国家高技术研究发展计划(2012AA101108-02-03)
- 作品数：2 被引量：11H指数：2
- 相关作者：吴嫚于霁雯庞朝友宋美珍喻树迅更多>>
- 相关机构：中国农业科学院棉花研究所西北农林科技大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 棉花纤维发育早期RNA-Seq转录组分析被引量：9
- 2013年
- 为了揭示棉花纤维发育早期基因表达变化情况,本研究以纤维长度存在显著差异的两个陆海回交近交系NMGA-062(32.58 mm)和NMGA-105(27.06 mm)为材料,利用Illumina HiSeqTM 2000对0、3 DPA(Dayspost anthesis)的胚珠及10 DPA的纤维进行RNA-Seq测序。六个文库进行拼接,共得到长度大于200 bp的Unigene 98464个,总长度约为88.2 Mb。对10 DPA的纤维转录组数据进行差异表达分析,共筛选到1931个差异表达基因,1536个Unigene上调,395个Unigene下调。GO(Gene ontology)功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现,差异表达基因富集在脂质转移活性(Lipid transport activity)分子功能组和脂质代谢通路(Lipid metabolism pathway),由此推测脂类相关基因可能在纤维伸长发育过程中起重要作用。通过对棉纤维发育10 DPA基因转录水平差异比较分析,为深入开展纤维伸长相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的资源,并为揭示棉花纤维伸长的机制打下了坚实的基础。
- 李锡花吴嫚于霁雯张金发范术丽宋美珍庞朝友喻树迅
- 关键词：RNA-SEQQRT-PCR
- 抗虫棉花杂交种中棉所86的选育被引量：2
- 2014年
- 1选育过程
中棉所86（原系名中杂5号）于2003年以中抗58A为母本，中棉所45为父本进行杂交。2004—2006年该杂交组合F1在本课题试验地进行比较试验。
- 黄双领于霁雯吴嫚裴文锋李兴丽
- 关键词：中棉所45棉花杂交种选育过程抗虫试验地
