何苗
作品数： 55被引量：155H指数：7
  • 所属机构:中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
  • 所在地区:四川省 成都市
  • 研究方向:医药卫生
  • 发文基金:南京市医学科技发展项目

相关作者

高瞻
作品数：26被引量：58H指数：4
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
研究主题：献血者 宏基因组学 高通量测序 献血人群 无偿献血
刘鱼
作品数：62被引量：205H指数：9
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
研究主题：献血者 血小板 无偿献血者 HIV 核酸检测
王憬惺
作品数：93被引量：402H指数：11
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
研究主题：献血者 HIV HBV 乙型肝炎病毒 献血人群
曾沛斌
作品数：27被引量：68H指数：5
供职机构：四川大学华西公共卫生学院
研究主题：献血人群 献血者 乙型肝炎病毒 亚型分布 原体
李武平
作品数：21被引量：27H指数：2
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院病原生物学研究所
研究主题：人细小病毒B19 献血人群 血液制品 呼吸道上皮 纤维化
作品列表
中国5个血液中心献血者抗-HIV蛋白印迹确证试验阳性率和人口地理学特征
高瞻王憬惺山华何苗曾沛斌刘鱼廖红文马红丽张洪斌文秀琼李聚林
血液中检测人巨细胞病毒的荧光定量PCR方法建立及评估被引量：4
2015年
目的建立2种实时荧光定量PCR方法,用于在血液样本中检测有可能威胁血液安全的人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)。方法根据Gen Bank中HCMV的MIE基因保守序列的分析结果,分别建立基于SYBR Green和Taq Man探针的2种实时定量PCR检测方法,同时用这2种方法对来自血液制品厂的血浆进行检测。结果基于SYBR Green的实时定量PCR检测方法,得到的熔解曲线峰单一,建立的2种实时定量PCR方法对于HCMV的DNA具有高度特异性和灵敏度,检测下限均为50 copies/m L,并且具有较好的批间和批内重复性。结论应用本研究建立的实时荧光定量PCR方法对献浆人群血浆样品进行HCMV检测,2种方法检测结果一致,证明该方法可用于在血液样本中检测HCMV。
李佳凌巫岳龙邹礼乐蔡延森何苗
关键词：人巨细胞病毒血液安全
健康人血液微生物宏基因组和噬菌体组的深度挖掘分析
2024年
目的探索健康人血液中微生物和噬菌体的存在及其可能的相互作用,通过生物信息学深度挖掘探讨血液微生物生态系统的结构和功能。方法收集2012—2018年绵阳市中心血站的1600份献血者血浆标本,通过DNA提取和文库构建,使用Illumina Hiseq 4500平台进行高通量测序后进行生物信息学深度挖掘。采用Bowtie2、Trimmomatic及Kraken等宏基因组分析软件对血液标本中的微生物丰度进行分析;随后进一步使用Megahit、geNomad、CheckV和eggNOG-mapper等软件进行噬菌体组分析,包括序列质控、组装、识别、聚类和功能注释,并通过使用iTOL、BLAST和PhaBOX等软件对发现的血液噬菌体构建系统发育树、物种注释分析以及宿主分析与预测。结果宏基因组测序结果从血浆标本中识别出36个菌门、151个菌目、338个菌科、338个菌属和3757个菌种的微生物。在种的分类水平上,丰度排名前11的菌种分别是炭疽芽孢杆菌(Bacillus cereus)、鼠杆菌属乳杆菌(Lactobacillus murinus)、约翰逊乳杆菌(L.johnsonii)、普劳兹氏梭杆菌(Faecalibacterium prausnitzii)、苏云金芽孢杆菌(B.thuringiensis)、路氏乳杆菌(L.reuteri)、痤疮丙酸杆菌(Cutibacterium acnes)、海迪茨氏菌(Dietzia sp.JS16-p6b)、猪鼻炎支原体(Mycoplasma hyorhinis)、猪肺炎支原体(M.hyopneumoniae)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。通过噬菌体组分析鉴定了202个噬菌体操作分类单元(vOTU),物种注释揭示了24种噬菌体类型,通过病毒宿主数据库与宿主分析,完成15个潜在的噬菌体宿主的比对,包括嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)、湖红胞菌(Rhodoferax lacus)、海洋拟变形菌(Pseudoalteromonas marina)、Thalassotalea loyana、海藻糖弧菌(Vibrio alginolyticus)、塔斯马尼亚弧菌(V.tasmaniensis)、溶血弧菌(V.vulnificus)、假单胞菌(Pseudomonas sp.)、农杆菌(Agrobacterium sp.ST15.13/040)、鸡肠球菌(Enterococcus gallinarum)、黄杆菌�
朱林王琪琪徐玉莲黄杨高瞻何苗
关键词：宏基因组
5个血液中心抗-HCV血液筛查的假阳性率调查研究
＜正＞目的虽然目前我国的血液中心对HCV的血液筛查都是采取的2轮酶联免疫法检测,但ELISA检测抗-HCV存在着大量的假阳性结果,而且抗-HCV的确证实验在我国的采供血系统并未常规开展,因此导致血液中心对这些献血者永久屏...
何苗高瞻王憬惺毛伟吕运来毕新红曹汝安许建荣刘静山华
文献传递
血液制品原料混合血浆中微生物组筛查及病原体鉴定被引量：1
2012年
血液和血液制品常作为药物来拯救生命,但除了血液常规筛查的4种病原体HIV、HBV、HCV和梅毒外,在合格血浆里,仍可能有大量的病原体威胁血液安全,并可能通过输血传播疾病。然而,目前我国采供血系统和血液制品生产厂家并没有开展这些未检测病原体的调查。因此,本研究通过随机引物扩增的方法,测序获得血液制品多人份混合原料血浆中的微生物组,并通过GenBank同源性比对鉴定出微生物组中的病原体类型,从而评估我国血液制品原料混合血浆的安全现状。将来自贵州地区的12ml血液制品原料混合血浆(8000人份混合),通过0.45μm和0.22μm的滤膜过滤,然后40000r/min,超速离心90min。
何苗周涯李武平
关键词：混合血浆血液制品输血传播疾病血液安全超速离心
重庆地区健康献血人群血液宏基因组分析与新发病原体鉴定被引量：7
2016年
目的了解重庆地区健康无偿献血人群的微生物组,并调查可能存在的新发/再发病原体的流行情况,本研究利用深度测序的方法对重庆地区5 000人份健康无偿献血者标本进行了宏基因组学分析,以鉴定其中的新发/再发病原体。方法提取5 000人份血浆核酸总DNA,经随机引物扩增后,建库上机深度测序,用本课题组开发的Kraken Py软件分析宏基因组数据,并确定其中的微生物组,鉴定可能存在的新发/再发病原体。结果通过深度测序将获得的1.23 Gb的数据,其中包括2 146 844个有效读长,去人类DNA背景后,结果显示属于细菌的片段47条,属于病毒的片段21条,属于寄生虫的片段333条。最主要的病原体是刚地弓形虫(Toxoplasma gondii),其次是欧猥迭宫绦虫(Spirometra erinaceieuropaei),仅发现少量指环病毒科(Anelloviridae)的病毒成员如扭转病毒Torque teno virus等。另外,我们还发现在欧美发达国家已经被认为是能够造成输血安全威胁的病原体DNA片段,如疟原虫(Plasmodium spp.),婴儿利什曼原虫(Leishmania infantum)等。结论本研究结果显示了重庆地区健康无偿献血人群的微生物组结构,同时也揭示了这些健康献血者有可能携带的新发/再发病原体,提醒采供血系统工作者应结合当地新发传染病流行情况,合理的制定疫区或是传染病流行季节的筛查模式和献血者招募策略。另外,对于这些潜在风险也不必过于惊慌,因为这仅是微生物基因组片段结果,不代表该病原体仍具有感染性。
徐敏毛伟何涛卫昱燕高瞻张玉张春红廖红梅刘鱼曾沛斌王憬惺何苗
关键词：献血人群宏基因组学血液安全
基于高通量测序和培养组学的血小板中细菌检测方法的建立被引量：3
2020年
目的建立1种基于高通量测序培养组学的细菌检测体系,以此来提高血小板中细菌的检出率。方法利用微生物高通量培养组细菌检测体系,配置培养组中的8种液体培养基,即血培养瓶(37℃)、含5 mL羊血的血培养瓶(37℃)、100 mL海生菌肉汤(37℃)、含瘤胃液和羊血各5 mL的血培养瓶(37℃)、100 mL胰蛋白大豆肉汤(37℃)、100 mL5%羊血肉汤(28、37℃)、含5 mL胃液血培养瓶(37℃)和替代传统的1种培养基-血培养瓶(37℃),取血小板标本9份(5 mL/份)做预培养:在恒温有氧条件下的液体培养基中培养60 d,将液体培养基中的培养液9份,在培养24 h后第1次用无菌注射器吸取100μL菌到血琼脂平板上,并用涂布棒涂布均匀;此后每2—3 d重复同样操作1次。血琼脂平板与预培养在温度相同的条件下培养1—2 d,用挑菌环挑取血平板上的单个菌株,用DNA Blood Mini Kit提取DNA后,采用通用引物27F/1429R扩增该细菌的16S rRNA基因片段并采用Sanger测序鉴定菌种,同时将各血小板标本混匀后分别取40 mL以96800 g离心4 h,弃上清;采用DNA Blood Mini Kit提取沉淀总DNA,构建DNA文库后在Illumina Illumina HiSeq 4500上深度测序,所得数据用自有分析软件KrakenPy 1.0分析其中的微生物组并鉴定细菌种类。将宏基因组高通量测序方法得到的结果和培养组的结果相互验证,确认致血小板污染的细菌种类。结果经过细菌培养组培养后分离单个菌落,用Sanger测序鉴定出的细菌有:赖氨酸芽孢杆菌(Lysinibacillus sp.)、芽孢杆菌(Bacillus sp.)、郭霍氏芽孢杆菌(B.kochii)、蜡样芽孢杆菌(B.cereus)、类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)、黄原胶降解菌(P.lautus)、葡萄球菌(Staphylococcus sp.)、马葡萄球菌(S.equorum)、红球菌(Rhodococcus sp.)。宏基因组测序产出Raw data共72.22 G,显示丰度较高的主要为厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria),其中鉴定出细菌种类最�
王少礼高瞻黄梅黄梅何苗
关键词：血小板细菌检测宏基因组学
一种自主研发的胶体金试纸条对体外梅毒筛查的评价
目的通过原核表达载体获得高产量的梅毒螺旋体脂蛋白TP17和TP47,利用获得的重组蛋白组装胶体金检测试纸条,评价该试纸条对5种不同血液中心来源的血液样本中梅毒的检出效果,并通过TPPA方法进行验证。方法人工合成梅毒螺旋体...
边国慧杨春晖何苗
文献传递
重庆地区健康献血人群弓形虫抗体检测结果分析被引量：3
2017年
目的了解重庆地区健康献血人群弓形虫(TOX)感染现状。方法随机采集重庆市血液中心2015年3-8月半年间该地区的健康献血人群血清样本1001(人)份,采用ELISA法检测单份血清标本的TOX抗体,对比分析不同性别、年龄、职业及受教育程度献血者TOX阳性率。结果本组重庆健康献血人群TOX抗体阳性率8.49%(85/1 001)。其中检出TOX-IgG抗体阳性78例,阳性率7.80%(78/1 001);TOX-IgM抗体阳性7例,阳性率为0.7%(7/1001)。不同职业以及受教育程度间的献血人群中TOX阳性率有统计学差异(p<0.05)。结论重庆地区健康献血人群中存在一定的TOX感染率;应加强对献血者弓形虫感染的监测,对免疫缺陷等特殊受血者宜开展相应项目的血液筛查,以降低弓形虫感染可能引起的输血风险。
徐敏毛伟何涛张春红卫昱燕高瞻张玉何苗
关键词：弓形虫献血者IGG抗体IGM抗体免疫缺陷
2000～2010年间中国4个血液中心的献血者中输血传播感染的流行研究被引量：1
2012年
目的在中国,HBV和HCV呈高发流行、近年来梅毒也呈高速增长的流行趋势、HIV也由高危人群向普通人群蔓延的趋势,这些都对血液安全构成了威胁,该项研究是为了调查输血传播病原体标志物在中国4个血液中心的献血人群中的流行情况。方法我们调查了2000年1月～2010年12月间中国4个血液中心全血的采集量,使用2遍酶免的方法检测了输血可传播感染(TTIs)病原体(HIV、HBV、HCV和梅毒)的标志物,计算了TTIs的血清学标志物的流行率,并进行了相关的统计学分析以阐明TTIs相关的血清学流行特征。结果在4,366,283全血捐献标本中,60%为初次献血,40%是重复献血。
李武平李长清肖小璞何苗李建平戴宇东付涌水葛健明杨永林栾燕林昌周赵宏祥
关键词：血清学标志物流行率初次献血献血人群采集量输血传播
加载更多 ∨