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医学本科教育中开展大学生创新性实验计划的研究与探索被引量：4: 2015年; 开展本科教育阶段大学生创新性实验计划是我国高等教育改革中的重要举措。大学生创新性实验计划是指本科阶段在校学生个人或创新团队选择一名导师,在导师的指导下完成研究课题设计并开展相关实验研究,通过对实验结果的总结与统计分析撰写研究报告。; 刘山春李凯钰刘小钰孙佳琳张俊张佳年计骏于颖彦; 关键词：创新性实验计划大学生教育

癌症的基因组研究与转化医学前景: 2013年; 组学研究是指当今生物医学领域蓬勃发展的“-OMICS”研究．“-OMICS”概念最早见于21世纪初．伴随着基因组学技术的发展应运而生．并逐步衍生出不同的分支领域．如研究全基因组变异信息的基因组学（genomics）．研究全表达谱变异信息的转录组学．研究基因表达调控全景变化的表观遗传组学．研究全蛋白质表达谱变化的蛋白质组学．研究机体或细胞代谢物全貌的代谢组学。组学研究的发展促进了生物信息学这门交叉学科的兴起．而组学研究产生的数据为海量数据．其中蕴藏的重要生物学信息非人眼所能够识别．必须借助于强大的计算机程序加以分析、挖掘，从中提炼出研究人员需要的知识．构建多维生物分子间的对话与信号传递网络图。自从组学概念提出以来．多种形式的组学技术不断推出．这些技术在癌症研究中的应用已产生出海量数据．分别被提交到相关公共数据库内供全球研究人员参考使用。一部分研究成果已公开发表。根据NCBI文献平台不完全检索．已有1000余篇文献涉及癌症基因组测序、500余篇文献涉及癌症转录组测序：近万篇文献涉及癌症蛋白质组学、癌症表观遗传学组与代谢组掣旧。本文将介绍癌症基因组学研究进展及转化医学前景。; 于颖彦; 关键词：癌症基因组

大数据生物信息分析促进肿瘤分子靶点的发现被引量：4: 2015年; 高通量组学研究产生的大数据一般具有数据量巨大、数据种类繁多、价值需深入挖掘和处理响应速度快等特征。以人的全基因组DNA双端测序为例，如果以平均30倍覆盖率测序则可产生100 GB的原始数据（压缩FASTQ格式），回帖到基因组后的二进制储存BAM文件格式可达150 GB。基因组测序数据分析中还必需结合临床医学和样本的病理学等信息。此外，医学研究的大数据分析与展示中还需要考虑医学伦理和对患者个人隐私的保护。由于基因组测序成本日趋下降，以Illumina公司最近新推出的X Ten测序仪为例，一个肿瘤样本全基因测序成本约为1万元、全转录组测序（RNA-seq）约为5千元。这些大数据为肿瘤分子靶点的发现提供了机遇，但对大数据的充分挖掘、整合与利用也带来了巨大挑战。本文将介绍高通量组学大数据的基本分析方法、流程，阐述现阶段大数据的生物信息分析促进肿瘤分子靶点的发现的基本方法和应用。; 黄金艳于颖彦; 关键词：肿瘤分子靶点基因组大数据生物信息学

基因工程化小鼠模型在胃肠道肿瘤研究中的应用: 2014年; 基因敲除技术是以DNA同源重组技术和胚胎干细胞技术为基础．对特定基因位点进行修饰的实验方法，是揭示基因功能最直接的手段之一。小鼠和人的基因相似性达95％。小鼠培育简单、价格便宜、繁殖能力强、生命周期短，适用于疾病发生发展的全过程观察。利用基因操作技术改造小鼠基因便可产生模拟人类基因变异导致的表型效应．可为人类疾病模型的复制及疾病防治研究提供一种有效的实验手段。随着基因操作技术的不断开发与改进．基因工程化小鼠模型在胃癌研究中将扮演更加重要的角色。本文系统介绍了基因工程小鼠模型在胃肠道肿瘤研究中的应用。; 蒋燕南于颖彦; 关键词：基因敲除小鼠模型肿瘤研究

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上海市国际科技合作基金(12410706400)

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