广东省自然科学基金(10451064001006063)
- 作品数：12 被引量：37H指数：4
- 相关作者：赵芹谢大森罗少波何晓明彭庆务更多>>
- 相关机构：广东省农业科学院华南农业大学江苏省农业科学院更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金国家自然科学基金广东省农科院院长基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 节瓜抗感镰刀菌酸突变体LINE逆转座子RT序列特征分析被引量：3
- 2016年
- 根据LINE逆转座子逆转录酶(RT)保守序列设计简并引物,PCR扩增节瓜g DNA,获得580 bp左右目的片段;PCR产物克隆测序后经相关生物信息学软件分析,获得41条来自感枯萎病材料及其抗性突变体的RT序列。感、抗材料的序列长度变化范围分别为548~590 bp与573~590 bp,存在明显缺失突变,核苷酸序列相似性分别为73.6%~98.9%与46.1%~99.3%;核苷酸序列聚类分析分为5个家族,家族I包含29个序列,为节瓜LINE逆转座子主要家族成员。对推导氨基酸序列分析发现,感、抗材料分别包含25个与4个保守氨基酸,抗性突变体半保守氨基酸数目略少,氨基酸序列相似性分别为53.5%~100%与10.3%~100%;与抗性突变体相比,感病材料终止密码子突变发生率较高(23条,100%),移码突变生率略低(11条,47.82%);仅发现1条抗性突变体序列具转录活性。两种材料均存在较高缺失突变、终止密码子突变与移码突变发生率,表现高度异质性。将节瓜RT序列与已知物种相应序列构建系统发育进化树,表明节瓜LINE逆转座子RT序列较保守,与拟南芥、葡萄、李等亲缘关系较近。
- 赵芹谢大森何晓明江彪罗少波彭庆务陈俊秋
- 关键词：节瓜逆转录酶
- 冬瓜组培再生体系的初步建立被引量：2
- 2012年
- 以冬瓜子叶节为试材．探讨培养条件、不同基因型及诱导、伸长和生根培养基不同激素类型与配比情况．初步建立了冬瓜组培再生体系。结果表明：种子剥皮消毒后．在纸桥培养基暗培养发芽率较高，且节约成本：以暗培养5d、见光培养1d刚转为淡绿色的闭合子叶，其不定芽诱导率最高，约75％；以13个不同基因型冬瓜子叶节为外植体．接种至不同激素浓度组合的培养基上，筛选出分化率较高的品种B214，其不定芽再生率可达到79-2％．诱导分化培养基为MS＋4．0mg／L6一BA＋0．4mg／LNAA，伸长培养基为MS＋I．0mg／L6-BA＋0．5mg／LNAA．生根培养基为1／2MS＋0．5mg／LIAA；当冬瓜组培植株高4-5cm时，炼苗移栽，其移栽成活率在60％以上。
- 赵芹谢大森何晓明罗少波
- 关键词：冬瓜子叶节
- Phylogeny and Geographical Differentiation of Zucchini Yellow Mosaic Virus Isolates from Cucurbits in China Based on Molecular Analysis of Coat Protein Gene
- ＜正＞The viral disease caused by zucchini yellow mosaic virus（ZYMV）is wordwidely devastated to cucurbits up to d...
- 赵芹Xie DasenLi HuapingHe XiaomingYou Yi
- 文献传递
- 冬瓜组培再生体系的初步建立
- 本文以冬瓜子叶节为试材,摸索培养条件、不同基因型以及诱导、伸长和生根培养基不同激素类型与配比,初步建立了冬瓜组培再生体系。实验结果表明,种子剥皮消毒后,在纸桥培养基暗培养发芽率较高,且节约成本;以暗培养5d见光培养1d刚...
- 赵芹谢大森何晓明罗少波
- 关键词：冬瓜子叶节
- 文献传递
- 黑皮冬瓜NBS类抗病基因同源序列克隆与分析被引量：5
- 2014年
- 以黑皮冬瓜＂B98K＂种质为试材,根据已克隆的植物NBS类抗病基因保守结构域设计简并引物,PCR扩增冬瓜基因组DNA,获得对应区段的DNA片段,回收克隆与测序后,得到19条抗病同源序列（命名为DNB1至DNB19）。利用DNAStar软件进行序列分析及同源性比对发现,这些抗病同源序列长度在249-252 nt之间,其核苷酸序列同源性在48.4%-98.8%之间,氨基酸序列同源性为23.2%-100.0%,推导氨基酸序列具有P-loop（GGVGKTT）、Kinase-2a（VLDDVW）典型的NBS保守结构域。同源进化分析将其全部归为non TIR-NBS-LRR类,与推导氨基酸序列多重比较结果一致;该序列与其他作物已克隆抗病基因的氨基酸序列同源性在24.7%-99.0%之间。该组序列已登录Genbank,登录号为KF776401-KF776419。
- 赵芹谢大森何晓明罗少波李明珠
- 关键词：冬瓜NBS同源克隆
- Proteomic Analysis of the Compatible Interaction between Chieh-qua and Fusarium oxysporum f.sp.chieh-qua
- ＜正＞Fusarium wilt disease caused by Fusarium oxysorum f.sp.chieh-qua impaired chieh-qua growth and productivity...
- 赵芹Xie DasenHe XiaomingLuo ShaoboPeng Qingwu
- 文献传递
- 节瓜种质资源rDNA-ITS序列分析
- 节瓜材料(56份)采集于广东、广西等地。采用改良CTAB法提取叶片总DNA,以引物ITS4/ITS5对ITS序列进行扩增、克隆和测序。用Bioedit软件分析ITS序列范围,DNAStar软件分析序列长度、G+C含量、变...
- 赵芹陈仁芳谢大森罗少波邓沙沙周念
- 关键词：节瓜种质资源RDNA-ITS系统进化
- 不同产地瓠瓜品种ITS序列的遗传多样性分析被引量：7
- 2014年
- 对国产29个瓠瓜也Lagenariasiceraria（Molina）Standl.页品种的ITS序列进行了扩增及测序,并结合引自GenBank的国产9个瓠瓜品种以及国外6个瓠瓜品种和3个同属种类的ITS序列,对它们的ITS序列长度和GC含量以及变异位点进行比较,在此基础上构建系统发育树并对47个样本间的遗传关系进行研究。结果显示：供试47个样本的ITS序列均由ITS1、5.8SrDNA及ITS2组成,各样本间的ITS序列长度、GC含量以及变异位点差异明显。国产38个瓠瓜品种的ITS序列（包括ITS1、5.8SrDNA及ITS2）长度为619-627bp、GC含量为58.00%-63.32%；国外9个样本的ITS序列长度为591-626bp,GC含量为54.17%-63.26%。序列比对结果显示：国产38个瓠瓜品种的ITS序列同源率为84.6%-100.0%,包含221个变异位点；其中,来源于山东的品种‘砧木2’（‘ZhenmuNo.2’）的ITS序列包含的变异位点最多,与其他品种间的同源率也最低。在系统发育树上,国产38个瓠瓜品种可分为3个分支,来源于山东的品种‘砧木2’和来源于河南的品种‘西瓜砧木1’（‘XiguazhenmuNo.1’）各自聚为第1和第2分支；其余36个品种聚为第3分支。而供试的47个样本则可分为2个分支和5个亚组,第1分支可分为2个亚组,包括国产品种‘砧木2’和产自日本的2个品种；第2分支包含的44个样本则进一步分为3个亚组,国产品种‘西瓜砧木1’和产自法国的品种‘白花瓠瓜’（‘White-floweredgourd’）各自聚为第1和第2亚组,其余的42个样本聚为第3亚组。研究结果表明：供试的不同产地瓠瓜品种间存在丰富的遗传变异和地理分化现象,其ITS序列差异与地理分布有一定关系。
- 赵芹谢大森彭庆务罗少波郭巨先邓沙沙
- 关键词：瓠瓜ITS序列变异位点同源性遗传分化
- 节瓜ISSR-PCR反应体系的建立与正交优化被引量：7
- 2014年
- 旨在开展节瓜种质资源分类鉴定与遗传多样性研究。通过正交试验设计与单因素分析相结合的方法,对节瓜ISSR-PCR反应体系5个因素(模板DNA浓度、dNTP浓度、Mg2+浓度、引物浓度与Taq聚合酶浓度)在4个水平上进行优化分析,建立了节瓜稳定可靠且具丰富多态性的最佳反应体系,进而对引物退火温度进行梯度试验分析。结果表明,20μL节瓜ISSRPCR最佳反应体系为70 ng模板DNA、0.2 mmol/L dNTP、1.2 mmol/L Mg2+浓度、0.96μmol/L引物、0.8 U Taq DNA聚合酶和2.0μL10×buffer;引物IS807最佳退火温度为53℃。以此为基础,利用4条引物对4份节瓜种质进行最佳反应体系稳定性验证,证明该体系稳定可靠、扩增谱带清晰、多态性丰富且重复性较好。
- 赵芹谢大森罗少波彭庆务李明珠李海达
- 关键词：节瓜ISSR-PCR退火温度
- 节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA-ITS序列分析与系统进化研究被引量：2
- 2014年
- 通过PCR扩增获得了56份节瓜种质资源及7份相关瓜类种质资源的rDNA-ITS序列,测序后结合GenBank中34份葫芦科作物的ITS序列,利用生物信息学软件分析序列长度、变异位点、G＋C含量、遗传分歧、同源性百分比差异、系统进化关系。节瓜种质资源ITS基本序列全长612-617 bp,G＋C含量59.97%-61.07%,供试材料间共96个变异位点,其中一些变异位点有明显的种性特征,可作为特异DNA指纹鉴别位点。基于ITS序列差异,56份节瓜材料聚为5大类,其中12-2-3材料为单独一个分支,黑毛节瓜H2251为第二分支,H5FA为第三分支,剩余节瓜材料聚为第四、五分支。节瓜材料12-2-3与其他材料遗传分歧最大,农艺性状与抗性也差异较大,可用作节瓜杂交育种的亲本以扩大选择范围。节瓜的系统位置排列在Indomelothria blumei（GU799496）与Dactyliandra welwitschii（HQ201973）之间,与Indomelothria blumei亲缘关系最近;Mrbayes软件分析表明,葫芦科作物Zehneria thwaitesii（AM981145）、Ctenolepis cerasiformis（AM981142）、Cucumis melo（AM36377）、Dactyliandra welwitschii（HQ201973）、Trochomeria macrocarpa（AM981141）最原始,系统进化顺序为甜瓜→南瓜、栝楼、苦瓜、丝瓜、西瓜、蒲瓜→冬瓜、节瓜→黄瓜。本研究通过分析节瓜及近缘葫芦科作物种质资源的ITS序列,为其系统进化、DNA指纹鉴别、育种亲本选择及比较组学分析等提供了分子生物学依据。
- 赵芹谢大森何晓明陈仁芳彭庆务罗少波
- 关键词：节瓜葫芦科作物种质资源系统进化
