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基于分子对接的咪唑啉类α_(2A)-肾上腺素能配体三维定量构效关系研究被引量：4: 2010年; 对系列咪唑啉类α2A-肾上腺素能配体类似物进行MFA和CoMFA两种方法的定量构效关系研究。化合物的构象采用与α2A-肾上腺素能受体分子对接的最佳结合构象,计算结果表明,两种方法的计算结果有较好的一致性。MFA模型的r2和xv_r2分别为0.997和0.946,CoMFA模型的r2和xv_r2分别为0.999和0.580,两种方法得到的定量构效关系模型均有较好的拟合能力和预测能力,可用于对咪唑啉类α2A-肾上腺素能配体化合物进行虚拟筛选和活性评价。研究结果为进一步设计合成新的候选化合物提供理论依据。; 刘明李博刘宇邈杨生玉胡文祥; 关键词：分子对接定量构效关系

芬太尼类反恐活性化合物数据库的研制被引量：3: 2010年; 采用VC++和Access2007研制了我国第一个芬太尼类反恐活性化合物数据库,介绍了数据库的研制过程及检索查询方法,举例介绍了收录到数据库中的数据资料,叙述了建立芬太尼类反恐活性化合物数据库的意义.该数据库能快速的实现相关信息的录入、查找和输出等功能,为我国反恐活性化合物相关研究工作奠定了一定基础.; 弓亚玲胡文祥刘小利李博石亿王磊周鸿斌; 关键词：数据库 ACCESS VC++

细胞分子生物学技术在靶向药物筛选中的应用: 2009年; 随着细胞及分子生物学的发展,新技术方法越来越多地用于新靶点建立和药物筛选研究,为药物设计、靶点的选择和用药方案的确定提供理论依据,同时使药物筛选有了更高的特异性,对药物筛选和药理学研究起到了极大的促进作用。论述了功能基因的筛选、高通量细胞筛选和高内涵筛选技术、反义核酸技术、转基因/基因敲除技术、基因芯片、蛋白质芯片、组织芯片、酶免疫分析、荧光免疫分析、流式细胞技术等方法在靶向药物筛选中的应用。; 刘明赵琦李亚男胡文祥; 关键词：生物技术药物筛选分子药理学

Diels-Alder反应活性的量子化学计算研究: 2010年; 通过HF/6-31G*方法对Diels-Alder反应的一些双烯体及亲双烯体分子进行了结构优化和能量计算。对分子的LUMO、HOMO轨道能量的分析发现,给电子取代基双烯体与吸电子取代基亲双烯体、吸电子取代基双烯体与给电子取代基亲双烯体的Diels-Alder反应较易进行,只是反应开始第一步两者电子流向相反。计算结果表明,反应进行的可能性与一个反应分子LUMO轨道和另一个反应分子HOMO轨道能量之差呈正相关。; 胡文祥石亿刘明李博王浩宇; 关键词：DIELS-ALDER反应

微波催化方法用于诱导GFP蛋白表达实验被引量：1: 2009年; 通过在本科生实验教学"生物技术综合实验"和硕士研究生的"细胞及分子生物学实验"中,尝试使用微波超声波组合催化仪器代替溶菌酶和超声波细胞破碎的方法来裂解细胞,IPTG诱导蛋白表达,建立了微波单一催化的实验方法,可以准确表达GFP蛋白,不需要过夜反应,大大加快了反应速度,缩短反应时间,节约了实验课时间。绿色化学中的微波技术催化方法在生物化学和分子生物学领域也得到推广和应用。; 刘明胡文祥; 关键词：微波辅助蛋白表达实验教学

金催化化学概况及新进展被引量：7: 2011年; 金催化的有机化学反应在最近的十几年内得到巨大发展。本文从金化学的两类重要概念出发,讨论了金化学反应的本质,同时结合亲核加成和碳氢活化两个反应类型进行探讨,并分析了目前该领域的热点。; 魏国强徐高胡文祥; 关键词：亲核加成氧化偶联

芬太尼类似物结构修饰中高活性基团研究: 2010年; 芬太尼是Janssen于20世纪60年代早期报道的一类高效镇痛剂,本文针对芬太尼类化合物结构修饰中,对化合物镇痛作用具有重要贡献的高活性取代基团进行了归纳和总结,特别是3-甲基芬太尼和4-甲氧羰基芬太尼类化合物。本文着重总结了芬太尼类化合物1-位取代基对化合物活性的重要影响,同时提出了保持或提高现有高效麻醉镇痛药活性的基本结构要求,以期为该类化合物的新药开发研究人员提供参考。; 周博宇胡文祥; 关键词：麻醉镇痛芬太尼阿片受体结构修饰活性基团

应用量子化学反应性指数评估化合物的亲核能力被引量：6: 2014年; 评估化合物的亲核性能,对于设计化学反应的条件、研究反应机理、探讨药物与受体或酶作用靶点提供量子化学反应性参数,具有重要意义。本文在概念密度泛函理论的基础上,以得失电子前后化学势的变化,评估分子的反应性指数;用福井函数值,计算分子中各原子的反应性指数。选择脂肪胺、氨基酸和芳香胺三类胺及常用阴离子为研究对象,采用Gaussian软件分别对化合物分子及其失电子态进行结构优化和单点能计算。结果显示,建立的化学势变化值作为反应性指数的评估方法,与实验值基本吻合;所研究的几种有机分子的福井函数值与实际亲核能力基本一致。这表明可以采用得失电子前后的化学势变化值和福井函数值来预测分子和原子的亲核反应性。; 邵开元王乔刘明邢欣胡文祥; 关键词：化学势

芬太尼类化合物与阿片μ受体相互作用的分子对接与分子动力学模拟被引量：9: 2010年; 采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究了芬太尼类化合物与阿片μ受体的相互作用机制.先用AutoDock4.0程序将芬太尼类化合物对接到同源模建的阿片μ受体结构中,再用GROMACS程序包在水溶液体系中分别对12个芬太尼激动剂和阿片μ受体蛋白复合物进行了MD模拟研究,优化对接复合物的结构,最后利用MM-PBSA方法,在APBS程序中计算芬太尼类衍生物与阿片μ受体的结合自由能,计算出的受体配合物结合常数(Ki)与其实验值吻合较好,并预测了化合物的活性排序.结果表明,复合物蛋白结构与空载受体蛋白结构有较大差异,特别是胞内区IL2、IL3和跨膜区段TM4骨架构象变化较大,不同的化合物对受体结构影响也有差异,活性较好的化合物会增加蛋白特定区域结构的柔性.芬太尼类化合物可能是通过和受体结合后诱导阿片μ受体构象转变为活性构象,引起一系列的信号传导激活G蛋白,从而引发生理效应.; 李博刘明胡文祥; 关键词：分子动力学芬太尼阿片Μ受体分子对接

Pharmacophore Screening on Piperidinecarboxamides Derivatives Based on GALAHAD and CoMFA Models被引量：2: 2011年; In order to discover the novel anticonvulsant drugs, pharmacophore screening of the anticonvulsant inhibitors was enforced. Genetic Algorithm with Linear Assignment for Hypermolecular Alignment of Datasets （GALAHAD） and Comparative Molecular Field Analysis （CoMFA） studies were combined to implement our research. Firstly, multiple models were generated using GALAHAG based on high active molecules. Secondly, several of them were validated using the CoMFA study. Finally, a good values of q2 from training set and promising predictive power from test set were obtained based on one model simutaneously. One model had been selected as the most reasonable pharmacophore model. The results of the CoMFA study based on the model 1 suggested that both steric and electrostatic interactions played important roles.; Liu, MingWu, QiangsanHu, Wenxiang; 关键词：PHARMACOPHORE

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国家自然科学基金(20872095)

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