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国家自然科学基金(30471343)

作品数：9 被引量：159H指数：8
相关作者：曹哲明张志伟吴婷婷丁炜东曹丽萍更多>>
相关机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心南京农业大学江苏省海洋水产研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
相关领域：农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 8篇中文期刊文章

领域

  • 5篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 8篇草鱼
  • 2篇多态性
  • 2篇野生群体
  • 2篇种质退化
  • 2篇微卫星
  • 2篇分子标记
  • 2篇SRAP
  • 2篇SRAP分子...
  • 2篇TRAP
  • 1篇蛋白
  • 1篇多态
  • 1篇序列多态性
  • 1篇血清
  • 1篇养殖
  • 1篇养殖群体
  • 1篇鱼苗
  • 1篇球蛋白
  • 1篇全同胞
  • 1篇群体遗传结构
  • 1篇人工繁殖

机构

  • 8篇中国水产科学...
  • 3篇南京农业大学
  • 1篇常熟理工学院
  • 1篇江苏省海洋水...

作者

  • 8篇曹哲明
  • 4篇曹丽萍
  • 4篇丁炜东
  • 4篇张志伟
  • 3篇韩曜平
  • 3篇吴婷婷
  • 1篇仲霞铭
  • 1篇俞菊华
  • 1篇周劲松
  • 1篇杨弘
  • 1篇王金龙
  • 1篇曹谨玲
  • 1篇张志勇

传媒

  • 2篇生物技术
  • 2篇Curren...
  • 1篇中国水产科学
  • 1篇Zoolog...
  • 1篇水生生物学报
  • 1篇广东海洋大学...

年份

  • 1篇2010
  • 1篇2008
  • 3篇2007
  • 2篇2006
  • 1篇2005
共 9 条 记 录，以下是 1-8
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排序方式：
TRAP及SSCP检测草鱼微卫星序列多态性被引量：10
2005年
目的:在草鱼不同种群遗传结构比较中,应用一些来自鲤鱼的微卫星引物扩增草鱼的相关序列缺少多态性,该研究通过应用几种方法提高这些序列在遗传学研究中的价值。方法:运用TRAP随机引物与鲤鱼的微卫星引物组合,扩增出多态性好、重复性强的产物;同时采用SSCP技术对那些没有长度多态的微卫星序列进一步分析,寻找这些序列存在一些核苷酸位点的多态性。结果:TRAP可以检查到多态性好、重复性强的产物;SSCP发现一部分没有长度多态性的微卫星序列存在核苷酸位点多态性并且可以清楚分辨不同的基因型。结论:结果表明TRAP及SSCP在种群遗传学研究有良好的应用前景。
曹哲明张志伟周劲松
关键词：TRAPSSCPSSR草鱼
草鱼野生和养殖群体间遗传变异的微卫星分析被引量：53
2006年
运用微卫星标记对江苏境内草鱼（Ctenopharyngodon idella）一个野生群体（邗江群体）和两个养殖群体（淡水中心群体和无锡前洲群体）遗传多样性进行了分析。在10个座位中，每个座位检测到的等位基因数2～8个。有效等位基因数、多态信息含量、期望杂合度、平均表观杂合度均以邗江草鱼野生群体最高，分别为3．9、0．5068、0．6939、0．7；无锡前洲草鱼养殖群体最低，分别为2．2、0．1796、0．5235、0．5286；淡水中心草鱼养殖群体各参数均介于两者之间，分别为3．5、0．2902、0．5418、0．5429。以上结果表明：草鱼野生群体遗传多样件更为丰富，而草鱼养殖群体存在杂合度降低，遗传多样性下降的现象。邗江草鱼野生群体与淡水中心草鱼养殖群体和无锡前洲草鱼养殖群体间遗传分化系数分别为0．219和0．246，而两个草鱼养殖群体间遗传分化系数为0．034。这表明草鱼野生群体与草鱼养殖群体间分化严重，而草鱼养殖群体间分化微弱。各座位分化程度的χ^2检验结果表明，10个座位中有GM18、MFW1-1、MFW1-2三个座位群体间分化达到极显著水平，GM03-2、MFW5两个座位群体间分化差异显著，其他座位分化不显著。针对每个座位对各群体进行HaMy-Weinberg平衡检验发现：由于草鱼养殖群体在GM03-1、GM03-2、GM18三个位点杂合子缺失，草鱼野生群体在位点GM19杂合子过剩而严重偏离平衡。实验表明：近交容易引起草鱼遗传多样性下降，纯合速度加快。
张志伟曹哲明杨弘王金龙曹谨玲韩曜平吴婷婷
关键词：草鱼微卫星野生群体养殖群体
草鱼种质相关SRAP及SCAR的分子标记被引量：32
2008年
采用相关序列扩增多态性(Sequence-realted Amplified Polymorphism,SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测,产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析。发现测得片段中有8个片段在GenBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低。根据序列信息分别设计了3对引物。用这3对引物分别对草鱼三个群体进行PCR扩增,分别产生了SCAR1(308bp)、SCAR2(66bp)、SCAR3(114bp)3个扩增带。采用大样本对这3个标记进行验证,发现其中SCAR1在家养群体中呈现阳性,在野生群体中为阴性,可区分出这两种群体。以SCAR3为引物在174条家养群体中得到目的片段,在26个家养群体没有扩增出条带,分布频率为87%;在100个野生群体中有6个个体检测到该条带,分布频率为6%。以SCAR2为引物在野生群体中完全扩增出目的条带,淡水中心群体中有7条扩增到条带,前洲群体中没有扩增出条带,标记在家养种群中的分布频率为96.50%。因此SCAR1可作为草鱼家养群体的一个重要的分子遗传特征指标,为进一步进行分子标记辅助育种奠定了基础。
丁炜东曹丽萍曹哲明
关键词：草鱼种质退化SRAP分子标记SCAR标记
草鱼全同胞鱼苗不同个体甲基化位点的差异被引量：17
2007年
本研究通过甲基化敏感扩增多态性(Methylation sensitive amplification polymorphism)对一对草鱼亲本的20个子代甲基化位点进行了研究。从20对引物组合中扩增出311个位点,其中甲基化位点236个,占总扩增位点的75.9%,表明草鱼水花期基因组甲基化水平已经很高,说明它们大部分组织分化基本完成;其中甲基化多态位点65个,占甲基化位点的27.5%,说明这些子代草鱼甲基化位点已经有相当的差异。对其他两对亲本的后代用六个引物组合扩增的结果表明,同一亲本的子代在甲基化模式上有差异可能是普遍现象。本研究结果说明,即使来自同一对草鱼亲本的不同子代个体在基因表达上也有较大的差异,因此很多性状在草鱼后代的分离和一些基因表达的改变有一定的关系。
曹哲明丁炜东俞菊华曹丽萍吴婷婷
关键词：草鱼甲基化敏感扩增多态性
草鱼TRAP-PCR反应体系的建立被引量：14
2006年
目的:通过优化草鱼TRAP-PCR反应体系,将新型分子标记-靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)引用到草鱼遗传多样性研究中。方法:以草鱼DNA为材料,分析了模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物浓度,以及循环参数、退火温度对TRAP-PCR扩增结果的影响。结果:确立了稳定性强、重复性好的草鱼TRAP-PCR最佳反应体系和扩增参数:在25μl的PCR反应体系中,含约50ng模板DNA,1UTaq酶,1×PCR缓冲液,2.0mmol/L MgCl2,4种dNTPs各0.2mmol/L,固定引物与随机引物各15pmol;首先使模板在94℃变性3min;然后94℃变性1min,38℃退火1min,72℃延伸lmin进行5个循环;接着94℃变性45s,55℃退火45s,72℃延伸lmin再进行35个循环,最后72℃延伸7min。结论:TRAP-PCR反应体系稳定可靠,该新型分子标记可应用于草鱼遗传多样性研究中。
张志伟韩曜平曹哲明
关键词：草鱼TRAP
草鱼血清IgM蛋白的纯化及抗血清的制备被引量：20
2010年
采用盐析法、重组蛋白A(HiTrapr Protein A Sepharose)亲和层析法分离纯化草鱼血清中的IgM,并通过SDS-PAGE及Western-blot技术对纯化蛋白的部分特性进行分析比较并制备兔抗IgM抗血清。结果表明:33%硫酸铵溶液可以沉淀血清中大部分蛋白,但电泳条带仍较多,其中含有78kD和28kD的条带,因此仅可作为免疫球蛋白粗提的方法;而rProtein A亲和层析法所提蛋白则仅有上述重链(78kD)和轻链(28kD)。Western-blot显示,鼠抗人Ig抗体可与78kD及28kD条带发生发应。rProtein A亲和法提纯蛋白的纯度较高,但含量较低,条带较淡,仅可作为实验室小量提纯草鱼IgM的有效方法。将提纯的蛋白免疫实验兔后可制得效价高达1:25600的兔抗鱼IgM血清,并测得血清蛋白总量和IgM含量分别为25.87mg和4.5mg,IgM占血清蛋白总量的17.39%。本实验所采用的蛋白A亲和层析法提取草鱼血清IgM可以方便、快捷地获得高纯度的产物,适合在实验室中纯化鱼类IgM。同时本研究所制备的兔抗草鱼IgM血清也为今后的相关研究工作打下基础。
丁炜东曹丽萍曹哲明
关键词：草鱼免疫球蛋白酶联免疫吸附分析
草鱼种质退化相关SRAP分子标记的筛选被引量：8
2007年
采用相关序列扩增多态性(sequence-realted amplified polymorphism,SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,并筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测,产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析,发现测得片段中有8个片段能在GeneBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低。
丁炜东曹丽萍曹哲明
关键词：草鱼种质退化克隆测序SRAP分子标记
草鱼野生群体和人工繁殖群体遗传结构的比较研究被引量：31
2007年
采用新型分子标记SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)对草鱼(Ctenopharyngodon idella)1个野生群体(来自邗江草鱼国家级原种场)和2个人工繁殖群体(分别来自淡水中心良种场和无锡前洲水产良种场)进行遗传多样性分析,从不同引物组合中筛选出8组条带清晰、多态性丰富的引物组合,每个引物组检测到的位点数为12～21个,在3个草鱼群体中共检测到120个位点,其中多态性位点有92个,多态位点比例为76.67%,显示了较高的多态性。野生群体与2个人工繁殖群体多态位点比例分别为67.62%、59.81%、53.33%,平均杂合度分别为0.214 3、0.211 0、0.172 2;邗江野生群体与2个人工繁殖群体间的遗传距离分别为0.098 0、0.115 9,两个人工繁殖群体间遗传距离为0.095 9。结果表明,草鱼人工繁殖群体遗传多样性有所下降。比较各扩增位点显性基因型频率在不同区间的分布发现,人工繁殖群体低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加。
张志伟韩曜平仲霞铭张志勇曹哲明吴婷婷
关键词：草鱼野生群体SRAP
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