教育部科学技术研究重点项目(108083)
- 作品数:3 被引量:13H指数:2
- 相关作者:张学成臧晓南刘滨雷霁霖刘顺梅更多>>
- 相关机构:中国海洋大学中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金:教育部科学技术研究重点项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 7种鲽形目鱼类生长激素基因cDNA序列的克隆及系统分析被引量:11
- 2008年
- 从7种重要鲽形目经济鱼类——高眼鲽(Cleisthenes herzensteini)、黄盖鲽(Limanda yokohamae)、木叶鲽(Pleuronichthys Cornutus)、宽体舌鳎(Cynoglossus robustus)、石鲽(Platichthys bicoloratus)和条鳎(Zebrias zebra)、夏鲆(Paralichthys dentatus)的脑垂体中提取mRNA,通过RTPCR方法,克隆了含开放阅读框的生长激素(growth hormone,GH)cDNA序列,与本实验室已克隆的大菱鲆和漠斑牙鲆、已报道的鲆鲽鱼类及外群鱼类共22条生长激素基因cDNA进行了序列比对和同源性分析.测序结果显示,高眼鲽、黄盖鲽、木叶鲽、宽体舌鳎、石鲽、条鳎和夏鲆的GHeDNA长度依次为479,564,519,440,564,440,522bp,编码140~170个氨基酸的成熟GH多肽片段.通过序列比对,这7种蛋白序列与其他已知的鲆鲽鱼类GH序列具有较高的同源性,同科的鱼类之间同源性更高.运用PAUP软件对15种鲽形目鱼类与另外7种不同种属鱼类进行了分子系统进化树分析,结果与根据传统的形态学和生化特征分类进化地位基本一致,大菱鲆和塞内加尔鳎各自单独形成一个分支且与鲆科和鲽科鱼类相距较远,其中寒内加尔鳎等种类的分类地位与根据线粒体DNA序列分析的系统发生模式基本吻合.说明生长激素基因可以有效地用于研究鲽形目等硬骨鱼类的亲缘关系及分类地位.
- 刘滨臧晓南刘顺梅张学成雷霁霖
- 关键词:鲽形目生长激素CDNA
- 大菱鲆生长激素基因cDNA的克隆、序列分析及分子系统研究被引量:4
- 2008年
- 为了从分子水平研究大菱鲆生长激素作用机制及进化机制。以大菱鲆(Scophthalmus maximus)为材料从脑垂体中提取mRNA,利用SMART-RACE技术建立大菱鲆脑垂体cDNA文库,并从该文库中克隆出大菱鲆生长激素(growthHormone,GH)cDNA全长序列。测序结果表明,克隆的大菱鲆GH cDNA序列全长为876 bp,包括108 bp的5’UTR和174 bp的3’UTR序列。该基因的开放阅读框全长591 bp,编码由197氨基酸残基组成的生长激素成熟肽序列,用生物软件DNASTAR计算大菱鲆生长激素蛋白分子量为1 909.22,等电点为6.24。将大菱鲆与漠斑牙鲆、褐牙鲆等共7种鲆鲽鱼类GH成熟肽氨基酸序列进行比较分析,结果显示大菱鲆与其他6种鲆鲽鱼类序列同源性均为70%左右,而鲆科鱼类与鲽科鱼类间生长激素基因同源性很高(≥80%),说明大菱鲆与鲆科、鲽科鱼类的同源性较低。另外,运用PAUP软件对7种鲆蝶科鱼类与另外8种不同种属鱼类进行了分子系统进化树分析,结果与根据传统的形态学和生化特征分类进化地位基本一致,大菱鲆单独形成1个分支且与鲆科和鲽科鱼类相距较远,此结果为在形态学分类基础上进一步定义菱鲆属鱼类分类提供了理论依据。
- 刘滨臧晓南刘顺梅张学成雷霁霖
- 关键词:大菱鲆生长激素基因CDNA
- 酿酒酵母rDNA的结构及其介导整合影响因素研究进展被引量:1
- 2014年
- 为提高外源基因在酿酒酵母基因组中的拷贝数,将rDNA重复序列作为整合载体同源重组位点的研究日益被关注.本文介绍了酿酒酵母rDNA组成元件的结构,综述了以rDNA重复序列作为同源重组位点的研究进展.分析表明,hot1片段和一些蛋白因子(Fob1,RAD52和MRX,Sir2p,Sgs1和Mus81等)对rDNA单元的拷贝数目有调控作用,Smc5-Smc6复合体、RAD52的SUMO化和Mms21对rDNA的同源重组严格调控,对其稳定性有重要影响.以rDNA介导整合的外源基因在酿酒酵母细胞有丝分裂中的稳定性与整合位点在rDNA单元中的位置和性质以及整合载体的大小有重要关系.根据酿酒酵母较易发生同源重组的特点,使用rDNA重复序列作为整合载体同源重组位点可以通过提高外源基因在酿酒酵母基因组中拷贝数使外源基因在细胞中获得高效稳定表达.
- 孙恒一臧晓南张学成
- 关键词:酿酒酵母RDNA同源重组拷贝数