中央级科研院所社会公益研究专项资金(2005DIB4J038)
- 作品数：3 被引量：53H指数：3
- 相关作者：石鹏君周志刚姚斌刘玉春何夙旭更多>>
- 相关机构：中国农业科学院饲料研究所中国农业科学院生物技术研究所华中农业大学更多>>
- 发文基金：中央级科研院所社会公益研究专项资金国际科技合作重点项目计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究被引量：28
- 2007年
- 采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%～96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。
- 石鹏君柏映国袁铁铮姚斌范云六周志刚孟昆伍宁丰刁其玉
- 关键词：DGGERDNA基因瘤胃细菌
- 网箱养殖青石斑鱼Epinephelus awoara鳃及体表粘附菌群的PCR-DGGE比较分析被引量：18
- 2008年
- 采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)对海水网箱养殖青石斑鱼Epinephelus awoara鳃和体表粘附菌群结构进行了比较分析。结果表明青石斑鱼鳃粘附菌群结构相对简单,存在绝对优势种群,体表粘附菌群结构较为复杂,无绝对优势种群,聚类分析表明青石斑鱼鳃与体表粘附菌群结构存在较大差异性(相似度52%),而个体间鳃或体表的粘附菌群结构相似性较好。测序结果表明青石斑鱼鳃与体表粘附菌群以未培养菌为主,鳃的绝对优势菌为Pantoeasp.,体表相对优势菌为Meio-thermussp.、UnculturedAcinetobactersp.、Wautersiella falsenii与未培养菌,提示在生产实践中采用复合菌制剂似乎更为可行。PCR-DGGE技术能区别青石斑鱼鳃与体表粘附菌群的多样性,在可定植益生菌筛选上具指导意义。
- 刘玉春周志刚石鹏君何夙旭姚斌韩少锋
- 关键词：青石斑鱼DGGE指纹图谱
- 南海底层鱼突额鹦嘴鱼Scarus ovifrons Temminck et Schlegel,1846肠道产酶微生物研究被引量：9
- 2007年
- 通过不同培养基对南海底层鱼突额鹦嘴鱼Scarus ovifrons Temminck et Schlegel,1846肠道微生物进行分离与16S、18S rDNA鉴定,并构建系统发育树,然后结合选择性培养基进行产蛋白酶、甘露聚糖酶、木聚糖酶、纤维素酶、淀粉酶等微生物的筛选。结果表明,从突额鹦嘴鱼肠道分离纯化出23株微生物,其中14株产酶,以产蛋白酶与淀粉酶为主,部分产纤维素酶、甘露聚糖酶、木聚糖酶;产酶微生物主要为Bacillussp.;分离出3株菌(H-16、J-13与Y-13G)其16S、18S rDNA序列与模式种相似度低于97%,为潜在的新种。研究表明,南海底层鱼突额鹦嘴鱼肠道含有大量产酶微生物。
- 黄光祥周志刚何夙旭邵娜石鹏君刘玉春姚斌
- 关键词：TEMMINCKETSCHLEGEL肠道
