国家科技支撑计划(2007BAD59B05)
- 作品数：5 被引量：92H指数：4
- 相关作者：巩鹏涛赵德刚方宣钧石之光杨文韬更多>>
- 相关机构：贵州大学广西大学海南海德热带农业资源研究所有限公司更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学政治法律更多>>
- 表型组学的概念及植物表型组学的发展被引量：33
- 2009年
- 表型组(phenome)是指某一生物的全部性状特征;表型组学(phenomics)是一门在基因组水平上系统研究某一生物或细胞在各种不同环境条件下所有表型的学科。1996年,衰老研究中心主任Steven A.Garan在滑铁卢大学的一次应邀演讲上首次提出了Phenomics(表型组学)这一概念。1998年,比利时的CropDesign公司一成立即开始着手研发可大规模开发转基因和植物性状评价的高通量的技术平台。2005年,该公司的Christophe等发表具有里程碑意义的论文,详细阐述了称之为"性状工厂"(TraitMill)的可大规模自动化分析全生育期植物表型的技术设施。2006年,Niculescu及其同事在发表的论文中描述了一种新的用于表型组学分析的实验定量研究方法,并称之为PhenoChipping。2008年,澳洲植物表型组学设施(Australian Plant Phenomics Facility)在澳大利亚阿德雷德大学威特校区建立。2009年4月,第一届国际植物表型组大会在澳大利亚堪培拉成功举办。本文主要就表型组、表型组学相关概念的定义、研究机构、研究设施、相关文献及植物表型组学的进展做了概述。
- 玉光惠方宣钧
- 关键词：表型
- 中国转基因作物,机遇与挑战被引量：14
- 2009年
- 2008年7月9日中国政府正式启动转基因生物新品种培育科技重大专项,这是中国在生物技术领域的重大举措之一。在中国分子植物育种领域面临如此重要的标志性机遇之时,本文回顾了全球转基因技术发展的历史和中国转基因作物发展的现状,对中国今后转基因作物研发与商业化中知识产权和研发模式两大瓶颈问题进行了讨论。作者还列举了近期国内有关转基因作物生物安全和生态风险方面争论的各方观点,阐明了在中国当前情况下,通过完善相应的法规并强化贯彻落实来规范转基因研发和商业化的必要性。毫无疑问,中国转基因作物又迎来了一个值得期待的春天,机遇与挑战并存。
- 巩鹏涛黄东杰黄昭奋
- 关键词：转基因作物知识产权生物安全性生态风险
- 乙醇脱氢酶(ADH)家族生物信息学分析被引量：9
- 2009年
- 本研究用生物信息学的方法分析了玉米等7个物种ADH的保守功能域、蛋白二级结构和进化关系。分析证实,植物ADH通常含有3个保守功能域,它们具有GroES结构的ADH_N结构域,Rossmann折叠NAD(P)(+)结合蛋白和锌结合位点,这3个保守结构在物种中具有相当的保守性。二级结构的分析表明,在我们研究的物种中,每个物种的两个ADH同工酶折叠情况大体相同,物种间蛋白二级结构也趋向一致。通过构建系统进化树,分析了供试物种中ADH以及ADH两个同工酶间的进化关系。初步显示,在进化上,单、双子叶植物源自不同的ADH祖先。双子叶植物ADH在物种间具有差异;而在单子叶植物不同物种其ADH同工酶出现分化。
- 石之光叶磊巩鹏涛赵德刚柳参奎
- 关键词：乙醇脱氢酶生物信息学保守结构域蛋白质二级结构
- 控制棉花长绒和短绒纤维生长发育的基因型分析被引量：1
- 2009年
- 本研究利用在纤维性状上有明显差异的4个棉花种质DP99B(毛籽棉,陆地棉)、FLS2123(裸籽棉,陆地棉)、ZYS20(光籽棉,陆地棉)以及VH8(光籽棉,海岛棉)作为棉花实验材料。利用以上4个棉花材料作为亲本组配了4个杂交组合,其组合分别为:DP99B(毛籽)×FLS123(裸籽)、DP99B(毛籽)×ZYS20(光籽)、ZYS20(光籽)×FLS123(裸籽)、DP99B(毛籽)×VH8(光籽),获得以上4种组合的F1代种子及F2代群体种子,分析F1、F2种子棉纤维性状,试图弄清控制棉花长短纤维分化和发育的基因型。根据本研究4种杂交组合其F1及F2分离表型结果,推定供试亲本材料的长绒生长发育的基因型可能为:DP99B(毛籽)的基因型为:LiALiA或LiAliA及LiDLiD或LiDliD;ZYS20(光籽)的基因型为:LiALiA或LiAliA及LiDliD或LiDliD;FLS2132(裸籽)的基因型为:LiALiALiDliD;VH8(光籽)的基因型为LiALiA或LiAliA及LiDLiD或LiDliD。4个组合的长绒的长度上都成较好的正态分布,认为棉花长纤维长度的发育是一种数量性状遗传。就短绒而言,在4个组合的F2代群体里的,ZYS20×FLS2132全为光籽、DP99B×VH8全为毛籽没有出现分离,DP99B×FLS2132和DP99B×ZYS20出现了分离,分析以上分离的具体情况并结合以前研究者结论,可以推断控制短绒和长绒分化和发育的基因并非同一组基因。推定出4个亲本DP99B(毛籽棉)、FLS2123(裸籽棉)、ZYS20(光籽棉)、VH8(光籽棉)控制短绒发育的几种可能的基因型。DP99B可能的基因型为:ii,susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc;ii,susu,Ft1Ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;VH8可能的基因型为:Ii,Susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc;Ii,susu,Ft1Ft1,Ft2Ft2,Ft3Ft3,FcFc,ZYS20可能的基因型为:Ii,Susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;Ii,susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;ii,Susu,ft1ft1,ft2ft2,Ft3Ft3,fcfc;FLS2132可能的基因型为:II,SuSu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc;Ii,Susu,Ft1ft1,Ft2ft2,Ft3ft3,Fcfc。同时进一步推定出其4个组合DP99B×FLS123,DP99B×ZYS20,ZYS20×FLS123,DP99B×VH8其F1代控制短绒发育的基因
- 叶磊石之光巩鹏涛李永起方宣钧
- 关键词：短绒基因型分析
- 水稻单侧卷叶突变体B157遗传分析及基因初步定位被引量：35
- 2008年
- 用60Co-γ射线诱变籼稻品种808,获得一个叶片单侧右向正面卷曲的突变体,命名为B157。以突变体B157与平展叶水稻808、日本晴(粳稻)、东洋超级稻(籼稻)杂交构建F2遗传群体。F2群体分离分析表明,该突变体的卷叶性状由一对隐性基因控制。利用东洋超级稻×B157构建的F2群体对该卷叶性状进行基因定位,初步将控制该卷叶性状的基因定位在水稻第1染色体上,并将其定位在RM272与RI02526两个分子标记之间,我们将该基因命名url1(t)(unilateral rolled leaf1)。定位分析表明,url1(t)基因与RM272与RI02526的遗传距离分别为0.6cM和2.0cM。进一步的insilico分析显示,url1(t)基因所在的两个标记间的物理距离为692.9kb,包含78个预测基因,其中有14个编码未知功能的表达蛋白,17个编码未知功能的假定蛋白,47个编码功能蛋白。基于TIGR数据库的分析发现,在这些预测基因中有三个预测基因与植物细胞分裂和生长有关,我们推测这三个预测基因可能与控制url1(t)卷叶性状有关。
- 余东吴海滨杨文韬巩鹏涛李有志赵德刚
- 关键词：水稻基因定位
