭窄向脊髓型颈椎病转化的特异性标志关键词：发育性颈椎管狭窄 脊髓型颈椎病 差异蛋白 基于TMT定量蛋白质组学技术筛选贝赫切特病血清 差异 蛋白 2024年 血清 标志物,BD的诊断主要依靠其临床表现,当患者症状不典型时,极易漏诊、误诊;因此,筛选和鉴定BD特异的血清 分子标志物是BD研究的热点。关键词：差异蛋白 C3 中暑不同证型中医证候评分与血清 差异 蛋白的关联性分析及验证 2024年 血清 差异 蛋白的关联性并进行验证,以期为中暑的早期辨证提供实验依据。方法采用病例对照研究设计,选择2022年5月—2023年5月前往中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院就诊的阳暑型、暑厥型中暑患者与对照受试者,分别为阳暑型组6例、暑厥型组11例和对照组10例,3组先进行中医证候评分,再各取4例的外周血清 进行蛋白组学分析并根据蛋白组学结果FC≥1.5或FC≤0.6667,且P<0.05找出组间显著性差异 蛋白,最后采用酶联免疫吸附(ELISA)法进行验证,并进行相关性分析。结果与对照组比较,阳暑型组和暑厥型组中医证候评分均显著增高(P<0.05),阳属型组和暑厥型组共鉴定出3854个表达差异 蛋白(P<0.05),其中阳暑型组显著上调表达蛋白有96个、下调表达蛋白51个,暑厥型组显著上调表达蛋白58个、下调表达蛋白110个。共同差异 蛋白分析显示,阳暑型组和暑厥型组中白细胞介素增强因子-2(ILF-2)含量显著增高(P<0.05),磷脂酰肌醇-聚糖特异性磷脂酶D1(GPLD1)含量则显著降低(P<0.05)。相关性分析提示GPLD1含量与中医证候评分呈负相关。结论阳暑型和暑厥型中暑患者外周血清 存在ILF-2含量增高和GPLD1含量降低的2个共同差异 蛋白,且GPLD1含量变化与中医证候评分呈负相关。关键词：中暑 中医证候评分 差异蛋白 BeSO<Sub>4</Sub>染毒大鼠血清 差异 表达蛋白检测与分析方法 血清 差异 表达蛋白检测与分析方法，步骤如下：1、获取大鼠血清 ；2、样品制备；3、蛋白还原处理；4、蛋白烷基化处理；5、蛋白酶解；6、对蛋白进行TMT标记；7、对样品进行LC‑MS/M...基于4D-DIA蛋白质组学分析肺腺癌骨转移与非骨转移患者的血清 差异 蛋白 2024年 差异 蛋白,为肺腺癌骨转移诊断治疗提供新线索。方法:采用4D-DIA蛋白质组学技术,纳入6例肺腺癌非骨转移(lung adenocarcinoma non-bone metastases, LUADNBM)及6例肺腺癌骨转移(lung adenocarcinoma bone metastasis, LUADBM)患者进行血清 蛋白质组学分析。以表达倍数(fold change, FC)>1.5倍(上调大于1.5倍或下调小于0.67倍)且P值<0.05(T-test或其他)为标准,得到比较组间的上调、下调蛋白质数目。对两组间的可定量蛋白进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)。应用String网站和R语言对差异 蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、基因本体论(gene ontology,GO)分析和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路数据库分析。结果:LUADNBM组与LUADBM组间比较发现2 585个可定量蛋白,其中18个差异 蛋白。GSEA结果显示,可定量蛋白主要富集在真核翻译延伸阶段、SARS-CoV-2主要翻译机制通路(P<0.05)。PCA结果显示,差异 蛋白可明显区分LUADNBM与LUADBM患者。GO分析结果表明,差异 蛋白主要富集在高尔基管腔和细胞外基质,在皮肤硫酸盐蛋白聚糖的生物合成和代谢过程以及硫酸软骨素的分解代谢和生物合成中发挥重要作用;KEGG结果表明:上调蛋白主要富集在近端小管碳酸氢盐回收、胆汁分泌、N-聚糖生物合成、胰岛素分泌、醛固酮的合成和分泌等通路;下调蛋白主要富集在神经退行性疾病的途径,如阿尔茨海默病、亨廷顿病、帕金森病、脊髓小脑性共济失调等。结论:肺腺癌骨转移组与非骨转移组蛋白存在明显差异 ,通过发现新型蛋白标志物为早期筛查诊断骨转移提供新线索。关键词：肺腺癌 骨转移 蛋白质组学 急性期神经根型颈椎病患者的血清 差异 蛋白组学分析 被引量：3 2024年 血清 蛋白组学差异 表达,并寻找及鉴定两者之间的潜在特异性血清 标志物。方法:收集急性期神经根型颈椎病患者、正常健康人群血清 各8例,应用绝对定量技术联合液相色谱-串联质谱技术进行蛋白组学筛选与分析,以期探寻与鉴定急性期神经根型颈椎病患者差异 表达的血清 蛋白质。结果与结论:①绝对定量技术筛查出有意义差异 蛋白183种,鉴定出11种显著性差异 蛋白质(P<0.05),其中与正常健康人组相比,急性期神经根型颈椎病组中人类白细胞抗原A、分泌珠蛋白家族1a成员1、蛋白4-羟基苯丙酮酸双加氧酶等3种差异 蛋白显著上调,免疫球蛋白IgG3恒定区、皮肤因子、肌球蛋白轻链3等7种差异 蛋白显著下调;②基因本体富集分析结果表明,这些差异 蛋白参与了抗原结合、免疫球蛋白受体结合等分子功能;③蛋白相互作用网络分析表明,正常健康人群与急性期神经根型颈椎病之间的共同差异 蛋白中HLA-A、HPD、PSMA3、DMKN、SCGB1A1、MYL3等6种位于功能网络节点,且与机体免疫、细胞炎症反应、能量代谢、机械压力等系统关系密切;④采用免疫印迹实验对显著性差异 蛋白HLA-A、HPD、MYL3进行验证,其验证结果与蛋白组学结果相一致;⑤提示通过绝对定量技术联合液相色谱-串联质谱技术发现正常健康人群与急性期神经根型颈椎病患者之间的血清 差异 表达蛋白质,并初步认为HLA-A、HPD、MYL3可能是急性期神经根型颈椎病的特异性血清 标志物,为进一步研究其发病机制提供了新方向。关键词：血清蛋白质 生物标记物 基于血细胞全长转录物组和血清 差异 蛋白质组的厚壳贻贝新型免疫相关蛋白质鉴定 2024年 血清 差异 蛋白质组学手段,开展了厚壳贻贝血淋巴对不同微生物免疫响应的关键分子挖掘。研究结果表明,在不同微生物诱导后的贻贝血清 中,共鉴定到蛋白质44种,其中26种蛋白质表现为在不同微生物胁迫后具有与对照组相比的显著差异 表达(P<0.05),其功能涉及蛋白质折叠保护、细胞自噬与凋亡的调节、活性氧产生、能量代谢调节、细胞解毒功能以及炎症反应调节等。上述蛋白质在不同细菌和真菌胁迫后,其在血细胞中的基因表达量变化趋势存在差异 ,反映出贻贝对不同细菌和真菌诱导具有不同的响应策略。上述研究结果为了解贻贝先天免疫系统在应对不同类别微生物侵袭过程中,其差异 化免疫响应机制,以及贻贝在微生物感染后,特异性标志蛋白质的筛选提供了新的科学依据,也为后续贝类养殖业的健康发展和病害防治提供了思路。关键词：厚壳贻贝 血淋巴 差异蛋白质组 发育性颈椎管狭窄人群血清 差异 蛋白质组学分析 2024年 血清 特异性生物学标志物尚未完全明确。目的:寻找并鉴定气虚血瘀证发育性颈椎管狭窄的潜在生物学标志物。方法:分别采集发育性颈椎管狭窄(气虚血瘀证)人群血清 9例、健康正常人群血清 8例,采用同位素相对标记与绝对定量技术串联质谱标签联合液相色谱-串联质谱筛选2组人群血清 的差异 蛋白及鉴定,使用Western Blot法对肌球蛋白轻链3(MYL3)差异 蛋白进行验证。结果与结论:(1)串联质谱标签技术:共鉴定出61个差异 蛋白(P <0.05),其中与健康正常人群组比,补体成分C1q受体、载脂蛋白A4、C-C基序趋化因子配体18等14种差异 蛋白明显上调,而肌球蛋白轻链3、线粒体翻译延伸因子、核仁磷酸蛋白1等47种差异 蛋白明显下调;(2)基因富集分析:这些差异 蛋白可能参与染色体组织、线粒体膜组织、肌肉系统过程的调节等分子功能;(3)蛋白相互作用网络分析:健康正常人群与发育性颈椎管狭窄(气虚血瘀证)人群之间的共同差异 蛋白中补体C1q受体、载脂蛋白A4、C-C基序趋化因子配体18、肌球蛋白轻链3、线粒体翻译延伸因子、核仁磷酸蛋白1等38种位于功能网络节点,且与颈椎骨能量代谢、骨细胞产生、破骨细胞的形成等系统关系密切;(4)运用Western Blot法对主要差异 蛋白肌球蛋白轻链3进行验证:其验证结果与蛋白组学结果相一致;(5)结论:通过绝对定量技术联合液相色谱-串联质谱技术发现健康正常人群与发育性颈椎管狭窄(气虚血瘀证)人群之间的血清 差异 表达蛋白,并初步推测肌球蛋白轻链3可能是发育性颈椎管狭窄(气虚血瘀证)人群的特异性血清 标志物。关键词：发育性颈椎管狭窄 气虚血瘀证 血清蛋白标志物 蛋白组学 基于非标记定量蛋白质组学技术鉴定精神分裂症患者血清 差异 表达蛋白 2024年 血清 中表达差异 的蛋白质,以探讨精神分裂症致病机制。方法收集13例精神分裂症患者和6例健康志愿者(对照组)血清 样本,采用非标记蛋白质组学技术联合液相色谱-质谱分析技术鉴定两组的差异 蛋白,筛选出表达差异 显著的蛋白质,并进行基因本体和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果非标记蛋白质组学结果显示精神分裂症患者血清 中共筛选出126个显著性差异 的蛋白,其中63个上调蛋白,63个下调蛋白。这些差异 蛋白主要富集在血液微粒、细胞质囊腔、囊腔、分泌颗粒管腔等细胞组分,分子功能主要表现在肽酶调节活性,主要参与蛋白激活级联、体液免疫应答、血小板脱粒、补体激活、蛋白修饰、急性炎症反应等生物学过程。精神分裂症主要富集的KEGG通路包括补体和凝血级联反应、冠状病毒和全身性红斑狼疮。结论精神分裂症患者血清 中差异 蛋白主要富集在补体和凝血级联反应通路,揭示该通路在精神分裂症发病过程中发挥重要作用。关键词：蛋白质组学 差异蛋白 生物信息学 精神分裂症
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