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耐辐射球菌基因组DNA酶切条件的优化被引量：2: 2009年; 目的研究耐辐射奇球菌Deinococcus radiodurans R1基因组DNA酶切的优化条件,从而获得构建基因文库所需的DNA片段,旨在构建DR菌基因组DNA表达文库,进一步筛选文库中与其有相互作用的蛋白。方法培养耐辐射奇球菌,提取基因组DNA,用Sau3AI酶切DR菌基因组DNA,分别从酶浓度、酶切时间等选择酶切产生的DNA片段集中在0.5-5.0 kb的最佳条件,最后通过琼脂糖凝胶电泳进行检测。结果Sau3AI酶切DR菌基因组DNA的最佳酶浓度为0.125 u/10μL,最佳作用时间为3 h,此条件下DR菌基因组DNA片段主要集中于0.5-5.0 kb。结论优化了DR菌基因组DNA的酶切条件,为进一步构建DR菌基因组DNA表达文库,筛选与高抗辐射相关基因产物的互作蛋白奠定了基础。; 马云徐向红李斌元何淑雅; 关键词：耐辐射奇球菌

Genomic DNA Expression Library Construction of Deinococcus radiodurans: ＜正＞Objective To research the interaction network of the antiradiation related proteins of Deinococcus radiodur...; XU Xiang-hong,LI Bin-yuan,Zhang Jin,HE Shu-ya (Department of Biochemistry and Molecular Biology of University of South China, Hengyang,421001); 文献传递

耐辐射奇球菌基因组DNA表达文库的构建与鉴定被引量：1: 2009年; 目的:构建耐辐射奇球菌(Deinococcus radioduransR1)基因组DNA表达文库,为进一步研究耐辐射奇球菌高抗辐射的调控网络奠定基础。方法:提取耐辐射奇球菌基因组DNA,用Sau3AI酶将基因组DNA部分酶切成0.5-5kb大小的片段,用T4DNA连接酶将部分酶切片段与经BamHⅠ和碱性磷酸酶(CIAP)处理的pGADT7载体进行连接后电击转化大肠杆菌DH5α。结果:得到重组子数为2.2×104,扩增后的文库滴度为108cfu/mL。结论:构建了耐辐射奇球菌基因组pGADT7表达文库,为进一步筛选与高抗辐射相关基因产物的互作蛋白奠定了基础。; 徐向红李斌元马云廖永强何淑雅; 关键词：耐辐射奇球菌酵母双杂交系统

耐辐射奇球菌ddrO基因在大肠杆菌中的表达及ddrO基因对其抗逆性的影响: 目的:耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans,DR)对于辐射等多种极端环境均具有极强的抗性,研究显示ddrO基因可能在DR的DNA损伤修复过程中起重要作用。本研究将DR的ddrO基因转入非耐辐射菌大肠...; 孙晓宇杜邱杨杰李伟李斌元马云黄波何淑雅廖端芳; 关键词：耐辐射球菌大肠杆菌 DNA损伤修复; 文献传递

耐辐射奇球菌辐射损伤修复机制的研究进展: 2009年; 耐辐射奇球菌是迄今为止发现的对辐射抗性最强的原核生物,是研究DNA损伤与修复的模式生物。耐辐射奇球菌(Deinococcus radiodurans,DR)对于电离辐射、紫外线、干燥、H2O2以及其他一些DNA损伤剂均表现出极强的抵抗能力,对于这种超强抗性的具体机制,学界至今尚未形成定论。对DRDNA损伤修复机制的解释包括切除修复和重组修复。本文就耐辐射奇球菌DNA辐射损伤后修复机制的研究进展作一综述。; 蒋亮李斌元; 关键词：耐辐射奇球菌 DNA修复

耐辐射奇球菌的辐射损伤修复机制研究进展被引量：5: 2012年; 耐辐射奇球菌是地球上目前发现的最耐辐射的生物之一,它对于电离辐射、紫外线、H2O2以及其他一些因素所导致的DNA和蛋白质的损伤都具有极强的耐受与抵抗能力。目前已知耐辐射奇球菌的高效DNA损伤修复能力是其具有超强辐射抗性的关键,但是对于该修复能力的具体作用机制,目前尚未有定论。本工作将就耐辐射奇球菌DNA辐射损伤修复主要机制研究进展作一综述。; 孙晓宇李斌元马云苏泽红何彬彬何淑雅; 关键词：耐辐射奇球菌

耐辐射球菌ddrO基因缺失突变株构建及ddrO基因功能研究: 目的:耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans,DR)是迄今为止地球上发现的抗辐射能力最强的生物之一。有研究认为ddrO(DR2574)基因可能是调节DNA辐射响应的主要候选基因,可能参与DR的DNA损...; 杜邱孙晓宇何彬彬马云陈小卫苏泽红廖端芳何淑雅; 关键词：耐辐射球菌 DNA损伤修复; 文献传递

耐辐射球菌ddrO基因缺失突变株的构建及其功能的初步研究: ＜正＞目的:既往研究提示耐辐射球菌（Deinococcus radiodurans,DR）ddrO（DR2574）基因可能是调节DR DNA辐射响应的主要候选基因,可能参与DNA损伤修复途径,在DR的DNA损伤修复过程中...; 杜邱何淑雅马云李斌元孙晓宇; 关键词：耐辐射球菌生物信息学基因突变 DNA损伤修复; 文献传递

耐辐射球菌转录因子DdrO的基因克隆与生物信息学分析被引量：3: 2011年; 目的:克隆耐辐射球菌ddrO基因,并对其进行生物信息学分析,预测其功能。方法:根据耐辐射球菌ddrO基因序列,由Primer Premier 5设计一对引物,以提取的耐辐射球菌基因组为模板,PCR扩增获得耐辐射球菌ddrO基因,序列测定并利用生物信息学软件对ddrO基因的理化性质、高级结构及生物学功能等进行分析与预测。结果:成功获得了ddrO基因。生物信息学分析发现,ddrO基因核苷酸序列长度为396bp,编码一个131aa组成的相对分子质量为14.993kD的预测的DdrO转录因子。核酸同源性搜索及比较分析仅在与耐辐射球菌同属的Deinococcus geothermalis和Deinococcus deserti中发现高度相似的序列;蛋白同源性搜索发现一些与DdrO显著同源的蛋白,如Deide_20570(95%),Dgeo_0336(90%),Deide_3p02170(82%)等;结构域分析发现DdrO含有HTH(helix-turn-helix)DNA结合结构域。结论:根据生物信息学结果预测DdrO蛋白可能具有转录调控作用,参与DNA修复和复制,在耐辐射球菌的DNA损伤修复过程中发挥一定作用。; 杜邱何淑雅马云李斌元孙晓宇廖端芳; 关键词：耐辐射球菌基因克隆生物信息学

应用毒理蛋白质组学技术研究多环芳烃类物质诱导气道上皮细胞毒理作用的机制被引量：3: 2011年; 为了更好地理解苯并芘(Benzo(a)pyrene,B(a)P)在气道细胞诱导的毒理作用机制.应用二维凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)分离B(a)P处理组(B(a)P-A549)、对照组(DMSO-A549)的总蛋白质,图像分析识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异蛋白质点,Western blot验证差异蛋白热激蛋白27(heat shock protein 27,HSP 27)以及锰超氧化物歧化酶(Mn superoxide dismutase,Mn SOD)的表达,使用0.1,1,10μmol/L B(a)P处理A549细胞,应用Western blot及RT-PCR检测各组细胞中Mn SOD的表达,检测各组细胞中总抗氧化活性(total antioxidant capacity)、总SOD活性(total activity of SOD)、过氧化氢酶活性(catalase activity,CAT)、谷胱甘肽还原酶活性(glutathione reductase,Gr).本研究首先建立了B(a)P处理组、对照组的2-DE图谱,质谱鉴定了23个差异蛋白质,Western blot证实HSP 27及Mn SOD的表达水平在B(a)P处理组中较对照组明显下调;使用0.1,1,10μmol/L B(a)P处理A549细胞后,发现随着B(a)P的浓度升高,虽然Mn SOD的表达及SOD活性出现先诱导后抑制的现象,但CAT及Gr活性的增高依然提高了机体的总抗氧化活性.研究结果提示:HSP 27及Mn SOD与B(a)P在气道细胞诱导的毒理作用相关,CAT及Gr在对抗B(a)P带来的氧化损伤方面可能具有十分重要的作用.; 闵凌峰何淑雅陈琼谢明萱彭红兵曹兰玉王怀石朱小燕; 关键词：气道上皮细胞蛋白质组学 HSP27 MNSOD

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