国家科技支撑计划(2007BAD29B03-5)
- 作品数：8 被引量：46H指数：5
- 相关作者：陈秀荔李咏梅蒋伟明彭敏杨春玲更多>>
- 相关机构：广西水产研究所广西壮族自治区水产科学研究院广西大学更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 企鹅珍珠贝AFLP反应体系建立的研究被引量：1
- 2011年
- 为了将AFLP技术应用到企鹅珍珠贝相关研究中,以企鹅珍珠贝为材料,采用SDS-CTAB改进法DNA提取高质量的基因组DNA,通过对AFLP双酶切体系?连接体系?预扩增体系及选择性扩增体系中关键因素进行优化,建立了适用于企鹅珍珠贝的AFLP反应体系。同时以3个企鹅珍珠贝地理群体为材料,采用新建立AFLP反应体系从256对引物组合中筛选出10对多态性高的AFLP引物组合,说明建立的优化体系可用于企鹅珍珠贝的AFLP分析。
- 彭敏陈晓汉陈秀荔蒋伟明黎铭李咏梅
- 关键词：企鹅珍珠贝AFLP
- 卵形鲳鲹遗传多样性研究中AFLP技术优化及引物筛选被引量：2
- 2011年
- 以卵形鲳鲹为材料,采用醋酸铵法提取高质量的基因组DNA,通过对双酶切?连接?电泳、染色等因素进行优化,建立了适用于卵形鲳鲹的AFLP反应体系。同时以卵形鲳鲹野生群体和养殖群体为材料,采用新建立AFLP反应体系从256对引物组合中筛选出10对多态性高的AFLP引物组合,获得了清晰的指纹图谱,证明建立的AFLP优化体系可用于卵形鲳鲹的AFLP分析。
- 彭敏陈晓汉蒋伟明陈秀荔杨春玲李咏梅
- 关键词：卵形鲳鲹AFLP
- 南海区卵形鲳鲹遗传多样性的研究被引量：5
- 2014年
- 为研究南海区4个不同地理位置卵形鲳鲹种群(QZ、ZJ、BH、HN)的遗传多样性。利用35对可扩增出特异性条带的引物对卵形鲳鲹4个不同地理种群进行遗传多样性分析,筛选出10对扩增效果比较好的引物,其中7对引物具有多态性。7个微卫星多态位点中,一共扩增出21个等位基因;多态信息含量为0.2896~0.6914,且处于中度到高度多态,表明这些引物可作为卵形鲳鲹遗传多样性分析的有效微卫星引物;4个群体的平均期望杂合度在0.4811~0.6135,北海群体的平均期望杂合度小于0.5,表明北海卵形鲳鲹群体的遗传多样性较低。用Popgene32软件计算出4个种群卵形鲳鲹的标准遗传距离和相似性系数,并构建聚类树,发现湛江卵形鲳鲹群体和海南群体遗传相似性系数最大,遗传关系最近。
- 赵永贞陈秀荔李咏梅彭敏杨春玲韦嫔媛彭金霞陈晓汉
- 关键词：卵形鲳鲹微卫星分子标记
- 企鹅珍珠贝不同地理群体遗传多样性的fAFLP分析被引量：13
- 2012年
- 为阐明企鹅珍珠贝(Pteria penguin)不同地理种群的遗传多样性机制,采用荧光标记扩增片段长度多态性(fAFLP)技术分析了企鹅珍珠贝广西涠洲岛、广东流沙湾和海南黎安3个不同地理群体的遗传多样性。选取7对引物组合对90个个体(每个群体30个)进行fAFLP扩增,结果发现每个个体均能扩增出清晰的、可重复的扩增条带,每对引物的扩增位点数在100—163之间,共得到895个扩增位点,多态位点数为865个;涠洲岛、流沙湾和黎安群体的多态位点比例分别为70.73%、63.13%、66.82%。Nei遗传多样性指数为0.1634、0.1558、0.1783,Shannon遗传多样性指数为0.2635、0.2474、0.2932。3个群体间遗传相似度在0.9722—0.9824之间,遗传距离在0.0177—0.0282之间。根据遗传距离绘制UPGMA聚类图,但Mantel检验结果显示企鹅珍珠贝三群体间的遗传距离与地理距离之间无显著相关。Shannon遗传多样性指数和AMOVA分析,结果均显示企鹅珍珠贝的遗传变异主要来源于群体内个体间,7.91%的遗传变异来自群体间,92.09%的遗传变异来自群体内。分析群体的显性基因型频率分布和基因流Nm发现3个群体有基本相同的遗传结构,有明显的基因交流。研究结果表明北海涠洲岛群体、湛江流沙湾群体和海南黎安群体的企鹅珍珠贝种质有较高的多态位点比例,但未发生显著地理分化。这一结果为我国企鹅珍珠贝的良种选育以及种质资源保护措施的制定提供了参考依据。
- 彭敏陈秀荔蒋伟明杨春玲李咏梅
- 企鹅珍珠贝微卫星分子标记的筛选被引量：4
- 2011年
- 运用生物素与链霉亲和素的强亲和性原理,用生物素-磁珠吸附微卫星富集法,筛选企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的微卫星分子标记序列,进而对南海区企鹅珍珠贝的遗传多样性进行分析。对136个菌落中的85个阳性克隆进行微卫星测序,获得64个序列,达到85.93%。所得到的55个重复6次以上的微卫星序列中,除生物素探针中使用的CA重复外,还得到TG、TC、GA的重复序列。重复序列中完美型36个,占65.5%;不完美型14个,占25.5%;混合型5个,占9.1%。利用Primer Premier5.0设计引物40对,合成其中的20对并进行PCR筛选,15对可扩增出特异性条带。研究表明,筛选出的企鹅珍珠贝微卫星分子标记可用于进一步的遗传多样性分析。
- 许友卿肖群平陈秀荔彭敏蒋伟明李咏梅丁兆坤
- 关键词：磁珠富集法微卫星企鹅珍珠贝
- 卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析被引量：5
- 2011年
- 利用AFLP技术对北部湾卵形鲳鲹野生群体和养殖群体进行遗传多样性分析和比较,可为卵形鲳鲹种质优化提供基础依据。研究采用10对引物组合在2个群体中共扩增出513个位点,其中多态位点数为133个,占总位点数的25.93%,两个群体平均多态位点比率为23.59%和18.32%,遗传多样性相对贫乏。养殖群体中低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加表明养殖群体丢失了低频基因。群体遗传结构分析表明,两群体间的遗传距离比较小,群体遗传结构相似。
- 彭敏陈晓汉陈秀荔蒋伟明杨春玲李咏梅
- 关键词：卵形鲳鲹AFLP养殖群体野生群体
- 一种提取高质量贝类基因组DNA的简易方法被引量：6
- 2010年
- 以企鹅珍珠贝(Pteria penguin)闭壳肌为样品,利用高盐+十二烷基硫酸钠(SDS)除去蛋白和多糖,用低盐+十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)进一步纯化DNA,建立一种贝类基因组DNA简便、安全、经济的提取方法。改进后的SDS-CTAB法提取的DNA纯度较高,无蛋白质和RNA污染;酶切和AFLP实验验证表明,所提取DNA可满足酶切分析和分子标记等实验的要求。
- 彭敏蒋伟明陈秀荔杨春玲李咏梅
- 关键词：企鹅珍珠贝DNA抽提
- 醋酸铵法提取卵形鲳鲹基因组DNA被引量：17
- 2011年
- 建立了一种简便、安全、经济的提取卵形鲳鲹基因组DNA的方法,即醋酸铵法。该方法采用7.5mol·L^(-1)醋酸铵代替酚、氯仿,通过高盐-SDS去除蛋白和多糖,异丙醇在一定浓度醋酸铵存在条件下选择性沉淀DNA,而不沉淀蛋白,并通过酶切和AFLP验证该法抽提的DNA纯度。该法提取的DNA质量较高,无蛋白质和RNA污染,较酚/氯仿法和试剂盒法抽提得到量多,酶切和AFLP试验结果表明,提取的DNA可用于酶切分析和分子标记等试验。此法安全、简便、经济,该方法更适合于对大量样品的提取。
- 彭敏陈秀荔蒋伟明杨春玲李咏梅
- 关键词：卵形鲳鲹DNA抽提
