您的位置: 专家智库 > >

国家自然科学基金(31072003)

作品数:3 被引量:10H指数:2
相关作者:潘玉春何侃王琼萍杨帆王明辉更多>>
相关机构:上海交通大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇农业科学

主题

  • 2篇多态
  • 2篇多态性
  • 2篇基因
  • 1篇代谢途径
  • 1篇英文
  • 1篇肉质
  • 1篇肉质品质
  • 1篇生长性状
  • 1篇通路
  • 1篇通路基因
  • 1篇猪繁殖
  • 1篇猪繁殖性状
  • 1篇转录
  • 1篇转录因子
  • 1篇转录因子结合...
  • 1篇胴体
  • 1篇胴体性状
  • 1篇位点
  • 1篇结合位点
  • 1篇基因多态性

机构

  • 2篇上海交通大学

作者

  • 2篇潘玉春
  • 1篇王明辉
  • 1篇谭桂芳
  • 1篇张向喆
  • 1篇陈强
  • 1篇杨帆
  • 1篇王琼萍
  • 1篇杨仑
  • 1篇何侃
  • 1篇陈剑

传媒

  • 1篇遗传
  • 1篇上海交通大学...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2014
  • 2篇2012
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
VEGFA,HIF1A和EPAS1基因多态性与猪繁殖性状的相关研究(英文)
2014年
在梅山猪保种群和法系大白猪群体中采用直接测序法和PCR-RFLP法对基因VEGFA、HIF1A和EPAS1进行了基因多态位点的寻找及多态性检测并对不同基因型的总产仔数、产活仔数等繁殖性状进行了相关分析。在所获得的基因VEGFA的扩增片段中共检测到17个多态位点,其中有4个位点可进行PCR-RFLP检测,分别为BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32I-RFLP和BcnI-RFLP,而在HIF1A和EPAS1扩增片段中未获得可进行PCR-RFLP检测的多态位点。在2个实验猪群中对VEGFA基因的4个多态位点进行基因型及等位基因频率分析,结果表明:VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI 3个多态位点在梅山猪群体中A等位基因占优势,BcnI多态位点在梅山猪群体中B等位基因占优势,而在法系大白猪群体中VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI和BcnI 4个多态位点的相关基因型和等位基因分布极不均衡。BstH2I和PspEI多态位点相关的A等位基因频率在法系大白猪群体中为0,而Eco32I和BcnI多态位点相关的A、B等位基因频率在法系大白猪群体中不到1%。单倍体型推断结果表明VEGFA基因4个多态位点在梅山猪群体中共存在10种单倍体型,而在法系大白猪群体中只存在2种单倍体型BBBA和BBAB,且只有一个个体的单倍体型是BBAB。通过性状关联分析,发现梅山猪群体中VEGFA基因单倍体型BBBA对初产总仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BABA对经产总仔数和经产活仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BBAA对初生窝重影响显著(P<0.05)。使用辐射杂种克隆板将基因VEGFA定位于SSC7q11-12;基因HIF1A定位于SSC1;基因EPAS1定位于SSC3q11-14。而所获得的基因HIF1A和EPAS1的扩增片段无PCR-RFLP可识别的SNP位点。研究结果表明猪VEGFA基因具有成为影响猪繁殖性状分子遗传标记的潜力。
张向喆杨仑陈强谭桂芳陈剑严国祥潘玉春
关键词:VEGFA基因多态性繁殖性状
Associations between gene polymorphisms in two crucial metabolic pathways and growth traits in pigs被引量:3
2012年
Propanoate metabolism and fatty acid metabolism are crucial metabolic pathways in vivo that have been studied extensively and have shown a significant influence on the growth and diseases of animals.In order to identify the essential genes significantly associated with porcine growth traits at the pathway level,we selected 14 candidate genes with 58 SNPs,including 24 tag SNPs and 34 predicted SNPs,in the two essential pathways to test using the SNaPshot mini-sequencing method.Association analysis was performed using both static and dynamic phenotypic records.The results showed that four SNPs,respectively in SUCLA2,SUCLG2,ACADS,and ALDH1B1,were significantly associated with growth in pigs.In addition,an exciting finding was that the change of transcription factor binding site that resulted from alteration of the bases in SUCLG2 brought out a transcription factor binding site for POU1F1a,which is the product of a notable marker gene for growth of animals.
YANG FanWANG QiongPingWANG MingHuiHE KanPAN YuChun
关键词:生长性状代谢途径转录因子结合位点SNPS
丙酸通路基因多态性与猪肉质及胴体性状的关联分析被引量:7
2012年
为了挖掘新的猪肉品质及胴体性状的候选基因,揭示猪肉质及胴体性状的遗传机制,文章将丙酸代谢通路作为候选通路,将通路内基因与猪肉质及胴体性状进行关联分析。实验采用37头三元杂交商品猪作为研究对象,首次针对丙酸通路中7个基因的36个SNP位点利用SNaPshot方法进行基因分型,分别用最小二乘模型及MB-MDR模型与肉质及胴体性状进行关联分析。结果发现,基因PCCB、MUT、MCEE及ACSS2上的4个SNP位点分别与肌内脂肪含量、背膘厚等性状显著相关(P<0.05),ACSS2与猪脂肪含量显著相关;MCEE及MUT与猪的背膘厚显著相关;PCCB基因与脂重显著相关。通过MB-MDR方法检测到多个SNP位点具有互作效应,并与背膘厚、水分含量、脂肪含量显著相关(P<0.05)。另外,丙酸代谢通路中的基因间的互作效应对猪肉品质有显著影响。
杨帆王琼萍何侃王明辉潘玉春
关键词:多态性肉质品质SNAPSHOT
共1页<1>
聚类工具0