广东省科技攻关计划(2003B21601)
- 作品数：2 被引量：22H指数：2
- 相关作者：王国平曹庆钟云丁芳易干军更多>>
- 相关机构：华中农业大学广东省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划广东省科技攻关计划湖北省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 柑橘裂皮类病毒广东分离物YC全长cDNA序列克隆及分析被引量：2
- 2007年
- 柑橘裂皮类病毒(Citrus exocortis viroid,CEVd)是危害柑橘的重要病原之一,认清该类病毒的分子特性是进一步研究其致病机制的前提。本文利用RT-PCR技术对广东分离物YC的全长cDNA序列进行了扩增、克隆,获得了全长372 bp的片段,对该片段进行测序及分析显示:CEVd广东分离物YC的分子结构域包括5个功能区即左手末端区(TL)、致病区(P)、中央保守区(C)、可变区(V)和右手末端区(TR)。通过与GenBank已登陆序列的比对分析发现:与来自西班牙的分离物CEVd-f-1(登陆号:EF494677.1)的同源性高达98%;与湖北分离物CEVd-HB(登陆号:AY456136)的同源性仅为92.7%;与强度株系CEVd-A(登陆号:M30868)的同源性为96.8%,与弱毒株系CEVd-de26(登陆号:K00965)的92.4%。说明该广东分离物YC分子特性更接近强毒株系。这是国内首次对柑橘裂皮类病毒cDNA的分子特性进行报道。
- 丁芳易干军王国平曹庆洪霓钟云
- 关键词：全长CDNA克隆
- 柑橘黄龙病、裂皮病和衰退病病原的多重RT-PCR检测被引量：20
- 2006年
- 建立了一种同时检测柑橘黄龙病病原类细菌(CandidatusLiberibacterasiaticus,HLB)、柑橘裂皮类病毒(Citrusexocortisviroid,CEVd)、柑橘衰退病病毒(Citrustristezavirus,CTV)的多重RT-PCR技术体系。运用根据3种病原核苷酸保守区序列设计的特异性引物,成功的对同一样品中的HLB、CEVd、CTV进行多重RT-PCR扩增,得到1160bp、371bp、273bp3条特异性大小与试验设计相符的条带。就影响多重PCR的主要因素引物浓度和退火温度进行了一系列优化,建立了能同时检测HLB、CEVd、CTV的多重RT-PCR技术体系。该体系最低能从10pg总RNA中检测出黄龙病类细菌和柑橘裂皮类病毒,从1pg总RNA中检测到柑橘衰退病毒。对采自田间37份材料的实际检测表明:存在两种或3种病原的复合侵染。
- 丁芳曹庆王国平易干军钟云
- 关键词：柑橘多重RT-PCR黄龙病裂皮病衰退病
