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国家自然科学基金(30570795)

作品数:17 被引量:128H指数:6
相关作者:杨拴盈南岩东卜丽娜尚文丽霍树芬更多>>
相关机构:西安交通大学医学院第二附属医院浙江大学医学院附属第二医院西安交通大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”西安市科技计划项目更多>>
相关领域:医药卫生生物学理学更多>>

文献类型

  • 16篇中文期刊文章

领域

  • 15篇医药卫生
  • 1篇生物学
  • 1篇理学

主题

  • 8篇蛋白
  • 8篇肺癌
  • 5篇蛋白质
  • 5篇白质
  • 5篇META分析
  • 4篇蛋白质组
  • 4篇蛋白质组学
  • 4篇细胞
  • 3篇血清
  • 3篇质谱
  • 3篇肿瘤
  • 3篇腺癌
  • 3篇激光
  • 3篇标志蛋白
  • 2篇电离
  • 2篇电泳
  • 2篇血清蛋白
  • 2篇支气管
  • 2篇气管
  • 2篇肿瘤标志

机构

  • 14篇西安交通大学...
  • 2篇西安交通大学
  • 2篇浙江大学医学...
  • 1篇西安高新医院
  • 1篇宝鸡市中心医...

作者

  • 14篇杨拴盈
  • 8篇南岩东
  • 7篇卜丽娜
  • 6篇霍树芬
  • 6篇田应选
  • 6篇尚文丽
  • 5篇杜洁
  • 4篇张薇
  • 4篇林秀丽
  • 3篇刘延峰
  • 3篇刘晓丽
  • 3篇张潍
  • 2篇杨渭临
  • 2篇余捷凯
  • 2篇阮禹松
  • 2篇周丹菲
  • 2篇周斌
  • 2篇蒋梅花
  • 2篇李维
  • 2篇郑树

传媒

  • 6篇西安交通大学...
  • 3篇国际呼吸杂志
  • 2篇中华医学杂志
  • 2篇Chines...
  • 1篇中华结核和呼...
  • 1篇四川大学学报...
  • 1篇中华肺部疾病...

年份

  • 5篇2011
  • 3篇2010
  • 3篇2009
  • 2篇2008
  • 1篇2007
  • 2篇2006
17 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
Detection of lung adenocarcinoma using magnetic beads based matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry serum protein profiling被引量:13
2010年
Background Recently, due to the rapid development of proteomic techniques, great advance has been made in many scientific fields. We aimed to use magnetic beads (liquid chip) based matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) technology to screen distinctive biomarkers for lung adenocarcinoma (adCA), and to establish the diagnostic protein profiles. Methods Using weak cation exchange magnetic beads (MB-WCX) to isolate and purify low molecular weight proteins from sera of 35 lung adCA, 46 benign lung diseases (BLDs) and 44 healthy individuals. The resulting spectra gained by anchor chip-MALDI-TOF-MS were analyzed by ClinProTools and a pattern recognition genetic algorithm (GA). Results In the working mass range of 800-10 000 Da, 99 distinctive peaks were resolved in lung adCA versus BLDs, while 101 peaks were resolved in lung adCA versus healthy persons. The profile gained by GA that could distinguish adCA from BLDs was comprised of 4053.88, 4209.57 and 3883.33 Da with sensitivity of 80%, specificity of 93%, while that could separate adCA from healthy control was comprised of 2951.83 Da and 4209.73 Da with sensitivity of 94%, specificity of 95%. The sensitivity provided by carcinoembryonic antigen (CEA) in this experiment was significantly lower than our discriminatory profiles (P 〈0.005). We further identified a eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit (eRF3b) (4209 Da) and a complement C3f (1865 Da) that may serve as candidate biomarkers for lung adCA. Conclusion Magnetic beads based MALDI-TOF-MS technology can rapidly and effectively screen distinctive proteins/polypeptides from sera of lung adCA patients and controls, which has potential value for establishing a new diagnostic method for lung adCA.
LIN Xiu-liYANG Shuan-yingDU JieTIAN Ying-xuanBU Li-naHUO Shu-fenWANG Feng-pengNAN Yan-dong
关键词:SERUMPROTEOMICS
Study of differential proteins in lung adenocarcinoma using laser capture microdissection combined with liquid chip-mass spectrometry technology
2010年
Background In recent years the proportion of lung adenocarcinoma (adCA) which occurs in lung cancer patients has increased. Using laser capture microdissection (LCM) combined with liquid chip-mass spectrometry technology, we aimed to screen lung cancer biomarkers by studying the proteins in the tissues of adCA. Methods We used LCM and magnetic bead based weak cation exchange (MB-WCX) to separate and purify the homogeneous adCA cells and normal cells from six cases of fresh adCA and matched normal lung tissues. The proteins were analyzed and identified by matrix assisted laser desorption/ionization time-of-fight mass spectrometry (MALDI-OF-MS). We screened for the best pattern using a radial basic function neural network algorithm. Results About 2.895x10s and 1.584x10s cells were satisfactorily obtained by LCM from six cases of fresh lung adCA and matched normal lung tissues, respectively. The homogeneities of cell population were estimated to be over 95% as determined by microscopic visualization. Comparing the differentially expressed proteins between the lung adCA and the matched normal lung group, 221 and 239 protein peaks, respectively, were found in the mass-to-charge ration (M/Z) between 800 Da and 10 000 Da. According to ttest, the expression of two protein peaks at 7521.5 M/Zand 5079.3 M/Z had the largest difference between tissues. They were more weakly expressed in the lung adCA compared to the matched normal group. The two protein peaks could accurately separate the lung adCA from the matched normal lung group by the sample distribution chart. A discriminatory pattern which can separate the lung adCA from the matched normal lung tissue consisting of three proteins at 3358.1 M/Z, 5079.3 M/Z and 7521.5 M/Z was established by a radial basic function neural network algorithm with a sensitivity of 100% and a specificity of 100%. Conclusions Differential proteins in lung adCA were screened using LCM combined with liquid chip-mass spectrometry technology, and a biomarker model was establis
BU Li-naYANG Shuan-yingLI Feng-taoSHANG Wen-liZHANG WeiHUO Shu-fenNAN Yan-dongTIAN Ying-xuanDU JieLIN Xiu-liLIU Yan-fengLIN Yu-rongRONG Biao-xue
血清蛋白质组学技术及其在肿瘤标志物研究中的应用进展
2008年
血清蛋白质组学从新的角度研究肿瘤,寻找肿瘤标志蛋白,进而阐明其表达水平的变化及其与肿瘤发生、发展的相互关系,对肿瘤的早期诊断、治疗、药物研发等方面具有重要意义。本文就血清蛋白质组学的相关技术、策略及其在筛选血清肿瘤标志物方面的应用进展作一综述。
杜洁杨拴盈卜丽娜
关键词:血清蛋白质组学肿瘤标志物
肺癌蛋白质组学研究的现状与进展被引量:5
2006年
蛋白质组学是继人类基因组计划之后,生命科学领域又一研究热点,在肿瘤基础和临床应用研究中蓬勃开展。本文就蛋白质学及其相关方法在肺癌研究中进展及现状进行综述。
杨拴盈南岩东温雪萍
关键词:肺癌蛋白质组学
X线胸片对高危人群肺癌筛查价值的系统评价被引量:9
2011年
目的应用Meta分析法综合评价X线胸片在肺癌筛查中的价值。方法在PubMed、Cochrane、ISIWebofKnowledge等数据库检索1996年至2011年期间的相关文献资料;根据纳入标准筛选符合条件的文献;对文献进行信息统计、科学性评估及质量分级;采用随机效应模型进行数据分析;通过似然比、汇总灵敏度和特异度及汇总受试者工作特征曲线(SROC曲线)等统计指标综合评价X线胸片在肺癌筛查中的价值。结果共纳入9篇文献,其中英文6篇,中文3篇,由8个独立研究构成,研究对象94490例。异质性检验提示无阈值效应,但存在其他原因导致的异质性,按随机效应模型进行Meta分析得出X线胸片在肺癌筛查中价值的汇总阳性似然比为9.13,汇总阴性似然比为0.72,汇总灵敏度为0.250(0.219~0.282),汇总特异度为0.932(0.930~0.933),SROC曲线下面积为0.8536。结论X线胸片对肺癌具有一定的诊断价值,但其敏感度为25%,不适用于筛查。
蒋梅花杨拴盈周丹菲李维刘晓丽戎彪学尚文丽
关键词:X线胸片肺癌META分析
低剂量螺旋CT对高危人群肺癌筛查价值的Meta分析被引量:60
2011年
目的应用Meta分析法综合评价低剂量螺旋CT(low-dose spiral computed tomography,LDCT)在肺癌筛查中的价值。方法在PubMed、Cochrane等数据库检索1996年至2010年期间的相关文献资料;根据纳入标准筛选符合条件的文献;对文献进行信息统计、科学性评估及质量分级;采用随机效应模型进行数据分析;通过似然比(likelihoodratio,LR)、加权灵敏度和特异度(pooled sensitivity and specificity)及汇总受试者工作特征曲线(summary receiveroperator characteristic curve,SROC曲线)等统计指标综合评价LDCT在肺癌筛查中的价值。结果共纳入12篇英文文献,由9个独立研究构成,研究对象28 024例。文献质量评估结果提示纳入文献质量较好;LDCT在肺癌筛查中价值的合并阳性似然比(+LR)为3.35,阴性似然比(-LR)为0.29,加权灵敏度为0.735(0.730~0.740),特异度为0.791(0.747~0.830),SROC曲线下面积(area under curve,AUC)为0.847 3。结论多数独立研究单位报道的LDCT在早期肺癌筛查中的价值评价一致。通过汇总相关研究结果显示,LDCT在早期肺癌筛查中具有较高的价值,但仍需要高质量的随机对照研究以更准确地评价其临床价值。
尚文丽张和平杨拴盈张薇霍淑芬刘延峰
关键词:低剂量螺旋CT早期肺癌META分析
ELISA法检测血清胃泌素释放前体肽诊断小细胞肺癌的系统评价被引量:2
2010年
目的评价酶联免疫吸附(ELISA)法检测血清胃泌素释放前体肽(Pro-GRP)诊断小细胞肺癌(SCLC)的价值。方法检索PubMed、Cochrane、ISI Web of Knowledge等数据库,检索时间为1990~2009年发表的文献,收集关于ELISA法检测血清Pro-GRP诊断SCLC的相关文献并进行信息统计、科学性评估及质量分级;采用Meta-Disc1.4软件进行数据分析;通过汇总敏感度、特异度、汇总似然比及汇总受试者工作特征曲线(SROC曲线)等统计指标综合评价ELISA法检测血清Pro-GRP对SCLC的早期诊断价值。结果共纳入11篇文献,其中英文文献6篇,中文文献5篇,样本量为3 554例,其中经病理学确诊的SCLC为1 122例,NSCLC为2 432例。异质性检验显示纳入研究齐性好,通过确定模型的汇总计算得出汇总敏感度为0.75(0.73,0.78),汇总特异度为0.93(0.92,0.94),汇总阳性似然比11.44,汇总阴性似然比0.27,SROC曲线下面积为0.93。结论 Pro-GRP在早期诊断SCLC中具有一定的参考价值,可作为较重要的参考指标之一。
杨渭临张薇章琳刘晓丽杨拴盈
关键词:肿瘤标志物小细胞肺癌ELISA法META分析
应用液体芯片-质谱技术筛选肺鳞癌患者血清标志蛋白被引量:7
2009年
目的探讨液体芯片.质谱技术(CLINPROT系统)在肺鳞癌患者血清标志蛋白筛选中的应用。方法应用CLINPROT系统检测34例肺鳞癌患者(肺鳞癌组)、46例良性肺疾病患者(良性对照组)及44名正常人(正常对照组)的血清蛋白表达谱,应用FlexAnalysis3.0软件进行数据分析,筛选差异表达蛋白质;采用液相色谱串联质谱(LC—MS/MS)技术鉴定标志蛋白。结果分别比较肺鳞癌组与正常对照组以及肺鳞癌组与良性对照组血清蛋白表达谱,在质荷比(M/Z)800—10000范围内,前者筛选出96个差异表达蛋白峰,其中M/Z为4054.13和4267.46的蛋白峰在2组间差异最大,用这2种差异蛋白建立的坐标系具有良好的区分肺鳞癌与正常人的能力;后者筛选出99个差异表达蛋白峰,其中M/Z为5065.27和4054.02的蛋白峰在2组间差异最大,用这2种差异蛋白建立的坐标系具有良好的区分肺鳞癌与良性肺疾病的能力。取M/Z为1778和1865的蛋白行LC-MS/MS鉴定,结果提示二者可能均为补体C3片段或C3前体。结论肺鳞癌患者与正常人以及与良性肺疾病患者之间血清蛋白表达谱存在明显差异,应用液体芯片-质谱技术可能从血清中筛选出敏感性高、特异性强的肺鳞癌标志蛋白。
卜丽娜杨拴盈杜洁南岩东林秀丽郑华东霍树芬尚文丽刘延峰
关键词:芯片分析技术质谱分析法
小细胞肺癌及其配对的正常肺组织差异表达蛋白质的双相电泳-飞行时间质谱研究被引量:3
2006年
目的应用比较蛋白质组学方法分析小细胞肺癌(SCLC)与其配对的正常肺组织差异表达蛋白质,为阐明SCLC发病机制、筛选其早期诊断标志物提供有益的思路。方法应用双相电泳(2-DE)分离6例SCLC及其配对的正常肺组织可溶性总蛋白;应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱(PMF);通过Mascot软件查询NCBI或SWISS-PROT数据库鉴定蛋白质。结果每张图谱约检测到800多个蛋白质点。经匹配分析,肺癌组织之间和正常肺组织之间凝胶图像的匹配率分别为75.5%和78.2%;选择14个背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析,结合表观分子量及等电点(pI),初步鉴定了11种(六类)蛋白质:①与蛋白质降解通路有关的蛋白质:蛋白酶体α亚单位3型、蛋白酶体β亚单位2型及β亚单位5型;②自由基/抗氧化剂类:锰-超氧化物歧化酶(Mn-SOD)、过氧化氢酶(CAT)和黄素还原酶(FR);③细胞骨架类:原肌球蛋白-3(Tpm-3);④与能量代谢有关的蛋白质:硫氧还蛋白过氧化物酶(TPX1);⑤分子伴侣:抑制素(PHB),内质网蛋白ER29(Erp29);⑥其他:可溶性NSF黏附蛋白(alpha SNAP)。结论应用2-DE及MALDI-TOF-MS方法分离并初步鉴定了11种(六类)蛋白质;这些蛋白质与SCLC发生发展密切相关,部分可能成为SCLC诊断及治疗的分子靶点。
杨拴盈张王刚张潍周斌田应选南岩东卜丽娜阮禹松孙秀珍杨德昌
关键词:小细胞肺癌双相电泳基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱肽质量指纹图谱
痰细胞学液基薄层检测技术对肺癌诊断价值的Meta分析被引量:7
2011年
目的应用Meta分析法综合评价痰细胞学液基薄层检测技术对支气管肺癌的诊断价值。方法检索PubMed、Cochrane、ISI Web of Knowledge等数据库,检索时间为1990年1月至2011年2月发表的相关文献,收集关于痰细胞学液基薄层检测技术诊断支气管肺癌的相关研究文献并进行信息统计、科学性评估及质量分级;采用Meta-Disc1.4软件固定效应模型进行数据分析;通过汇总敏感度、特异度、汇总似然比及汇总受试者工作特征曲线(SROC曲线)等统计指标综合评价痰细胞学液基薄层检测技术对支气管肺癌的诊断价值。结果共纳入8篇文献,其中英文2篇,中文6篇,样本量为2584例,其中经组织病理学确诊或明确临床诊断的支气管肺癌共1719例,865例非肺部恶性肿瘤患者为对照。异质性检验显示纳入研究齐性好,通过固定模型的汇总计算得出汇总灵敏度为0.44(95%CI0.42,0.46),汇总特异度为1.00(95%CI0.99,1.00),汇总阳性似然比为72.54(95%CI31.66,166.17),汇总阴性似然比为0.50(95%CI0.47,0.53),SROC曲线下面积为0.9736。结论汇总相关研究结果表明:痰细胞学液基薄层检测技术在支气管肺癌的诊断中特异度达到0.99~1.00,但灵敏度仅为0.44,尚不适用于支气管肺癌的筛查。但是本研究纳入文献有限,需要更多高质量、大样本、多中心的研究加以验证。
周丹菲杨拴盈蒋梅花李维刘晓丽戎彪学张薇
关键词:支气管肺癌痰细胞学液基薄层META分析
共2页<12>
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