国家重点基础研究发展计划(2006CB101606)
- 作品数：3 被引量：36H指数：2
- 相关作者：冯吉孟金陵龙艳张椿雨杨鹏雅更多>>
- 相关机构：华中农业大学中国热带农业科学院中国农业科学院油料作物研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所研究生科研基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 油料作物EST资源的生物信息学分析被引量：2
- 2010年
- 利用生物信息学方法,收集整理GenBank数据库中截至2008年5月收录的油料作物油菜、花生、芝麻、大豆、向日葵、蓖麻、亚麻、棕榈等八种油料作物的表达序列标签(EST)序列信息,共获得1,185,911条EST序列,使用Crosmatch、RepeatMask-er、Phrap、CAP3、EMBOSS、Blast、EST-pipeline、ORF finder、Interproscan、blast2go、IdentiCS等软件,基于Linux操作系统,进行了综合及分类分析。共获得289,892条UniEST序列,通过以上对EST序列信息的基因注释信息,筛选出与油脂代谢相关的基因信息,并以此为基础构建了油料作物油脂代谢途径比较结构图。本研究为油料作物油脂代谢相关基因数据库的构建和不同油料作物油脂代谢异同的比较打下基础。
- 柯涛毛晗惠丰立董彩华柴国华刘胜毅
- 关键词：油料作物生物信息学代谢网络
- 植物基因在转录水平上的调控及其生物学意义被引量：27
- 2007年
- 植物发生变异或分化的本质是基因表达模式发生变化的结果,而基因表达多是在转录水平进行调控的。文章通过分析总结前人在这一领域内的大量研究成果,系统地从遗传学(genetics)和表观遗传学(epigenetics)两个角度对植物基因在转录水平上的调控方式及其生物学意义进行了总结性阐述,分析了这一研究领域目前所面临的挑战,展望了该领域今后的发展及应用前景。
- 张椿雨龙艳冯吉孟金陵
- 关键词：植物转录因子表观遗传多倍化
- 木薯SAD基因片段的克隆及其序列分析被引量：7
- 2009年
- 通过比较拟南芥和蓖麻的SAD基因同源区域,设计引物并以木薯基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到长度为240 bp的基因片段,命名为木薯SAD。序列相似性检索结果表明,木薯SAD基因的核苷酸序列与基因库中登陆的大戟科植物蓖麻、千年桐的mRNA序列同源性达94%,与大豆、芝麻、葵花等油料作物的mRNA序列同源性分别达到87%、86%和82%;系统进化分析进一步表明,木薯SAD基因与大戟科植物蓖麻、麻疯树和千年桐的亲缘关系最近,该结果与传统分类学将木薯与蓖麻、千年桐和麻疯树归于大戟科的结论相符,而木薯SAD基因与芝麻、大豆、莲花、葵花等植物种仁不饱和脂肪酸含量较高的植物在进化上具有较高的保守性。
- 杨鹏雅王文泉周建国李开绵夏志强
- 关键词：木薯克隆
