国家自然科学基金(20375002)
- 作品数：10 被引量：144H指数：7
- 相关作者：徐筱杰吕芳李旭东左国营张志军更多>>
- 相关机构：北京大学成都军区昆明总医院北京理工大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金陈可冀中西医结合发展基金更多>>
- 相关领域：医药卫生理学更多>>
- 14种结合自由能评价函数的比较被引量：4
- 2005年
- 采用LigandFit作为构象采样工具,以230个蛋白质-配体复合物组成的预测集,系统地比较了14种自由能评价函数(Ligscore1、Ligscore2、Plp1、Plp2、Jain、Pmf、Ludi1、Ludi2、Ludi3、D-score、Pmf-score、G-score、Chemscore以及Xscore)对蛋白质和小分子之间的结合模式以及结合自由能的预测能力.Plp1、Plp2、G-score、Pmf和Xscore在预测测试集结合自由能时得到的分数同实验测定的结合自由能的线性相关系数大于50%.在识别配体分子实验结合构象的能力方面,选择测试构象与实际构象间的位置均方根偏差rmsd≤0.20nm作为评价标准,14种评价函数的成功率从46%到77%不等,其中Ligscore1、Ligscore2、Plp1、Plp2以及Xscore的成功率都在70%以上.将评价函数中的2个或者3个组合得到一组共同评价函数可以进一步提高实验构象的预测能力,其预测成功率可以达到80%.实验表明Xscore、Plp1和Plp2在对接和评价方面都得到较好的结果.
- 李旭东侯廷军徐筱杰
- 关键词：分子对接评价函数
- 粗糙黄堇化学成分的研究被引量：9
- 2007年
- 吕芳徐筱杰
- 关键词：化学成分感冒发烧紫堇属罂粟科传染性
- 藏药镰形棘豆中黄酮类化学成分研究被引量：41
- 2007年
- 目的:对藏药镰形棘豆Oxytropis falcata的黄酮类化学成分进行研究。方法:通过正相硅胶柱色谱,Sephadex LH-20柱色谱,ODS反相色谱分离、纯化,用NMR,MS鉴定结构。结果:从镰形棘豆的氯仿萃取部分分离鉴定了8个黄酮类化合物,分别为2,′4′-二羟基-4-甲氧基查尔酮(1),2,′4′-二羟基查尔酮(2),5,7-二羟基-4′-甲氧基黄酮醇(3),7-羟基-4′-甲氧基二氢黄酮(4),3,′7-二羟基-2,′4′-二甲氧基异黄烷(5),2′-羟基-4′-甲氧基查尔酮(6),2′-甲氧基-4′-羟基查尔酮(7),2,′4′-二羟基二氢查尔酮(8)。结论:这些化合物均为首次从该植物中分离得到。
- 吕芳徐筱杰
- 关键词：豆科镰形棘豆黄酮类成分
- 藏药黑蕊虎耳草的化学成分被引量：31
- 2005年
- 从黑蕊虎耳草(Saxifraga melanocentra)地上部分的乙醇提取物中分离得到10个化合物,通过波谱分析并与有关对照品比较,将其结构鉴定为山奈酚(1),槲皮素(2),山奈酚-3-O-β-D-葡萄糖苷(黄芪苷)(3),槲皮素-3-O-β-D-葡萄糖苷(4),山奈酚-3-O-芦丁糖苷(5),芦丁(6),2″-O-没食子酰芦丁(7),岩白菜素(8),没食子酸(9)和没食子酸甲酯(10),除化合物2、6、8和10外,其余6个化合物均为首次从虎耳草属植物中得到。这些成分的鉴定为该植物的药效学研究提供了新的化学依据。
- 左国营张志军陈丽蓉徐筱杰
- 关键词：黄酮岩白菜素
- 紫堇属藏药中生物碱成分及生物活性研究进展被引量：21
- 2007年
- 目的通过查阅文献,综述紫堇属藏药中生物碱成分及生物活性研究概况。方法分析近20年的文献资料,从化学成分和生物活性两方面进行综述研究。结果综合分析了紫堇属藏药中生物碱成分的植物来源、化学结构及生物活性。结论生物碱成分是紫堇属藏药中的主要活性成分,但其相关的药理作用、生物活性等方面的研究目前仅限于少数植物。
- 吕芳徐筱杰
- 关键词：紫堇属生物碱生物活性
- 冬凌草化学成分研究被引量：9
- 2008年
- 目的：研究冬凌草的化学成分。方法：经硅胶柱层析、Sephadex LH-20柱层析、ODS反相层析对冬凌草的石油醚、乙酸乙酯部分进行分离,通过理化方法和NMR、MS鉴定化合物的结构。结果：分离得到8个化合物为：phaeophytin a（1）、phaeophytin b（2）、17c-ethoxypheaophorbide a（3）、17c-ethoxyphea-ophorbide b（4）、齐墩果酸（5）、大黄素甲醚（6）、大黄素-8-O-β-D-葡萄糖苷（7）、异鼠李素（8）。结论：化合物1-4、6、7为首次从该植物中获得。
- 吕芳徐筱杰
- 关键词：冬凌草化学成分
- 藏药镰形棘豆中化学成分研究被引量：24
- 2006年
- 经硅胶柱层析、Sephadex LH-20柱层析、ODS反相层析对镰形棘豆的乙酸乙酯部分进行分离，通过理化方法和NMR、MS鉴定7个化合物为β-sitosterol（1）、phenethylamide（2）、isoliquiritigenin（3）、genistin（4）、isorhamnetin（5）、kaempferide-3-O-β-glu（6）、kaempferol（7）。化合物2-7为首次从该植物中获得。
- 吕芳徐筱杰
- 关键词：豆科镰形棘豆化学成分
- 基于药效团模型从中草药数据库中搜索gpIIb／IIIa受体抑制剂被引量：5
- 2008年
- 选择20个3,4-二氢-1(1H)-异喹啉酮类gpIIb/IIIa受体抑制剂作为训练集,利用Catalyst软件包建立了gpIIb/IIIa受体抑制剂三维药效团模型.探讨了药效团作用模式.并通过建立的可靠性最佳的药效团模型(线性回归系数r=0.7715),从中草药数据库中虚拟筛选了gpIIb/IIIa受体抑制剂,通过实验活性测定得到了8个抑制ADP活化全血血小板聚集的IC50从40到100μmol·L-1的化合物,进一步证明了所建药效团模型的有效性.
- 李旭东徐筱杰胡娟
- 关键词：药效团模型GPIIB/IIIA
