国家自然科学基金(31201914)
- 作品数：5 被引量：25H指数：3
- 相关作者：刘湘涛张克山刘永杰孔汉金尚佑军更多>>
- 相关机构：中国农业科学院兰州兽医研究所华中农业大学甘肃农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家肉羊产业技术体系建设项目中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 羊口疮病毒疫苗株和野毒株F1L基因的比较分析被引量：3
- 2019年
- 羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orf virus,ORFV)引起的人兽共患传染病,ORFV F1L基因编码肝素结合蛋白。为比较分析ORFV疫苗株和野毒株编码的F1L基因的特征,本试验对疫苗株和野毒株的F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,并应用生物信息学相关软件及方法,对两者的F1L基因在核酸水平和氨基酸水平的变异情况及其二、三级蛋白结构变化情况进行了比较分析。结果显示,此次测定的ORFV疫苗株与野毒株F1L基因核苷酸序列相似性为95.9%,氨基酸序列相似性为94.5%。本研究结果为揭示ORFV异源宿主致弱的机制积累了资料。
- 王文莉魏楠楠徐守兴卢炳洲张大俊张克山郑海学刘湘涛
- 关键词：羊口疮病毒疫苗株野毒株
- 羊传染性脓疱病毒疫苗株和野毒株VIR基因的比较分析被引量：2
- 2016年
- 羊传染性脓疱(Orf)是由羊传染性脓疱病毒(orf virus,ORFV)感染引起的一种人兽共患传染病。VIR是ORFV编码的抗干扰素基因。为比较分析ORFV疫苗弱毒株和野毒株编码的VIR基因的特征,本试验扩增并测定了ORFV疫苗株和野毒株的VIR基因序列,比较分析了两者核酸水平和氨基酸水平的变异情况以及二、三级蛋白结构。结果表明:本次测定的ORFV疫苗株与野毒VIR基因核苷酸序列相似性为94.6%,氨基酸序列相似性为91.8%,两者在Z-DNA结合结构域和ds-RNA结合结构域均有突变。
- 王玲玲刘永杰郑海学张克山刘湘涛
- 关键词：羊口疮病毒疫苗株野毒株
- 绵羊肺腺瘤内、外源性env基因比较分析被引量：2
- 2013年
- 绵羊肺腺瘤(Ovine pulmonary adenocarcinoma,OPA)是由绵羊肺腺瘤反转录病毒(Jaagsiekte retrovirus,JSRV)感染引起的成年绵羊的一种慢性、进行性、接触传染性肺脏疾病。env是JSRV的主要毒力基因之一,而在正常羊的基因组中也存在着JSRV的内源性基因片段。为比较分析JSRV内、外源性env的特征,本文扩增并测定了正常绵羊肺组织的内源性env基因(Enenv),运用生物信息学技术,比较分析了其与外源性绵羊肺腺瘤病毒JSRV21(AF105220)env基因(Exenv)的遗传进化关系,二、三级蛋白结构和抗原表位。结果表明Enenv和Exenv核苷酸同源性为88.1%,推导的氨基酸同源性为92.0%,两者的主要差异位于TM区和YXXM基序。本结果为进一步研究JSRVenv基因功能提供了新线索。
- 孔汉金张克山刘永杰尚佑军吴斌刘湘涛
- 关键词：ENV基因
- 羊传染性脓疱病毒基因组结构和主要基因功能研究进展被引量：14
- 2014年
- 羊传染性脓疱(羊口疮)是由羊传染性脓疱病毒(羊口疮病毒,ORFV)引起的一种重要人兽共患传染病,ORFV作为副痘病毒属的代表成员之一,其基因组结构和功能具有明显的种属特异性。ORFV基因组是由中央核心区和两端反向末端重复序列构成,中央核心区主要调控病毒的复制、组装和释放,两端重复序列则决定ORFV的毒力、宿主范围、参与免疫逃避及免疫调节。论文综述了ORFV的基因组结构及功能最新研究进展。
- 成伟伟张克山刘永杰孔汉金尚佑军刘湘涛刘磊
- 关键词：羊传染性脓疱病毒基因组
- 同位素标记相对和绝对定量蛋白组技术研究进展被引量：4
- 2014年
- 近年来定量蛋白组学技术迅速发展,目前常用的有双向荧光差异凝胶电泳、同位素亲和标记、15N同位素标记、同位素标记相对和绝对定量和细胞培养条件下稳定同位素标记技术等。同位素标记相对和绝对定量技术以其高通量、高灵敏度、高重复性、高动态检测限和能对各种复杂样品进行相对和绝对定量研究等优势而备受研究者青睐,目前已发展到在同一实验中分析8组样品,增加了实验设计的灵活性。我们就同位素标记相对和绝对定量技术在定量蛋白组史中的地位作用、研究策略,以及在病毒致病机制研究和医药临床相关问题中的应用做简要综述。
- 孔汉金张克山刘永杰尚佑军吴斌刘湘涛
- 关键词：定量蛋白质组学病毒
