国家自然科学基金(30871878)
- 作品数：3 被引量：6H指数：2
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- 相关机构：佛山科学技术学院山东农业大学更多>>
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- Ⅰ型鸭肝炎病毒SG株的分离鉴定及全基因组序列测定与分析
- 2010年
- 自山东寿光地区疑似鸭病毒性肝炎的病鸭肝组织中分离到一株鸭肝炎病毒,命名为SG株DHV-Ⅰ。该病毒能被DHV-Ⅰ标准抗血清中和,该病毒第5代病毒尿囊液对12日龄鸭胚的ELD50为10-5.58/0.2 mL,对7日龄雏鸭的LD50为10-4.68/0.2 mL。全基因组序列比较分析发现,SG株DHV-Ⅰ基因组结构为5’UTR-VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2B-2C-3A-3B-3C-3D-3’UTR,与A型DHV-Ⅰ毒株的核苷酸同源性为94.9%~99.7%,氨基酸同源性为94.5%~99.7%,表明SG株DHV为一株A型DHV-Ⅰ强毒。
- 刘标高继明姜世金司兴奎辛英豪刘少宁谢之景朱岩丽周恩民
- 关键词：全基因组
- 鸭肝炎病毒VP1蛋白B细胞抗原表位预测及变异分析被引量：2
- 2011年
- 以鸭肝炎病毒(DHV)SN株VP1基因序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测VP1蛋白的二级结构,并分别运用Kyte-Doolittle方法、Jameson-Wolf方法和Emini方法预测蛋白的亲水性、抗原指数和表面可及性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测其B细胞抗原表位。结果显示,VP1蛋白C端第132～137、177～186、209～219区段有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的无规则卷曲和β-转角,可能是VP1蛋白的B细胞抗原优势表位;DHV SN株与弱毒疫苗株在推测的VP1B细胞抗原表位177～186和209～219两个区域氨基酸序列变异较大。
- 黄良宗刘鳗仪王淑敏司兴奎马春全顾万军
- 关键词：鸭肝炎病毒VP1蛋白B细胞抗原表位
- 鸭甲肝病毒3型2012年山东分离株VP1基因的序列分析被引量：5
- 2013年
- 为揭示近年来鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)中国分离株VP1基因的遗传变异规律,本研究对2012年从山东省分离到的13株DHAV-3的VP1基因分别进行PCR扩增、序列测序与分析。结果显示,13株DHAV-3的VP1基因均由720个核苷酸组成,共编码240个氨基酸,核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为94.6%～99.9%和95.0%～100%。与GenBank中公布的31株DHAV-3的VP1基因的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92.5%～100%和90.8%～100%。系统进化分析显示,DHAV-3可分为两个基因型,其中除疫苗毒B63之外所有中国分离株均属于GⅠ型,越南分离毒株主要属于GⅡ型S1亚型,而韩国分离株组成GⅡ型中的S2亚型,具有明显的地域特征。
- 徐倩陈琳琳张瑞华杨蕾谢之景朱岩丽姜世金司兴奎
- 关键词：VP1基因GENBANK
