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中药黄芩中4种黄酮类化合物的密度泛函理论研究被引量：2: 2013年; 采用DFT B3LYP方法在6-311G(d)基组下优化计算了黄芩苷、黄芩素、汉黄芩苷和汉黄芩素,分别从自然电荷分布、酚羟基的解离焓及前线轨道等方面分析了它们的活性.结果表明;4个分子C5处酚羟基氢原子上的正电荷数都是最大的,所带正电荷顺序是:黄芩苷>黄芩素>汉黄芩素>汉黄芩苷;酚羟基的解离能分析得到抗氧化活性顺序与其相同;最高占据轨道和最低空轨道的能级差ΔE的顺序是:黄芩苷<汉黄芩苷<黄芩素<汉黄芩素.黄芩苷消除.OH自由基的过渡态计算得到的活化能是113.2kJ.mol-1,反应热为-1 053kJ.mol-1.各种计算数据都表明黄芩苷在这四种黄酮化合物中的活性最大,消除自由基的理论活性顺序与文献报道的顺序一致.; 刘小宁杨英杰吕庆章; 关键词：黄芩黄酮类化合物密度泛函抗氧化活性过渡态

4种儿茶素生物活性密度泛函理论的研究被引量：13: 2008年; 绿茶中的4种儿茶素EGCG，ECG，EGC，和EC具有抗氧化、抗癌等生物活性，对人体健康有很好的保护作用。分子的抗氧化机制主要通过酚羟基的抽氢反应直接消除自由基。本文利用密度泛函（DFT）B3LYP法在6-31G^＊基组下计算了这4个分子，分别从分子的电荷分布、4个分子与失去带最大正电荷的酚羟基氢原子形成自由基反应的生成热之差（AHOF）、最高占据轨道、最高占据轨道和最低空轨道的能级差等方面分析儿茶素消除自由基的机理。结果表明在4个儿茶素分子中带最大正电荷的氢原子，在不同的酚羟基上。EGCG和EGC分子中位于B环的4＇位酚羟基上，ECG分子中位于D环的4＂位酚羟基上，EC分子中位于B环的3＇位酚羟基上；4个分子中其氢所带正电荷的大小顺序是EGCG〉ECG〉EGC〉EC，与文献记载的消除自由基活性顺序一致；从AHOF可以看出，儿茶素消除自由基的反应活性与酚羟基的个数和失去氢原子后形成内氢键的个数有关；另外，最高占据轨道和最低空轨道的能级差在一定程度上也反映4个分子的活性。; 吕庆章王珂芳牛静李小娟卢雁; 关键词：儿茶素自由基密度泛函电荷分布

黄芪异黄酮类化合物抗氧化活性的密度泛函理论研究被引量：33: 2012年; 本文采用密度泛函理论中的B3LYP方法在6-311G(d,p)水平上对黄芪中的四种异黄酮类化合物毛蕊异黄酮、毛蕊异黄酮苷、芒柄花素、芒柄花苷进行了优化计算,从四个分子的几何结构、酚羟基氢原子上的NBO电荷、酚羟基解离能、HOMO和LUMO能级以及其能级差△E(LUMO-HOMO)等方面分析了四种黄芪异黄酮类化合物清除自由基的活性。C3’位的酚羟基为毛蕊异黄酮苷元及其苷分子的最大可能活性位点,C7位酚羟基也具有一定的活性,可以增加分子本身的抗氧化活性,C7位酚羟基为芒柄花素分子的活性位点。C3’位或C7位上酚羟基氢原子带正电荷越大、酚羟基的解离能越小、△E(LUMO-HOMO)越小、HOMO能级相对越高分子的抗氧化活性越高。糖苷取代C7位酚羟基上的H原子,可以提高HOMO、LUMO的轨道能级,但是分子失去了7位酚羟基,从而降低了毛蕊异黄酮苷分子的抗氧化活性。结果表明,四种黄芪异黄酮类化合物的抗氧化能力大小为:毛蕊异黄酮>毛蕊异黄酮苷>芒柄花素>>芒柄花苷。对芒柄花素和羟基自由基反应的过渡态进行了计算研究。; 张鑫杨英杰吕庆章; 关键词：自由基密度泛函抗氧化活性过渡态

野黄芩苷的密度泛函理论研究被引量：5: 2012年; 采用密度泛函理论B3LYP方法在6-311G(d)基组上对野黄芩苷进行了理论计算,对其分子构型、偶极矩、疏水参数、红外光谱、酚羟基解离焓、自旋密度分布和前线轨道结构进行详细分析。结果表明,野黄芩苷是通过酚羟基发挥抗氧化作用的,其中,A环C6位置酚羟基活性最强,B环C4’酚羟基活性次之,A环C5酚羟基活性最弱。野黄芩苷在体内极性较大的环境下,可以达到好的吸收效果,研究结果为更有效合理地利用野黄芩苷提供了理论指导。; 刘小宁杨英杰吕庆章; 关键词：野黄芩苷密度泛函抗氧化自由基

6-氟-4-氧-1,4-二氢喹啉-3-羧基衍生物抗菌活性的QSAR研究被引量：3: 2010年; 为设计合成生物活性更高的喹诺酮类化合物,计算了可能会影响6-氟-4-氧-1,4二氢喹啉-3-羧基衍生物抗菌活性的最高占据轨道能级、最低空轨道能级、摩尔折射率、疏水参数等24个结构和量子化学参数,采用偏最小二乘、穷举回归和混沌遗传神经网络法对化合物的抗菌活性进行了定量结构活性关系(QSAR)研究,进而讨论了这些参数对抗菌活性的影响。结果表明:当该类化合物的生成热和极化率较大,最高占据轨道能、分子表面积、水合能和标准吉布斯自由能较小时对提高化合物抗菌活性有利。该QSAR的结果可为实验工作者合成新药提供理论参考。; 李焕杨英杰吕庆章王珂芳李小娟; 关键词：抗菌活性偏最小二乘结核分枝杆菌

4种类胡萝卜素抗氧化性质的量化计算被引量：9: 2011年; 类胡萝卜素分子结构中含有一个共轭大π键,可能是这种特殊的结构使它容易与自由基起反应,形成无害的产物,或通过破坏自由基链反应,将自由基清除。运用密度泛函理论方法(density functional theory,DFT)在B3LYP/6-31(d)水平上对虾青素、β-胡萝卜素、玉米黄素和叶黄素四种类胡萝卜素分子进行了优化计算,之后在B3LYP/6-311(d)水平上进行了单点能(single pointenergy,SPE)计算。文章从分子的几何结构、总能量、原子的NBO电荷值、以及前线轨道结构方面详细讨论了它们性质。研究表明,分子的共轭效应使C-C单双键的键长均匀化,同时降低了分子的能量,最高占据轨道与最低空轨道能级间隔ΔE(LUMO-HOMO)变小,光谱移至可见区,从而显出多种颜色。从原子的NBO电荷值,前线轨道ΔE方面分析可见,抗氧化活性理论上虾青素>玉米黄素≈β-胡萝卜素>叶黄素。玉米黄素和叶黄素结构中的羟基的亲水性会增强其与水溶性或脂溶性氧化物反应,导致其清除体内自由基的能力大于β-胡萝卜素。; 周敏娜杨英杰吕庆章; 关键词：类胡萝卜素密度泛函理论

PDK1的吲哚酮类抑制剂定量构效关系研究被引量：2: 2010年; 70 indolinone inhibitors of PDK1 are calculated to guide obtaining the higher biological activity of quinolone compounds’ design and synthesis.Quantitative structure-activity relationship study has been approached on the basis of structure and quantum chemical parameters by using partial least squares,exhaustion linear regression analysis and chaotic genetic artificial neural network.According to the models,how these parameters affect the activity of the inhibitors of PDK1 is discussed in detail.The results show that the activity of indolinone inhibitors of PDK1 will increase when these compounds have larger nuclear energy,ploarizability,ovality and lower volume,molecular topological index.The QSAR results can provide a theoretical reference for the pharmaceutical synthesis.; 李焕牛静吕庆章李小娟王珂芳; 关键词：定量构效关系偏最小二乘法

蛋白质特征曲线的研究: 2009年; 提出一种新颖的方案使蛋白质结构信息可视化。在滑动窗口方法基础上,每一个天然氨基酸采用从氨基酸索引数据库中挑选的48种特性参数描述,在某一特定窗口下的所有氨基酸残基的参数就组成一个矩阵,通过矩阵变换得到一个方矩阵,再经过窗口的滑动就得到基于整个蛋白质的所有这些窗口矩阵的本征值矩阵。对本征值矩阵元素作图得到一系列的本征值曲线,这种曲线的轮廓不随窗口的变化而变化,这些曲线被称为蛋白质的特征曲线。为选择合适的窗口宽度、对同一类型蛋白质不同窗口宽度及不同类型蛋白质相同窗口宽度下的本征值矩阵进行了比较研究,对其潜在的用途进行了讨论。; 吕庆章牛静王珂芳李小娟; 关键词：氨基酸序列

4种甘草黄酮类化合物抗氧化活性的密度泛函理论研究被引量：14: 2012年; 甘草中的4种黄酮类化合物甘草素、异甘草素、甘草苷、异甘草苷具有抗氧化、抗肿瘤、抗HIV等生物活性,具有潜在的药用价值。本文采用密度泛函理论(DFT)中的B3LYP方法在6-311G(d,p)基组水平上对甘草中的4种黄酮类化合物甘草素、异甘草素、甘草苷、异甘草苷进行了优化计算,从4个分子的几何结构、氢原子的NBO电荷、羟基解离能、HOMO、LUMO、ΔE_(LUMO-HOMO)等方面分析了4种甘草黄酮类化合物清除自由基的机理。结果表明,4种甘草黄酮类化合物的抗氧化能力大小为异甘草素≧异甘草苷>>甘草素≧甘草苷。C_7位的酚羟基为最大可能活性位点,容易发生抽氢反应,C_(4’)位酚羟基也具有一定的活性,可以增加分子本身的抗氧化活性。C_7位上酚羟基的解离能越小、羟基氢原子带正电荷越大、HOMO能级相对越高、ΔE_(LUMO-HOMO)越小分子的抗氧化活性越高。2、3位C=C双键可以增大分子的共轭体系,从而增大分子的抗氧化活性;糖苷的取代,增加了HOMO、LUMO轨道能级,但是分子失去了4’位酚羟基,所以从整体上降低了分子的抗氧化活性。; 张鑫杨英杰吕庆章; 关键词：甘草黄酮自由基密度泛函抗氧化活性

噁唑烷酮类抗菌剂的QSAR研究被引量：4: 2006年; 为了指导设计合成更高生物活性的噁唑烷酮类化合物,本文利用Hyperchem 7和Chemoffice 2004软件包计算了60个噁唑烷酮类化合物的物理化学、电子结构、拓扑指数等参数,利用偏最小二乘、穷举回归和混沌遗传算法训练的人工神经网络方法建立了定量构效关系模型,根据模型详细讨论了这些参数对抗菌活性的影响,结果表明：当该类抗菌化合物具有较大的水合能和分子表面积时有利于提高抗菌活性；当具有较低的最低空轨道能、结合能、分子拓扑指数和较小的分子体积时对提高其抗菌活性有利。; 李占潮吕庆章; 关键词：抗菌药偏最小二乘人工神经网络定量构效关系

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