国家自然科学基金(30571414) 作品数:11 被引量:136 H指数:6 相关作者: 张建社 刘臻 鲁双庆 匡刚桥 唐建洲 更多>> 相关机构: 长沙大学 湖南农业大学 湖南大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 湖南省自然科学基金 湖南省教育厅重点项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 环境科学与工程 更多>>
黄鳝微卫星标记筛选及其在不同性别表型群体中的遗传多态性 被引量:5 2009年 采用FIASCO(Fastisolation by AFLP sequences containing repeats)法进行黄鳝微卫星标记筛选并将其应用于黄鳝性别差异群体的遗传变异分析。黄鳝基因组DNA经酶切、微卫星核心序列探针杂交、T载体连接并转化至DH5a中,构建黄鳝基因组微卫星富集文库。随机挑选75个阳性克隆测序,结果发现其中20个含有微卫星序列,利用软件成功设计了15对微卫星引物,经过黄鳝基因组DNA的PCR扩增及电泳检测,筛选8对多态性微卫星引物并对黄鳝3种不同性别表型群体的基因组DNA进行PCR扫描,结果显示:在8个微卫星座位中,共检测到51个等位基因,平均每个座位的等位基因数为6.375个,等位基因频率分布为0.0012~0.6033;黄鳝雌性表型群体、间性表型群体、雄性表型群体的平均遗传杂合度分别为0.6371、0.6969、0.7345;平均多态信息含量分别为0.5656、0.6416、0.6858,表明这些微卫星标记在黄鳝不同性别表型群体的遗传多态性发生了改变,它们可作为黄鳝遗传背景分析的分子标记。 刘臻 罗小华 鲁双庆 匡刚桥 张建社关键词:FIASCO 微卫星DNA 遗传多态性 GenBank数据库中鳜鱼微卫星位点的筛选及特征分析 被引量:11 2007年 This project made use of bioinformatic mining of microsatellites from genomic resources to identify simple sequence repeats(SSRs),or microsatellites.A bioinformatic analysis of 304 nucleotide sequences in Siniperca chuatsi GenBank identified 22 sequences containing 30 microsatellites,account for 9.87% of wholly GenBank database.Cluster analysis indicated that 16 dinucleotide pairs were the most abundant microsatellites,accounting for 53.33% of the total microsatellite-containing sequences;11 trinucleotide repeats and 3 tetranucleotide repeats were found in these microsatellite sequences,accounting for 36.66% and 10.01% respective.17 primer pairs were designed from these microsatellite sequences.Among the 17 primer pairs,13 pairs have amplified products,6 pairs can achieve clear PCR products by Electrophoresis.Genotype analysis results indicated that:the average polymorphism information contents(PIC)were 0.692(ranged:0.567-0.806),were all polymorphic loci. 匡刚桥 刘臻 鲁双庆 刘红玉 张建社 肖调义关键词:鳜鱼 微卫星 GENBANK数据库 鱼类功能基因表达的营养调控 2005年 水产养殖从理论上分析是一个人工控制与鱼类生产性状相关基因,如生长和生长激素基因,抗性基因和优良肉质性状相关基因等的表达过程,从而使养殖鱼类获得生长快,抗性强和肉质好等综合性状.本文对上述与生产性状相关基因,以及它们的营养调控的分子生物学机理进行了总结和分析. 张建社 刘臻关键词:鱼类 基因表达 营养调控 湘江野鲤养殖群体和自然群体遗传多样性的微卫星分析 被引量:22 2007年 采用微卫星技术,用17对微卫星引物对湘江野鲤养殖群体和自然群体的的遗传多样性进行分析。结果表明:有15对引物扩增出清晰的条带,其中13对引物在群体间呈现多态性;2个群体中,13对多态性引物分别扩增等位基因2~12个,共90个,其中35个等位基因为2群体共有,55个等位基因具有群体特异性,引物平均等位基因数为6·92个,等位基因频率为0·0667~0·8333;养殖群体和自然群体的平均遗传杂合度和平均多态信息含量分别为0·5688、0·5152,0·5860、0·5347;2个群体间遗传相似性指数为0·6762,遗传距离为0·3238,表明湘江野鲤养殖和自然群体遗传多样性均较为丰富,2个群体间遗传变异程度较高。 刘臻 鲁双庆 匡刚桥 张建社 刘红玉 刘峰关键词:微卫星标记 FIASCO法筛选鳜鱼微卫星标记 被引量:26 2007年 通过FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)法构建鳜鱼(Siniperca chuatsi)基因组微卫星富集文库,分离微卫星DNA序列并对其特征进行分析。鳜鱼基因组DNA经MseⅠ限制性内切酶消化后,选取200~800bp的片段与MseⅠ接头连接,用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)8、(CT)8、(AT)7、(GATA)8、(GATT)7与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,变性洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增形成双链,然后克隆到pGEM-T载体上,转化至DH5α中,首次成功构建鳜鱼基因组微卫星富集文库。对其中100个阳性克隆进行测序,60个(60%)含有微卫星序列(GenBank Accession Number:DQ789247~DQ789306)。成功设计了47对鳜鱼微卫星引物,并合成21对引物进行PCR扩增,结果筛选出18个多态性微卫星标记。结果表明:FIASCO法能有效提高筛选微卫星标记的效率。本研究筛选的微卫星标记可以用于鳜鱼遗传背景分析和遗传连锁图谱构建,并将为鳜鱼基因组结构分析、标记辅助育种以及数量性状位点(QTL)基因的定位等研究提供候选微卫星标记。[中国水产科学,2007,14(4):608—614] 匡刚桥 刘臻 鲁双庆 刘红玉 张建社 唐建洲关键词:鳜鱼 微卫星标记 富集文库 重金属铅对鲫鱼乳酸脱氢酶和过氧化氢酶活性的影响 被引量:44 2006年 在实验室条件下,采用毒性实验方法研究不同浓度重金属铅(Pb2+)对鲫鱼血清乳酸脱氢酶(LDH)和血液过氧化氢酶(CAT)活性的影响.研究结果表明,随着金属离子铅浓度的增高血清中乳酸脱氢酶和过氧化氢酶活性下降,但两种酶对铅离子影响的敏感程度不同.影响LDH活性的最低铅离子浓度为0.1mmol/L,而CAT为0.5mmol/L,当Pb2+浓度为1mmol/L时,LDH活性降至10%左右,而CAT仅下降50%左右.对重金属离子浓度与酶活性的定性和定量分析为有效监控鱼类生存环境提供了有价值的参考资料. 成嘉 符贵红 刘芳 唐建洲 李基光 张建社关键词:铅 鲫鱼 乳酸脱氢酶 Effect of lead on cytoskeletal protein stability in crucian carp Carassius auratus 2008年 无机的铅(Pb ) 是最普通的环境污染物质之一。许多证据显示 Pb 暴露能直接影响鱼生长和开发。在这研究,我们在鲫鱼鲤鱼 Carassius auratus 在蛋白质和 mRNA 水平在细胞骨架蛋白质稳定性上调查了 Pb 的细胞毒素的效果。Pb (在 100 μmol/L 的集中的 3 )2 处理都没导致 α 导管素和 β-tubulin 的减少的表示但是是的 γ-tubulin 有 SDS 页,西方的污点,和 ELISA 的 assayed。在 vivo 并且在 vitro,导管素的蛋白质表示上的分析是一致的。mRNA 表示上的 Pb 的效果在不同纸巾之中变化了。我们的结果建议在蛋白质翻译水平的 Pb 的 cytotoxicity 比在 mRNA 表示水平强壮。 成嘉 张东裔 褚武英 刘芳 刘臻 周瑞雪 蒙涛 张建社关键词:微管蛋白 MRNA 蛋白质稳定性 鳜和鲢肌肉蛋白质氨基酸组成及其蛋白质组成的比较分析(英文) 被引量:25 2007年 采用高压液相色谱和二维电泳方法,对鳜和鲢肌肉组织蛋白质组成成分以及肌肉蛋白质双向电泳分布图谱进行了比较研究。研究结果证明,鳜肌肉组织蛋白质干重为34.7%,而鲢肌肉干重为33.6%;鳜肌肉组织中必需氨基酸含量和鲜味氨基酸(天冬氨酸和甘氨酸)均高于鲢。同时,将两种鱼肌肉蛋白进行2D-gel双向电泳分离,发现鳜和鲢肌肉蛋白质组成和分布也存在明显的差异。本研究将肌肉蛋白质组成成分和蛋白的双向电泳技术结合起来,进行蛋白质组分归类分析,可为进一步研究两种鱼肌肉肉质研究打下基础,为水产业提供有价值的参考,为鱼类的养殖和肉质的改良、利用提供一个指标。 唐建洲 张东裔 成嘉 刘芳 符贵红 张建社关键词:氨基酸 蛋白质组成 二维电泳 3种鳜属鱼生长激素基因差异的检测与分析 被引量:2 2008年 为探索鳜(Siniperca chuatsi)、大眼鳜(S.kneri)、斑鳜(S.scherzeri)生长性状差异与基因差异间的联系,以3种鳜野生群体为材料,采用PCR-SSCP分析及测序方法,对3种鳜野生群体的生长发育相关基因——生长激素(GH)基因的差异进行了检测。结果表明,在生长激素基因5′侧翼区至第2外显子区域检测到4种多态型,均为群体特有多态型;在第2内含子3′段至第3内含子5′段区域检测到5种多态型,其中3种为群体特有多态型;在第4外显子至第5外显子5′段区域及第5外显子3′段至3′侧翼区均检测到4种多态型,均有3种为群体特有多态型。对各多态型编码区的分析表明,斑鳜与鳜、大眼鳜在GH第150位氨基酸位点存在差异。在该位点,斑鳜编码蛋氨酸(M),鳜、大眼鳜均编码亮氨酸(L)。各区域多态型共组合成9种GH基因型,3种鳜间无共有基因型。GH基因遗传分化指数(Fst)为0.8598,分化程度较高。遗传多样性分析显示,斑鳜GH基因遗传多样性高于鳜和大眼鳜。3种鳜属鱼GH基因相似度比较结果显示,鳜与大眼鳜的相似度最高,鳜与斑鳜的相似度最低。研究结果可为进一步利用GH基因差异进行鳜分子育种研究提供依据。 刘峰 刘臻 鲁双庆 张建社 谢新民 唐建洲 匡刚桥关键词:GH基因 遗传分化 PCR-SSCP 鳜鱼和鲢鱼不同组织微管蛋白表达差异分析研究 被引量:2 2007年 采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,Western-blotting和酶联免疫反应技术(ELISA),对三种微管蛋白(α,β,γ-tubulin)在鳜、鲢两种鱼的脑、心、脾、肾四种组织中的表达差异进行了比较.实验表明:鳜鱼α-tubulin的表达在心、脑、脾、肾中逐渐减弱;β-tubulin含量的递减顺序为脑、心、肾、脾;而脾、肾、脑、心中γ-tubulin的表达量依次减小.鲢鱼中三种微管蛋白的表达依次为:肾、脑、心、脾(α-tubulin);肾、脾、心、脑(β-tubulin),肾、脾、脑、心(γ-tubulin).两种鱼之间不同组织中的三种微管蛋白在量上的差异也较为明显.研究结果说明微管蛋白的表达具有明显的种属和组织差异性,这种差异性可能与其组织功能相关. 符贵红 成嘉 刘芳 肖调义 张建社关键词:鳜鱼 鲢鱼 微管蛋白 SDS-PAGE 酶联免疫反应