中国水产科学研究院青年基金(2003--4)
- 作品数：3 被引量：60H指数：3
- 相关作者：卢大儒程起群韩金娣王云龙更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院东海水产研究所复旦大学更多>>
- 发文基金：中国水产科学研究院青年基金农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 凤鲚两群体线粒体细胞色素b基因片断多态性及进化特征被引量：14
- 2006年
- 为研究凤鲚（Coilia mystus）的长江群体和珠江群体的遗传多态性、遗传关系及进化特征,使用线粒体DNA（mitochondrial DNA,mtDNA）的细胞色素b（cytochrome b,cytb）基因片断序列进行分析.在该基因片断上共检测到44个变异位点,总变异率为11.5%.凤鲚长江群体内部的遗传距离为0.3%～1.0%,珠江群体内部的遗传距离为0.5%～0.8%,长江群体与珠江群体之间的遗传距离为9.4%～10.9%.这2个群体具有完全不相同的单倍型,其中长江群体5个个体中共检测到5种不同的单倍型,单倍型多样性指数为1.000,核苷酸多样性指数为0.677%;珠江群体5个个体中共检测到4种单倍型,单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.900和0.573%.对两者序列的自然选择检验分析表明,自然选择在两者差异形成过程中起重要的作用.[中国水产科学,2006,13（3）：337-343]
- 程起群韩金娣王云龙卢大儒
- 关键词：凤鲚细胞色素B进化特征自然选择
- 刀鲚与湖鲚线粒体细胞色素b基因片段多态性及遗传关系被引量：43
- 2006年
- 使用线粒体细胞色素6基因片段序列为分子标记,分析了刀鲚和湖鲚的遗传多态性及遗传关系．在两个群体中共检测到5种不同的单倍型．刀鲚和湖鲚的单倍型多样性指数分别为0．9000和0．7000;核苷酸多样性指数分别为0．3763％和0．4301％．分子方差分析显示两者遗传分化的水平很低,群体间的差异对总的变异没有贡献．所以认为它们之间的差异尚未达到亚种水平,这一结果支持湖鲚是刀鲚的一个地理种群的观点．
- 程起群温俊娥王云龙韩金娣卢大儒
- 关键词：刀鲚细胞色素B进化
- 九种鲱科鱼类线粒体DNA细胞色素b基因相对速率测试及分歧时间估计(英文)被引量：7
- 2006年
- 对鲱科9种鱼类的线粒体细胞色素b(cytb)基因序列进行综合分析。结果表明:(1)用Ne ighbour-Join ing(NJ)法构建的分子系统树显示盖纹沙丁鱼属的3种鱼类形成一个单系类群,鲱属2种鱼类形成一个单系类群,它们的bootstrap支持率均为100%。金色小沙丁鱼和短体小沙丁鱼形成一个单系类群,在NJ树中的支持率达到或超过50%。欧洲黍鲱与太平洋鲱和大西洋鲱是单系起源,其bootstrap支持率高达100%。系统发育结果还支持沙丁鱼属鱼类与盖纹沙丁鱼属鱼类是单系类群,支持率分别为87%和95%。但单系类群I(包括大西洋鲱、太平洋鲱、欧洲黍鲱)和单系类群Ⅱ(包括欧洲沙丁鱼、加州沙丁鱼、南美拟沙丁鱼、斑点盖纹沙丁鱼)之间的系统发育关系尚不明确,因为它们之间的支持率很低。(2)dN/dS的比值显著的小于1(Z-test),提示由于功能限制,cytb基因受到强烈的负选择作用。(3)基于Tajim a的1D和2D相对速率测试表明,分子钟假说在鲱科鱼类中是成立的;鲱科鱼类的分歧时间是0.12至13.45百万年间。
- 程起群卢大儒
- 关键词：CYTB系统发育自然选择分歧时间
