国家自然科学基金(81160001)
- 作品数：5 被引量：26H指数：3
- 相关作者：吴江东卢丽君章乐左维泽吴芳更多>>
- 相关机构：石河子大学石河子大学医学院第一附属医院更多>>
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- 新疆石河子地区汉族人群HLA-DPB1基因多态性与肺结核易感的相关性研究被引量：1
- 2015年
- 目的:探讨研究新疆石河子地区的汉族肺结核患者与汉族健康对照者的人类白细胞抗原(HLA)-DPB1等位基因的多态性及其与肺结核易感的相关性。方法:采用DNA水平基于测序的分型方法(Sequence-based typing,SBT),通过病例-对照研究93例新疆石河子地区汉族肺结核患者与96例同一地区的汉族随机健康对照者的HLA-DPB1位点的多态性,通过统计分析研究结果,筛选出易感和保护性基因。结果:在健康对照组中,共筛选出16个等位基因,其中HLA-DPB1*0501(28.1%)和HLA-DPB1*0201(27.6%)的基因频率显著高于其他位点,分别位居第一第二;病例组与对照组研究发现,HLADPB1*0201在对照组中的频率显著高于病例组(P<0.05)。而HLA-DPB1*0501在病例组的频率显著高于对照组(P<0.05)。结论:新疆石河子地区汉族人群HLA-DPB1基因频率与中国其他地区北方汉族人群大体一致;同时本研究提示HLADPB1*0501可能为新疆石河子地区汉族肺结核的易感性基因,而HLA-DPB1*0201则可能为其保护性基因。
- 卢丽君吴江东左维泽张万江章乐吴芳
- 关键词：肺结核多态性易感性
- 新疆地区汉族和维吾尔族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多态性与单倍型的比较被引量：8
- 2016年
- 目的了解中国新疆维吾尔自治区汉族和维吾尔族人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)、HLA-DQB1、HLA-DPB1高分辨分型基础上的基因多态性和单倍型分布的特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序基因分型(PCR-SBT)法对新疆地区188例汉族人群与90例维吾尔族人群进行HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因分型,直接计数法计算基因频率,应用Arlequin3.5软件以最大似然法获得单倍型频率。结果汉族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*09∶01(12.8%)、DQB1*03∶01(20.3%)和DPB1*05∶01(33.5%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*09∶01-DQB1*03∶03(8.8%)、DRB1*09∶01-DPB1*05∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*05∶01(9.6%)和DRB1*09∶01-DQB1*03∶03-DPB1*05∶01(6.3%)。维吾尔族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*07∶01(18.3%)、DQB1*03∶01(18.9%)和DPB1*04∶01(30.0%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*07∶01-DQB1*02∶02(16.1%)、DRB1*07∶01-DPB1*04∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*04∶01(7.3%)、DRB1*07∶01-DQB1*02∶02-DPB1*04∶01(7.4%)。两组人群中等位基因有显著差异的是∶DRB1*04∶04、DRB1*07∶01、DRB1*08∶03、DRB1*11∶04、DRB1*12∶02、DRB1*13∶01、DRB1*15∶01、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01、DPB1*04∶01和DPB1*05∶01。结论中国新疆汉族与维吾尔族人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1等位基因频率、单倍型频率分布均有自己的多态性特征。
- 吴江东卢丽君左维泽章乐
- 关键词：白细胞分化抗原基因多态性单倍型
- 运用Logistic回归和ROC曲线综合评价肿瘤标志物对肺癌的诊断价值被引量：13
- 2017年
- 目的采用Logistic回归和受试者工作特征(ROC)曲线探讨癌胚抗原(CEA)、甲胎蛋白(AFP)、糖类抗原(CA)15-3、CA19-9、CA72-4在肺癌中的诊断价值。方法采用电化学发光免疫分析仪检测不同病理类型肺癌组、肺部良性疾病组及健康对照组血清肿瘤标志物(CEA、AFP、CA15-3、CA19-9、CA72-4)的水平,通过Logistic回归建立回归模型,用ROC曲线分析这些指标对肺癌诊断的意义。结果肺癌组的CEA、CA15-3、CA19-9、CA72-4水平显著高于肺部良性疾病和健康对照组(P<0.05),且CEA在肺癌的诊断中敏感性最高(45.16%)。建立回归模型Y=1/[1+EXP(1.982 X_1+3.383 X_2+2.373 X_3+2.167 X_4-1.679)],其中CA15-3的OR最高,所生成的新变量Y值在ROC曲线中的曲线下面积最大。结论 AFP对肺癌无临床诊断意义,血清CEA、CA15-3、CA19-9、CA72-4联合检测对肺癌的诊断具有一定的价值,综合运用Logistic回归和ROC曲线可以提高其肺癌诊断水平。
- 陈佳向玲亚邵华侨白雪孙婧瑜陈柯煜何佳芮东升吴江东
- 关键词：肺癌肿瘤标志物癌胚抗原LOGISTIC回归受试者工作特征曲线
- 新疆汉族人群HLA-DRB1、DQB1基因与肺结核的相关性研究被引量：2
- 2015年
- 目的分析中国新疆汉族人群白细胞分化抗原(HLA)-DRB1、DQB1基因频率及单倍型频率与肺结核的相关性,寻找与肺结核可能有关的HLA基因。方法选取新疆地区汉族人群肺结核患者92例与健康对照者96例,采用聚合酶链反应-直接碱基序列分析基因分型技术(PCR-SBT)对HLA-DRB1、DQB1进行基因分型。结果 92例新疆汉族结核患者中分别检出HLA-DRB1位点等位基因30个、HLA-DQB1位点等位基因16个;96例健康对照组分别检出HLA-DRB1位点等位基因29个、HLA-DQB1位点等位基因29个。与对照组相比,结核病例组中HLA-DRB1*0701、DQB1*0301基因频率明显增高,单倍型DRB1*07:01-DQB1*02:02、DRB1*09:01-DQB1*03:03频率明显增高。结论 HLA-DRB1*0701、DQB1*0301可能是中国新疆汉族人群肺结核的易感基因,DRB1*07:01-DQB1*02:02、DRB1*09:01-DQB1*03:03可能是中国新疆汉族人群肺结核的易感单倍型。
- 卢丽君吴江东左维泽章乐吴芳
- 关键词：肺结核白细胞分化抗原等位基因单倍型
- 新等位基因HLA-DRB*116:36的鉴定及确认被引量：3
- 2015年
- 目的:鉴定和确认中国人群HLA新等位基因DRB1*16:36。方法:应用PCR-SBT技术对新疆维吾尔族人群血液提取的DNA进行分型,对可能的新等位基因采用组序列特异性引物和单链测序基因分型技术进行测序,与已知同源性最相似基因的序列进行对比,分析两组序列的差异。结果:新等位基因与其同源性最相似的等位基因DRB1*16:23相比,其差异在于第227和236位碱基由A→T和T→C,分别引起第47位氨基酸由酪氨酸→苯丙氨酸、第50位氨基酸由缬氨酸→丙氨酸。结论:确认了该等位基因为HLA-DRB1的一个新等位基因,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1*16:36。
- 卢丽君左维泽张万江章乐吴芳吴江东
- 关键词：人类白细胞抗原基因分型
