黑龙江水产研究所基本科研业务费专项(2008HSYZX-SJ-05)
- 作品数：3 被引量：9H指数：2
- 相关作者：孙效文郑先虎鲁翠云赵元凤曹柱更多>>
- 相关机构：上海海洋大学中国水产科学研究院黑龙江水产研究所大连海洋大学更多>>
- 发文基金：黑龙江水产研究所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 荧光原位杂交技术在鱼类基因定位研究中的应用被引量：2
- 2013年
- 荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术是一种简单而有效的染色体上物理定位DNA序列的技术。本文介绍了荧光原位杂交技术的基本原理以及实验流程,综述了近年来FISH技术在鱼类基因定位方面的应用,如来源于细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)文库的单拷贝基因的定位、核糖体基因和组蛋白基因等中度重复序列的定位、着丝粒特异序列和性别特异序列等高度重复序列的定位以及其他重复序列的定位等,用于研究特定基因定位、性染色体鉴定及种间杂交等遗传学问题,并展望了此技术在定位鱼类经济性状相关标记或基因、性别相关标记或基因及种特异染色体标记中的应用前景。
- 鲁翠云张明昭李超郑先虎邱高峰孙效文
- 关键词：荧光原位杂交鱼类基因定位
- 磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA被引量：7
- 2011年
- 通过生物素磁珠富集法开发方正银鲫(Carassius auratus gibelio(Bloch))三、四核苷酸重复的微卫星,并与传统的放射性同位素杂交法相结合,进行二次筛选微卫星分子标记。结果显示:对652个阳性克隆进行测序分析,获得微卫星序列800个,其中完美型542个(67.75%),非完美型140个(17.50%),混合型118个(14.75%)。用引物设计软件primer3plus在线设计引物163对,选择合成76对,引物多态性通过二倍体野生鲫群体进行检测。检测结果显示,30对引物表现出不同程度多态性,等位基因数在3～8之间,多态信息含量(PIC)在0.4066～0.8023之间,其中80%为高度的多态性位点(PIC>0.5),表明方正银鲫微卫星文库是个高质量的文库。
- 曹柱鲁翠云郑先虎储志远张天奇赵元凤孙效文
- 关键词：微卫星磁珠富集法
- 银鲫多核苷酸重复微卫星的序列同源性分析
- 2010年
- 应用磁珠富集法开发银鲫的三、四核苷酸重复的微卫星。生物素探针分别为Probe-(TGA)8,Probe-(AGAC)8,Probe-(GATT)8,结果得到4740个菌落。结合同位素放射法进行二次筛选,获得652个阳性克隆(阳性克隆率13.76%),利用PRIMER3PLUS在线软件设计引物163对,采用in silico方法,对微卫星序列进行BLASTN和BLASTX在线搜索。运用BLASTN搜索,首先将设计引物后的微卫星序列(侧翼序列长度大于50bp)与GEN-BANK中的斑马鱼的EST数据库进行比对,共匹配上44个同源序列。然后利用BLASTX搜索非冗余蛋白数据库,有31个微卫星位点成功的进行了功能注释,5个微卫星位点匹配上假设蛋白。本文利用模式生物斑马鱼的基因组资源对银鲫的的基因组进行比较研究,为以后银鲫种质资源的开发打下了良好的基础。
- 曹柱赵元凤鲁翠云郑先虎张晓峰孙效文
- 关键词：银鲫微卫星磁珠富集法BLAST
