国家科技支撑计划(2006BAB08-01)
- 作品数：5 被引量：48H指数：5
- 相关作者：佟广香尹家胜匡友谊张春雷张超更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所上海海洋大学云南农业大学更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划黑龙江水产研究所基本科研业务费专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 山女鳟(Oncorhynchus masou masou)AFLP体系建立的研究被引量：5
- 2009年
- 山女鳟(Oncorhynchus masoumasou)是一种优良的冷水性养殖鱼类,为了进行山女鳟养殖群体的遗传管理,该研究构建了山女鳟的AFLP分析体系,试验采用两组酶切组合酶切山女鳟基因组DNA,并对酶量及酶切时间、预扩增模板用量、预扩产物稀释倍数进行了优化。结果表明,100ngDNA用3U的EcoRI在37℃酶切3h后,再分别用3U的TaqI和Tru9I在65℃酶切4h连接效果最佳,取3μl连接产物进行预扩增,将预扩增产物稀释50倍进行选择性扩增,可以得到清晰的扩增图谱;对两组酶切组合进行对比发现,EcoRI-Tru9I组合扩增的条带数多于EcoRI-TaqI组合,后者的多态性位点比例高于前者。
- 张超佟广香匡友谊张春雷尹家胜贾钟贺
- 关键词：AFLP山女鳟
- 微卫星产物变性与非变性PAGE-银染方法比较被引量：8
- 2010年
- 用哲罗鱼的微卫星引物对哲罗鱼的2个微卫星位点进行PCR扩增。将扩增产物在变性与非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)上电泳,银染后发现微卫星扩增产物在二者上的电泳结果存在明显差异。在非变性凝胶中存在较多非特异条带,而在变性凝胶中微卫星扩增产物条带清晰,易于鉴定。
- 张春雷佟广香匡友谊张超尹家胜
- 关键词：微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳银染
- 线粒体序列分析黑龙江流域哲罗鲑的种群遗传结构被引量：6
- 2009年
- 哲罗鲑是我国土著的重要经济鱼类,近些年来,由于环境的恶化及人类活动的加剧,已对其资源量、栖息地、产卵场等造成了严重的破坏,种群处于濒危状态,被列入濒危物种红色名录中,因此研究哲罗鲑的群体遗传结构、演化历史、分布动态等对其进行有效保护具有重要意义。用线粒体Cox1和ND1基因序列对黑龙江流域内9个群体(n=30)进行了遗传结构、群体演化分析。在30个个体中,Cox1扩增出1550bp的片段,群体间序列分歧距离在0～0.0028之间,共发现10个单倍型;ND1基因扩增出1000bp的片段,群体间序列分歧距离在0～0.0013之间,共发现7个单倍型。单倍型网络(TCS)和AMOVA分析结果均表明黑龙江流域哲罗鲑存在显著的群体分化,Cox1基因、ND1基因及组合数据的群体间Fst分别为0.0704、0.0491、0.0792,均达到显著性水平(P<0.05),根据配对群体间Fst(Pairwised Fst)可以将黑龙江流域哲罗鲑群体分为黑龙江上游群体、呼玛河群体、乌苏里江群体、内蒙古伊敏河上游群体4个地理群。9个群体共享同一个单倍型(BH11),表明这些群体具有相同的演化历史,为同一个祖先群体(黑龙江上游群体)演化而来。
- 匡友谊佟广香尹家胜李池陶曹顶臣孙效文
- 关键词：哲罗鲑
- 哲罗鱼AFLP技术体系建立的研究被引量：6
- 2008年
- 以哲罗鱼为材料提取DNA,采用两组限制性内切酶组合酶切基因组,并对酶量、酶切时间、扩增时稀释倍数及镁离子的浓度进行优化,结果表明200 ngDNA用4 U的EcoRI和PstI在37℃酶切4 h后,再分别用4 U的Tru9I和TaqI在65℃酶切4 h后用3 U的T4连接酶连接3 h,进行预扩增,预扩增产物稀释100倍后选择扩增效果最佳,得到了清晰稳定的扩增图谱;并对两组酶切组合的扩增结果进行了比较,结果显示EcoRI、Tru9I酶切组合扩增的条带数要多于PstI、TaqI酶切组合扩增的条带数,但后者的多态性要高于前者。本研究为采用该技术对哲罗鱼基因组的研究提供了参考。
- 佟广香包玉龙匡友谊尹家胜
- 关键词：哲罗鱼AFLP
- 哲罗鱼微卫星亲子鉴定的应用被引量：26
- 2010年
- 该文通过7对微卫星标记,对哲罗鱼的微卫星亲子鉴定准确率、亲子鉴定能力与候选亲本群体大小的关系及应用作了研究。通过计算机软件分析,亲子鉴定能力随候选亲本群体的增大而减小。在81个可能的父母对条件下,单独养殖家系鉴定准确率为80%,混合养殖家系有78.9%的后裔可以鉴定其父母;而在9个可能的父母对条件下,单独养殖家系鉴定准确率为93.3%,混合养殖家系鉴定率为92.2%。该研究表明微卫星分子标记可以用于哲罗鱼的家系鉴定。
- 张春雷佟广香匡友谊张超尹家胜
- 关键词：哲罗鱼亲子鉴定微卫星
