国家重点基础研究发展计划(2009CB825602)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：复旦大学湖南大学军事医学科学院更多>>
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析
- 2013年
- 利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡;在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2%,其次是intergentic,占22.5%,body区域,占13.1%,enhancer区域,占11.2%.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类.
- 刘晓杰赵志虎赵小英张文斗刘选明
- 乳腺癌组织中TET2突变与5hmC表达的关系被引量：2
- 2015年
- 目的:探讨乳腺癌组织中TET2(ten-eleven translocation 2)基因的突变与5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)表达的关系。方法:收集100例乳腺癌患者的癌组织标本。用Sanger方法检测乳腺癌组织中的TET2突变情况;用免疫组化方法检测乳腺癌组织中5hmC的表达情况;分析TET2突变与5hmC表达的关系。结果:100例乳腺癌组织中有13种TET2突变,在4例患者的肿瘤组织中发现3种以前未报道过的TET2突变(Ala341Val、Leu1622Phe、Pro1578Tyr),在2例患者的肿瘤组织中均检测到Pro1578Tyr突变。免疫组化结果显示,有TET2突变的乳腺癌组织中的5hmC表达明显低于无TET2突变的乳腺癌组织。结论:乳腺癌中TET2突变导致5hmC水平下降。
- 顾盼盼罗欣张宏伟谭理陈浩孔令春刁建波石雨江马端
- 关键词：乳腺癌突变
