国家自然科学基金(60305001)
- 作品数:5 被引量:47H指数:4
- 相关作者:马飞李庆伟林鲁萍吴毓高琪更多>>
- 相关机构:辽宁师范大学厦门大学大连大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金辽宁省教育厅青年基金大连市优秀青年科技人才基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺表达序列标签(EST)分析被引量:20
- 2005年
- 以日本七鳃鳗口腔腺为材料,构建库容量为2.1×106pfu/mL的cDNA文库。通过对文库中克隆子的序列测定和生物信息学初步分析,得到1323条有效EST序列。经BlastX及BlastN软件进行同源对比分析,653条(49.36%)EST可在蛋白质或核苷酸水平上找到同源序列,其中328条与七鳃鳗科物种同源。同源序列功能分类大致分为11类,与蛋白质合成有关的蛋白所占比例最大。1323条EST进行片段重叠群分析(contig analysis)获得包括547条序列在内的162组片段重叠群并确定了8条全长cDNA。日本七鳃鳗口腔腺cDNA文库以及EST文库的成功构建,为研究日本七鳃鳗口腔腺的功能基因和蛋白质组学奠定了基础。
- 高琪逄越吴毓马飞李庆伟
- 关键词:口腔腺CDNA文库表达序列标签
- Y-box结合蛋白功能及对肿瘤发生的影响被引量:7
- 2006年
- Y-box结合蛋白家族成员是一类高度保守的顺式作用元件,广泛存在于原核及真核生物细胞中。它是一种多功能蛋白,与转录调节、翻译调控、mRNA选择性剪接、DNA的修复、细胞增殖和再生等有关。Y-box结合蛋白的氨基酸序列包含3个结构域:氨基酸N末端,亲水结构域C末端,冷休克结构域(coldshockdomainCSD),保守的冷休克结构域决定了Y-box结合蛋白的大部分功能。最近研究发现,定位于细胞核中的YB-1蛋白在局部晚期非小细胞肺癌的预防上可作为新的靶位点,YB-1蛋白还可通过对抑癌基因p53启动子抑制起负调控作用,此外,YB-1蛋白在PI3K/Akt信号通路中也起到重要的作用,这些研究都为肿瘤的治疗提供了新的线索和启示。文章就Y-box结合蛋白功能及其对肿瘤发生的影响等方面进行概述。
- 张玮玮黄惠芳李庆伟马飞
- 关键词:转录调节翻译调控肿瘤发生
- 基因密码子与互补密码子使用的相关分析被引量:1
- 2004年
- 遗传密码是基因与蛋白质进行信息对接的桥梁,研究不同进化阶层生物的密码子与互补密码子的使用规律是揭示物种进化的一种重要途径。为了阐明不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用之间的内在联系及其在进化中的意义,作者选取了44种细胞生物、16种病毒、40种线粒体和20种叶绿体的基因密码子与互补密码子数据,并进行关联分析。结果显示:(1)无论是古细菌,真细菌,病毒,真核生物还是两类细胞器,它们的密码子与互补密码子的使用频率大多表现为显著或极显著正相关;(2)不同生物和细胞器基因密码子与互补密码子使用频率之间相关程度也存在明显的异质性。细胞生物和两类细胞器基因密码子与互补密码子使用的高度一致性反映了它们可能具有共同的起源,显著的异质性则反映了它们分别经历了不同的进化选择压力。密码子与互补密码子的使用相关程度不仅能被用作为测量物种进化过程中所经历选择压力的指标,而且也能被用作为碱基摆动和修饰的指示器。此外,文中还对生物进化早期存在DNA双链同时具有编码基因功能的可能性进行了讨论。
- 黄惠芳林鲁萍马飞许晓风陈礼明陈学平武耀廷
- 关键词:密码子进化
- 基因选择性剪接的生物信息学研究概况被引量:13
- 2005年
- 基因选择性剪接现象是真核生物基本而又重要的调控机制。由于基因的选择性剪接在形成生物复杂性和多样性上具有极其重要的作用,同时选择性剪接与许多人类疾病也密切相关。因此,研究基因选择性剪接是一项十分重要的工作。生物信息学作为一门新兴的学科在研究基因选择性剪接上起关键的作用,尤其在研究基因表达调控机制、选择性剪接基因预测以及选择性剪接基因进化上。文章综述了这方面的最新研究进展,为更深入了解真核生物基因的表达调控机理提供依据。
- 林鲁萍马飞王义权
- 关键词:选择性剪接生物信息学基因组
- 激肽原基因的选择性剪接与功能研究进展被引量:6
- 2006年
- 激肽原基因在不同物种中有一定的差异,其编码的蛋白质产物也有所不同。在人类、牛和小鼠中存在的激肽原基因K是一种选择性剪接基因,其可以编码两种激肽原产物,而在大鼠中,除了激肽原基因K之外还有一类激肽原基因T,其只能编码一种激肽原。激肽原属于半胱氨酸蛋白酶抑制剂超家族中家族3的成员,是一类具有多个结构域的多功能蛋白,在人体内多种功能协同作用,维持着机体的正常生理状态。激肽原的凝血和抗凝血两种相互拮抗的功能既能使破损的血管得到修复,防止流血不止,又能抑制血管内血栓的形成。本文将对目前研究较多的人、牛、小鼠和大鼠的激肽原基因的选择性剪接以及激肽原的凝血、抗凝血等多方面的功能做一综述,为更进一步地阐明激肽原基因的进化机制,加深对基因选择性剪接机制的了解,揭示激肽原功能的认识等方面有所启示,并为调节血管通透性、调节血压和抗肿瘤等新药的开发提供有益的参考。
- 周丽伟马飞李庆伟
- 关键词:选择性剪接抗凝血凝血疾病