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国家自然科学基金(11271341)

作品数:10 被引量:2H指数:1
相关作者:赵熙强钊守凤胡丹肖汉赵红娟更多>>
相关机构:中国海洋大学香港大学青岛市市立医院更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金山东省自然科学基金更多>>
相关领域:理学医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 6篇理学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇生物学
  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 2篇网络融合
  • 2篇矩阵
  • 2篇聚类
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质复合物
  • 1篇等式
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇融合网络
  • 1篇肾透明细胞癌
  • 1篇搜索
  • 1篇贪婪算法
  • 1篇统计量
  • 1篇透明细胞
  • 1篇透明细胞癌
  • 1篇图嵌入
  • 1篇欧氏距离
  • 1篇排序
  • 1篇平行机

机构

  • 8篇中国海洋大学
  • 1篇青岛市市立医...
  • 1篇香港大学

作者

  • 5篇赵熙强
  • 1篇方奇志
  • 1篇闫林成
  • 1篇农庆琴
  • 1篇孙小淇
  • 1篇赵红娟
  • 1篇肖汉
  • 1篇胡丹
  • 1篇钊守凤

传媒

  • 5篇中国海洋大学...
  • 1篇运筹学学报(...
  • 1篇运筹与管理
  • 1篇Scienc...
  • 1篇理论数学
  • 1篇Journa...

年份

  • 1篇2023
  • 2篇2022
  • 1篇2019
  • 2篇2017
  • 1篇2016
  • 2篇2015
  • 1篇2014
10 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
DNA序列新特征的提取方法及其在重组位点识别中的应用
2023年
为提升重组位点识别的预测性能,本文提出了一种新的特征提取方法来识别重组位点。分别利用Word2Vec模型编码的3-gram向量和DNA特性获得两组表示DNA序列的新特征,与已有的特征(FastText模型获取)进行组合来表示DNA序列,使用支持向量机为分类算法,在基准数据集上进行5倍交叉验证。研究表明,本文提出的方法在识别重组位点方面获得了93.88%的敏感性、95.08%的特异性、94.54%的准确率和0.8902的马修斯相关系数,以上指标均优于现有的方法,本文所提出的方法为解决生物学的序列信息提取问题提供了一种新思路。
程丽荣赵熙强
关键词:DNA序列支持向量机
对基于网络结构分析疾病敏感基因方法的改进被引量:1
2017年
基于网络结构分析法研究疾病敏感基因方法是具有重要理论与实际意义的课题。本文分别对有无肾透明细胞癌的肾组织的基因表达谱做秩和检验,筛出表达差异较大的基因作为候选基因。而后对筛选得到的基因构建互信息网,基于网络结构的7个统计量,提出了"面差"的新概念,进而提出一种新的筛选可能对疾病发展过程产生重大影响的结构性关键基因的方法,并且由此得到了8个基因作为肾透明细胞癌的潜在性致病关键基因。癌症的实验研究表明得到的8个基因中有6个是与肾细胞透明癌的形成与发展有关,并且预测剩余的2个基因可能对肾透明细胞癌的产生和发展有影响。
王琨娣赵熙强赵亚萍
关键词:基因网络肾透明细胞癌
The Shortest First Coordination Mechanism for a Scheduling Game with Parallel-Batching Machines被引量:1
2016年
This paper deals with a scheduling problem with parallel-batching machines from a game theoretic perspective.There are m parallel-batching machines,each of which can handle up to b jobs simultaneously as a batch.The processing time of a batch is the time required for processing the longest job in the batch,and all the jobs in a batch start and complete at the same time.There are n jobs.Each job is owned by a rational and selfish agent.The agent of a job chooses a machine for processing its own job.The aim of each agent is to minimize the completion time of its job while the system tries tominimize the maximal completion time over all jobs,the makespan.We design a coordination mechanism for the scheduling game problem.We discuss the existence of Nash equilibria of the mechanism and showthat it has a price of anarchy 2.
Qing-Qin NongSai-Jun GuoLi-Hui Miao
关键词:SCHEDULINGGAME
基于包含邻居信息的相似网络融合对癌症亚型进行聚类
2017年
近年来随着人类基因图谱计划和癌症基因图谱计划的实施,大量的癌症数据集体涌现。如何将这些数据有效地集合起来,利用其互补性来区分癌症亚型变得尤为重要。现存在的很多方法大都根据单一的数据类型对癌症亚型进行聚类,这些方法忽略了数据之间交互影响的信息。相似网络融合(Similarity Network Fusion(SNF))是一种可以把不同数据类型融合到一起的有效方法,其中构建样本之间的相似网络是该方法的重要步骤之一。本文提出包含邻居信息的相似网络融合(Neighborhood-Information-Embedded Similarity Network Fusion(NSNF))方法,用包含邻居信息的多重紧密k近邻方法代替原有的k近邻方法来构建相似网络,并将其运用于癌症亚型聚类。最后用4种癌症的实验数据证明了提出的NSNF方法比传统的SNF方法在聚类性能上有了很大的提高。
赵亚萍赵熙强王琨娣钊守凤
关键词:聚类网络融合相似矩阵
关于可靠性设施布局问题的近似算法
2015年
设施布局问题的研究始于20世纪60年代,主要研究选择修建设施的位置和数量,以及与需要得到服务的城市之间的分配关系,使得设施的修建费用和设施与城市之间的连接费用之和达到最小.现实生活中,受自然灾害、工人罢工、恐怖袭击等因素的影响,修建的设施可能会出现故障,故连接到它的城市无法得到供应,这就直接影响到了整个系统的可靠性.针对如何以相对较小的代价换取设施布局可靠性的提升,研究人员提出了可靠性设施布局问题.参考经典设施布局问题的贪婪算法、原始对偶算法和容错性问题中分阶段分层次处理的思想,设计了可靠性设施布局问题的一个组合算法.该算法不仅在理论上具有很好的常数近似度,而且还具有运算复杂性低的优点.这对于之前的可靠性设施布局问题只有数值实验算法,是一个很大的进步.
闫林成肖汉赵红娟孙小淇
关键词:可靠性贪婪算法
基于归一化欧氏距离和谱分邻的融合网络对癌症亚型聚类
2019年
相似网络融合(SNF)是一种确定癌症亚型的有效聚类方法,可以将病人不同数据类型的相似网络融合成一个相似网络,融合后的相似网络包含病人的所有信息。本文使用归一化的欧氏距离和重新定义的病人的邻居,提出了基于归一化欧氏距离和谱聚类分邻的相似网络融合(NSSNF),减少了相似网络中数据分析时产生的噪声,并增加了不同相似网络的数据间的互补性,最后,针对数据库TCGA中的五种癌症数据,利用NSSNF方法进行数据分析,评价指标DB和CH的结果表明NSSNF方法优于传统SNF方法、NSNF方法和CSNF方法。
杨宽赵亚萍
关键词:网络融合归一化欧氏距离邻居谱聚类
基于图嵌入和布谷鸟搜索的二步蛋白质复合物预测方法
2022年
本文构造了一种基于图嵌入技术和布谷鸟搜索的二步蛋白质复合物预测方法(TSSComplex),该算法可在蛋白质交互(PPI)网络上探测蛋白质复合物。采用图嵌入技术,更新边权的计算方式,使得边权同时兼顾了网络的拓扑结构和空间结构。将布谷鸟算法和传统的复合物搜索算法NEOComplex相结合,构成了TSSComplex算法,使用TSSComplex算法既能有效控制复合物中包含的蛋白质数量,又不会遗漏一些小型复合物。将该算法用于最新的人类PPI网络进行实验分析,获得了22.78%的精度和18.62%的召回率(使用传统的NEOComplex算法,其精度和召回率从47%降到了0%)。同时,又定义了最优重合率,用来衡量探测到的复合物能否尽可能地包含已知复合物。实验发现,在参考复合物集合中,有55.43%的复合物能够完全包含在某个通过预测获得的复合物中。另一方面,在参考复合物集合中,有94.78%的复合物,其最优重合率超过了50%。研究结果显示,在蛋白质交互信息大量增加的情况下,TSSComplex算法依然具有一定的精度,且能够为进一步精确探测复合物缩小搜索范围。
葛永錱赵熙强
关键词:蛋白质复合物图嵌入
单位工件的平行机并行分批在线排序问题的算法
2015年
本文研究一类批容量有界的并行分批、平行机在线排序问题。模型中有n个相互独立的工件J={J1,…,Jn}要在m台批处理机上加工。批处理机每次可同时加工至多B(B
胡丹农庆琴方奇志
关键词:排序最大完工时间竞争比
关于序列{c_(n)}的三维Riordan矩阵及其应用
2022年
本文定义了关于序列{c_(n)}的三维 Riordan矩阵,给出了关于序列 {c_(n)}的三维 Riordan矩阵的一般元素满足的递推关系式和矩阵分解式,研究了利用关于序列 {c_(n)}的三维 Riordan矩阵寻找或证明含有参数k 及特殊组合数的组合恒等式的方法。
姜华赵熙强
关键词:恒等式
Total coloring of graphs embedded in surfaces of nonnegative Euler characteristic
2014年
Let G be a graph which can be embedded in a surface of nonnegative Euler characteristic.In this paper,it is proved that the total chromatic number of G is △(G)+1 if △(G)9,where △(G)is the maximum degree of G.
WANG HuiJuanLIU BinWU JianLiangWANG Bing
关键词:TOTAL
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