中国热带农业科学研究院科技基金(Rky0733)
- 作品数:1 被引量:54H指数:1
- 相关作者:程汉赵彦宏黄华孙李维国安泽伟更多>>
- 相关机构:中国热带农业科学院鲁东大学更多>>
- 发文基金:中国热带农业科学研究院科技基金国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 橡胶树EST-SSR标记的开发与应用被引量:54
- 2009年
- 通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93kb。在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%、32.09%。TC/AG、CT/GA和CTT/GAA、AAG/TTC、AGA/TCT是二、三核苷酸的优势重复类型。利用PRIMER5.0设计引物148对,随机挑选21对引物进行合成,并用其中15对扩增较好的引物,通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对44个橡胶树无性系进行了遗传多样性检测,构建了聚类分析树状图。研究结果表明,从橡胶树EST中开发SSR标记是有效、可行的,文章所开发的EST-SSR引物可用于橡胶树遗传分析研究。
- 安泽伟赵彦宏程汉李维国黄华孙
- 关键词:橡胶树SSREST