温州市科技计划项目(Y20100011)
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 相关作者:许刚秦婷婷季丽丽陶志华更多>>
- 相关机构:浙江大学医学院附属第二医院温州医学院温州医学院附属第一医院更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金温州市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 雄激素非依赖性前列腺癌细胞株BCL2和GRB10基因启动子区甲基化研究被引量:1
- 2013年
- 目的探讨基因甲基化在雄激素非依赖性前列腺癌(androgen-independent prostate cancer,AIPC)转化过程中可能的作用。方法采用重亚硫酸盐测序PCR(bisulfite genomic sequencing PCR,BSP)联合TA克隆测序检测雄激素依赖性前列腺癌(androgen-dependent prostate cancer,ADPC)细胞株LNCaP和雄激素非依赖性前列腺癌细胞株LNCaP-AI(androgen independent)中生长因子受体结合蛋白10(growth factor receptor-bound protein 10,GRB10)和B细胞性淋巴瘤/白血病-2基因(B-cell lymphoma/leukaemia-2 gene,BCL2)的甲基化状态。结果 GRB10基因在LNCaP-AI细胞和LNCaP细胞中的甲基化率分别为9.6%、7.4%;BCL2基因在LNCaP-AI细胞和LNCaP细胞中的甲基化率分别为14.7%、25.3%,这两个基因在LNCaP细胞和LNCaP-AI细胞的甲基化率差异无统计学意义(P>0.05)。结论 GRB10和BCL2基因的异常表达与基因甲基化无明显相关,而二者是否参与到前列腺癌激素非依赖性到转化过程以及具体机制有待进一步研究。
- 许刚秦婷婷
- 关键词:雄激素非依赖性前列腺癌TA克隆
- 雄激素非依赖性前列腺癌细胞中差异甲基化基因的初步筛选被引量:2
- 2013年
- 应用全基因组DNA甲基化芯片(Illumina Infinium HumanMethylation27 BeadChip)杂交技术以及转录组RNA测序技术,检测了雄激素依赖性前列腺癌(androgen-dependent prostate cancer,ADPC)细胞株LNCaP和雄激素非依赖性前列腺癌(androgen-independent prostate cancer,AIPC)细胞株LNCaP-AI(androgen independent)中的差异甲基化基因。发现与LNCaP细胞株相比,LNCaP-AI细胞株有990个CpG位点表现为高甲基化,涉及855个基因;2 305个CpG位点表现为低甲基化,涉及1 970个基因。结合转录组mRNA表达结果,筛选出6个超甲基化基因:FAM111B、RAB36、PCDH7、COL6A2、IGF1R、GULP1;8个低甲基化基因:EPHA3、TM4SF1、IGFBP5、FAM105A、RASD1、ITPR2、CYP27B1、UBE2E3。这些差异甲基化基因涉及钙离子信号通路、Wnt信号通路等多个信号通路,参与了细胞的基因表达、信号传导、细胞通讯、细胞运动、细胞黏附以及血管生成等功能,为探讨这些差异甲基化基因在前列腺癌雄激素非依赖性转化过程中发挥的作用奠定了基础。
- 秦婷婷许刚季丽丽陶志华
- 关键词:雄激素非依赖性前列腺癌DNA甲基化转录组测序