广东省医学科学技术研究基金(2003A710)
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 相关作者：庾蕾黄海雄庄志雄叶小明谢富焕更多>>
- 相关机构：深圳市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划广东省医学科学技术研究基金深圳市科技计划项目更多>>
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- 用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性被引量：4
- 2006年
- 目的了解中国人群肿瘤坏死因子α(thetumournecrosisfactorα,TNF-α)基因启动子区多态性。方法随机选取20名深圳地区汉族健康体检者,采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区(-1389nt～+125nt),对PCR产物进行序列分析,寻找单核苷酸多态性位点(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)。采用TaqmanMGB探针建立了-857nt(C/T)位点的实时定量PCR(thereal-timePCR)分型方法,并对中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体共1108份样本进行了基因分型。结果在启动子区(-1322nt～+67nt),发现6个SNP位点,即-885(A/G)、-863(C/A)、-646(G/A)、-648(G/A)、-568(G/C)和-857(C/T),其中位点-646nt(G→A)为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同,但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt(C/T)位点基因型频率分别为0.79(CC),0.19(CT)和0.02(TT),中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0.116,与文献报道的韩国人群相同,但比日本人群低。结论中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用TaqmanMGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确,易于自动化,为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。
- 庾蕾庄志雄谢富焕黄海雄叶小明
- 关键词：多态性肿瘤坏死因子Α单核苷酸多态性实时定量PCRTAQMAN
- 三氯乙烯药疹样皮炎患者肿瘤坏死因子α-857C/T基因多态性研究被引量：4
- 2006年
- 目的从肿瘤坏死因子α(TNFα)基因-857位点多态性角度探讨三氯乙烯药疹样皮炎易感的遗传背景。方法采用TaqManMGB探针,建立TNFα-857C/T位点实时定量聚合酶链反应分型方法。用该方法对三氯乙烯药疹样皮炎组(47例)及对照组(53例)进行-857nt(C/T)位点分型,比较病例组与对照组之间各基因型及等位基因频率是否有差异。结果TNFα-857C/T多态的基因型及等位基因频率在三氯乙烯药疹样皮炎组及对照组差异无显著性(P>0.05)。结论TNFα-857C/T位点多态可能不是中国人群三氯乙烯药疹样皮炎的风险因子。
- 庾蕾庄志雄叶小明黄海雄杨淋清
- 关键词：三氯乙烯药疹样皮炎肿瘤坏死因子Α单核苷酸多态性
