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基于语义的疾病表型相似性被引量：1: 2012年; 已知一种药物可用于治疗某疾病,则该药物可能对与该疾病具有相似表型的其他疾病有疗效。因此,大规模地计算疾病表型相似性可辅助发现的疾病新的治疗方法。我们从OMIM下载了3742种疾病的表型信息,从Mesh词库下载13721个关联解剖学和疾病症状的注释词。我们将以上的Mesh词逐一在3742种疾病的表型信息文本中搜索,得到每种疾病涉及的Mesh词汇列表,进而基于语义分析的方法系统地计算了疾病表型的两两相似性矩阵。我们发现疾病关联生物通路最多的有肿瘤生物通路,胰岛素信号通路,肥大心肌病通路和细胞粘附通路等。随疾病对表型相似度的增加,其更涉及相同KEGG生物通路的概率亦增加,证明了本文方法的可靠性。疾病表型相似性可作为疾病在基因水平相似性的补充,有望为药物发现研究提供一条新途径。; 王志刚谢丽芳陈鑫杨啸林彭屹张正国; 关键词：语义

基于大规模人群调查的心电数据库的构建被引量：4: 2010年; 建立基于大规模人群调查的心电数据库是心电研究中一项重要的基础性工作。本研究依据"中国人生理常数调查研究和数据库"的心电数据,建立了一个以10s十二导联同步心电信号为主要内容的关系型数据库。该数据库包含波形数据、心电可视化图形、多类心电测量数据、诊断结果、人口学信息和基本健康资料,并提供便捷的数据查询、更新和管理服务。目前该数据库记录的样本总量已达25821人,人口覆盖我国四省15个县市,涉及多个民族。该数据库的建立为心电信息学的研究提供了丰富的资源。; 杨啸林张靖徐铖王志刚李心雅韩少梅朱广瑾张正国; 关键词：心电图数据库

体检人群心血管健康等级评估模型的构建和应用被引量：2: 2013年; 目的构建适合于体检人群使用的心血管健康等级评估模型.方法首先按照设定的数据收集项收集2008至2010年度全国6家体检中心成人体检者连续3年的健康检测数据;然后采用聚类分析的方法对研究人群2008年的检测数据进行聚类分析,并对结果进行方差分析,检验其分类效果;第三使用判别分析的方法构建该人群心血管健康等级评估模型;最后通过回代分析对模型的重复性进行验证,使用同一人群2009年、2010年数据代入模型进行分类判别,并对结果进行一致性检验.结果使用聚类分析和判别分析构建了体检人群心血管健康等级评估模型,可以将体检人群心血管健康等级划分为较差心血管状态、一般心血管状态、理想心血管状态3类;模型的统计学验证显示模型可靠,回代准确率高达97.5％;应用验证显示模型可以较好地用于体检人群心血管健康等级评估,2009年和2010年数据的一致性检验kappa值分别为0.446和0.415,P值均＜0.05,一致性强度为中度.结论建立的体检人群心血管健康等级模型判别能力较好,健康等级分类准确,可以用于健康管理人群心血管健康等级的分级评估.; 强东昌武留信高向阳刘琳姜媛媛宋蕾; 关键词：心血管疾病

T波形态学分析心室复极不一致性在黑龙江省中老年人群分布特点被引量：2: 2010年; 目的了解心室复极不一致性T波形态学分析指标人群分布特征和相关影响因素的关系。方法分析2 514人（35~81岁,男性42.8%）的十二导联10 s数字心电图。心室复极不一致性指标包括Bazett校正QT间期（QTcB）、Frideric ia校正QT间期（QTcF）和T波形态学分析指标总QRS/T夹角余弦（TCRT）、T波形态学变异（TMD）、T波主成份比值（PCA ratio）以及相对T波残余（rTWR）。考察其年龄、性别和血压分布,利用多元回归分析进行多因素分析。结果女性QTcB、PCA ratio、TCRT、TMD和rTWR高于男性（P〈0.05）。高血压人群的QTcB、QTcF、TMD、PCA ratio和rTWR的值高于血压正常人群（P〈0.05）。多元回归显示,年龄、性别和收缩压是所有心室复极指标的影响因素,Sokolow指数仅对T波形态学分析指标有影响。结论T波形态学分析指标受年龄、性别、血压和心肌肥厚程度影响,对心室复极评价独立于QT间期。; 杨啸林张靖韩少梅张正国朱广瑾; 关键词：心电图心室复极

药物化学结构在线分析系统: 2012年; 高通量的筛选药物结构数据库,可以辅助药物设计。该文从DrugBank数据库获取4 886种药物的化学结构信息,建立了一个免费的在线药物化学结构分析平台。基于Tanimoto系数预先计算了药物两两化学结构相似性矩阵作为后台数据,从而提高了高通量药物结构分析的速度。该平台实现了药物通用名、商品名和别名的检索,药物化学结构相似性搜索查看及其聚类分析可视化的功能。应用该系统进一步验证了与相同靶蛋白关联的药物,其化学结构更相似的结论。本文系统可通过http://122.70.220.99/bme的Drug and Disease访问。; 王志刚陈鑫谢丽芳彭屹张正国; 关键词：药物筛选

药物功能模式相似度及其聚类被引量：3: 2011年; 对现有已知药物的功能模式进行分析,可以帮助发现其可能的新应用,指导联合用药或预测药物的未知毒副作用。提出将药物化学结构信息和GO注释信息结合,分析药物功能模式相似度。药物化学结构和GO注释信息下载自DrugBank数据库,其中GO注释信息包括生物过程、分子功能和细胞定位等3个分支。计算现有4886种药物的功能模式相似度,并对其进行聚类分析。基于Tanimoto系数计算药物化学结构相似度,基于语义分析计算药物GO注释中3个分支的相似度。分别使用Logistic回归、算术均值、几何均值将上述4个药物相似度结合,得到反映多方信息的复合相似度。将一种药物与所有其他药物的相似度向量作为该药物的特征谱,对药物进行层次聚类。使用药物解剖学、治疗学及化学分类(ATC)的标准评价不同的相似度和聚类结果。结果显示:药物化学结构相似度与基于GO的3个分支的相似度均线性相关,表明药物的结构信息能在一定程度上反映功能信息;Logistic回归复合相似度能够很好地反映两个药物是否属于同一个ATC分类;基于GO注释生物过程分支语义相似度和几何均数复合相似度聚类结果与ATC分类第一层次强关联。所提出的方法结果可靠,可望用于辅助药物发现和预测不良反应。; 王志刚陈鑫谢丽芳杨啸林张正国; 关键词：药物发现相似度聚类

黑龙江省成人不同肥胖类型与心室复极不一致性的关系被引量：2: 2010年; 目的探讨以腰围(WC)和腰臀比(WHR)为评价指标的中心性肥胖和以体重指数(BMI)为评价指标的全身性肥胖与心室复极不一致性的关系。方法使用Philips TrimⅡ型静息心电图仪,测量2 045名黑龙江省普通成人的标准12导联心电图,用Bazett公式计算校正的QT间期(QTc),设定QTc>440 ms为异常。结果 QTc和异常率在男性和女性中都存在随年龄和各项肥胖指标值增大而增加的趋势。女性显著大于男性。Logistic分析显示,年龄、性别、心率和收缩压对QTc异常有显著影响;体重指数、腰围和腰臀比也分别对QTc异常有显著影响,腰围对模型的贡献最大。结论肥胖是影响QTc以及异常率的独立显著性因素,与心室复极不一致性有显著相关。中心性肥胖相对全身性肥胖在衡量成人心室复极不一致性上更有优势。; 徐铖杨啸林朱广瑾张正国; 关键词：QT间期中心性肥胖

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国家科技支撑计划(2008BAI52B02)

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