国家自然科学基金(30270002)
- 作品数：3 被引量：22H指数：2
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- 相关机构：河北大学河北师范大学更多>>
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- 相关领域：生物学更多>>
- 新的系统发育标记及其应用被引量：17
- 2003年
- 系统发育标记是阐明个体间遗传关系的基因片段 ,为了区别遗传关系接近的分类单元 ,有许多新的系统发育标记被应用 ,配合其它分类手段的使用 ,为多相分类的研究注入了新的活力。
- 石楠张利平
- 关键词：RNASEPRNA基因GYRBGAP
- 链孢囊菌属3种分子分类方法的对比被引量：2
- 2009年
- 链孢囊菌属(Streptosporangium)是链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)的模式属,包含13个种.种的鉴别通常是多相分类方法,其中尤以DNA同源性分析为国际公认的定种标准;全基因组杂交同源性在70%以下的为不同种.但在进行大量菌株的比对时操作比较复杂.本实验以链孢囊菌属15株标准菌株为实验菌株,选择适宜引物,对其基因组DNA的16S-23SrDNA间隔区序列(ITS)和REP序列进行了扩增,分别获得了两种基因指纹图谱,并通过UPGMA聚类法构建了相应的进化距离树图.结果表明,对于链孢囊菌属中不同种的区分,两种基因图谱技术的分辨力相当,且两种方法呈现的菌株间同源性与DNA-DNA杂交的结果吻合,有望为链孢囊菌属分类学的研究提供简单、准确、快速的标准程序.
- 张利平石楠张晓吕志堂杨润蕾张秀敏
- 关键词：16S-23SREP-PCR
- 基于16S-23S rDNA间隔区序列(ITS)、REP序列的基因指纹图谱及UPGMA聚类法的拟诺卡菌属分类方法被引量：3
- 2011年
- 拟诺卡菌属(Nocardiopsis)是拟诺卡菌科(Nocardiopsaceae)的唯一属.该属内进行物种鉴别时通常是在多相分类方法基础上,以全基因组杂交同源性在70%以下的为不同物种,此为国际公认的定种标准;但在进行大量菌株的比对时操作比较复杂,于是多种基于DNA的基因图谱技术发展起来.本实验利用适宜引物,对拟诺卡菌属15株基准株基因组DNA的16S-23S rDNA间隔区序列(ITS)和REP序列进行了扩增,获得了两种基因指纹图谱,同时根据UPGMA聚类法构建了相应的进化距离树图.结果表明,对于拟诺卡菌属中不同物种的区分,两种基因图谱技术的分辨力相当,均可以较好的呈现物种间差异,可以作为拟诺卡菌属菌株多相分类的组成部分,应用于物种水平的分类与鉴定.
- 石楠张利平张晓
- 关键词：REP-PCR16S-23S
