国家科技支撑计划(2006BDA14B06)
- 作品数：24 被引量：110H指数：6
- 相关作者：陈国宏徐琪赵文明张海波张依裕更多>>
- 相关机构：扬州大学贵州大学江苏农牧科技职业学院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家科技重大专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 白羽番鸭脂联素基因SNP与肌内脂肪和血清总胆固醇的关联分析被引量：6
- 2011年
- 采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因全编码区和内含子进行多态性检测,并分析其多态对肌内脂肪(IMF)和血清总胆固醇(TC)的遗传效应,为番鸭分子标记辅助选择提供参考。结果表明:3个SNP分别在外显子1和外显子2的编码区发生A167G和G711A突变,为沉默突变,在内含子发生C290T突变;3个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),均表现为中度多态;关联分析表明,在A167G位点中,AA基因型个体的IMF和TC显著高于BB基因型个体(P<0.05);在C290T位点中,CC基因型个体的IMF显著高于TT基因型个体(P<0.05);其他各位点的各基因型与各性状间没有达到显著性差异(P>0.05)。该研究结果揭示,A167G和C290T位点对脂肪沉积可能有显著性的遗传效应,可作为番鸭的分子育种标记。
- 张依裕徐琪段修军张海波赵文明孙国波陈国宏
- 关键词：脂联素基因SNP白羽番鸭
- 如皋鸡EX-FABP基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的相关分析被引量：6
- 2010年
- 以60周龄和自繁后的12周龄的如皋鸡作为试验材料,采用PCR-SSCP技术对细胞外脂肪酸结合蛋白(EX-FABP)基因进行单核苷酸多态性及遗传特异性分析。结果检测到2个SNP突变,分别为4271 G/A、4281 G/A突变,有3种基因型。最小二乘差异显著性检验结果表明,在60周龄时,AA型含量最高,显著高于AB型(P<0.05);12周龄时,AB型含量最高,BB型最低;60周龄的肌内脂肪含量显著低于12周龄时的含量(P<0.05)。
- 周琼常国斌王克华窦套存廖菁陈国宏
- 关键词：单核苷酸多态性肌内脂肪
- 金定鸭Apo VLDLⅡ基因多态性及其与生产性能的关联分析
- 根据鸡和鸭Apo VLDLⅡ基因序列设计3对特异性引物对金定鸭外显子1、外显子2和外显子4编码区进行扩增,利用PCR-SSCP方法检测单核苷酸多态及其对体重、体尺、屠体、肉质、总蛋白、血清甘油三酯和总胆固醇的遗传效应,结...
- 张依裕徐琪张海波段修军孙国波陈国宏
- 关键词：金定鸭PCR-SSCP
- 文献传递
- 鸭脂蛋白脂酶基因内含子5多态性及其与肉质和脂肪性状的关联分析被引量：3
- 2009年
- 根据鸡脂蛋白脂酶(LPL)基因序列设计引物对樱桃谷鸭和苏牧麻鸭LPL基因内含子5进行PCR-SSCP检测,并分析其多态对肉质和脂肪性状的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型:AA、AB和BB,1个双碱基突变:243～244bp(TA→AT),2个SNP:G265A和G269A;该座位在2个群体中均为中度多态,并偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),基因型分布差异显著(P<0.05);在樱桃谷鸭群体中,AB型个体的pH值显著高于AA型,失水率显著高于BB型(P<0.05);苏牧麻鸭中AB型个体的总胆固醇显著高于AA和BB型个体(P<0.05)。
- 张依裕徐琪段修军张海波孙国波赵文明陈国宏
- 关键词：家鸭LPL基因
- 白羽番鸭脂联素基因内含子多态与肉质的关联分析被引量：3
- 2010年
- 采用PCR-SSCP法对白羽番鸭脂联素基因内含子进行SNP检测,并分析SNP对肉质的遗传效应。结果表明,检测到3种基因型(CC、CT和TT)和2个等位基因(C和T),CT和C分别为优势基因型和优势等位基因。序列比对发现,在内含子内存在1个SNP位点T290C,该位点在白羽番鸭群体中表现为中度多态,处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);最小二乘法分析表明,CC基因型个体的IMF显著高于TT基因型个体(P<0.05),失水率极显著低于TT基因型个体(P<0.01);CT基因型个体的失水率显著低于TT基因型个体(P<0.05)。结果揭示,T290C位点可能对脂肪沉积有显著影响,CC基因型是白羽番鸭肉质较为优良的基因型。
- 张依裕徐琪段修军张海波赵文明孙国波陈国宏
- 关键词：白羽番鸭脂联素基因PCR-SSCP
- 鹅甲状腺素应答蛋白α基因外显子2的多态性研究被引量：2
- 2010年
- 为了解鹅THRSPα基因多态性,根据鸭THRSPα基因序列,设计引物扩增籽鹅、皖西白鹅、浙东白鹅和狮头鹅THRSPα基因外显子2,运用PCR-SSCP技术进行单核苷酸多态性分析。结果共检测到3个等位基因,6种基因型。测序结果表明,鹅THRSPα基因外显子2存在6个SNP位点。各品种中等位基因A占绝对优势。卡方检验结果表明,4个鹅群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。试验结果证实,鹅THRSPα基因第2外显子存在序列多态性。
- 乔娜赵荣雪徐琪程金花赵文明陈国宏
- 关键词：THRSPΑ基因PCR-SSCP
- 籽鹅GH基因内含子3多态性及其与体重和屠体性状的关联分析被引量：23
- 2008年
- 根据鸭生长激素基因内含子3的序列设计引物,利用PCR-SSCP方法对籽鹅进行了单核苷酸多态性分析,并检测其多态性。结果表明,籽鹅生长激素基因内含子3长约364 bp,共发现了7个突变位点,分别为A160G、C167G、T264C突变,以及AA型个体在176、177位点G、A碱基缺失和BB型个体在231、232位点C、T碱基缺失。产生AA、AB和BB 3种基因型,其中BB基因型为优势基因型,且基因型频率表现为BB>AB>AA;卡方检验结果表明,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。不同基因型与体重和屠体性状的关联分析结果表明:BB基因型个体的7周龄体重、9周龄体重、10周龄体重、胸肌重、胸肌率及心脏重显著高于AA型个体(P<0.05);BB基因型个体8周龄体重显著高于AB型个体(P<0.05);在所分析的性状中,BB基因型个体的均值最大,AB型次之,AA型最小。
- 赵文明陈清程金花吴信生陈国宏
- 关键词：籽鹅生长激素基因体重屠体性状
- 鹅PIT-1基因启动子区转录调控的研究被引量：1
- 2012年
- 为研究垂体特异性转录因子(Pituitary transcription factor 1,PIT-1)启动子的转录调控机制,寻找该基因转录调控的顺式作用元件、反式作用因子和基本转录单位。利用前期染色体步移技术扩增得到鹅PIT-1基因的启动子区序列,经PCR扩增,定向亚克隆至荧光素酶表达载体pGL3-Basic中,把目的片段连接到荧光素酶报告基因载体(pGL-Basic),制备了一系列启动子缺失体(-1 485/-1bp、-1 293/-1bp、-1 014/-1bp、-775/-1bp、-561/-1bp、-353/-1bp和-206/-1bp),并通过限性内切酶酶切、PCR及测序进行鉴定,构建了含有正确目的基因的报告基因重组体,然后瞬时转染GH3细胞,利用荧光素酶报告基因检测试剂盒检测。本试验所克隆的PIT-1基因启动子区具有明显的启动子活性,其中-561/-1bp的启动活性最强,该区域存在有PIT-1、POU3F2、myogenin和GR等多个转录因子结合位点。利用系列缺失法成功构建了荧光素酶报告基因真核表达载体,并且验证了克隆的启动子具有启动活性,找到了正负调控区域及核心启动子区,为进一步研究其转录调控机制奠定了基础。
- 赵荣雪赵文明徐琪段修军董飚孙国波毕瑜林李秀张扬黄正洋陈国宏
- 关键词：PIT-1基因启动子转录调控
- 利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性被引量：7
- 2009年
- 利用20对微卫星标记对长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤3个鲤鱼群体的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果表明:3个群体在20个位点上分别检测到108、164、154个等位基因,各群体等位基因数2~16个不等,平均有效等位基因数分别为4.496、5.695和5.606。3个群体平均期望杂合度分别为0.769、0.806、0.801,多态信息含量分别为0.703、0.761和0.757,遗传多样性指数分别为0.764、0.803和0.799,群体间遗传分化系数为0.071。结果说明3个群体遗传多样性较为丰富。
- 孙莉杨国梁王军毅吴婷婷张海波吴添文陈国宏
- 关键词：锦鲤微卫星
- 鸭A-FABP基因内含子1多态性与肌内脂肪和血清甘油三酯含量相关研究被引量：2
- 2010年
- 本研究旨在探讨鸭脂肪型脂肪酸结合蛋白(Adipocyte Fatty Acid-Binding Protein,A-FABP)基因部分序列多态与鸭肌内脂肪和血清甘油三酯含量关系。根据鸭A-FABPmRNA序列和鸡A-FABP基因组序列设计1对引物扩增鸭A-FABP基因内含子1序列。同时根据扩增产物设计4对引物,利用PCR-SSCP对鸭A-FABP基因部分序列进行多态性研究并探究序列多态性与鸭肌内脂肪和血清甘油三酯含量的关系。结果表明:克隆序列包含鸭A-FABP基因外显子1、2部分序列和完整的内含子1序列,与鸡A-FABP基因内含子1同源性为75.1%;经SS-CP检测,发现引物P1扩增片段有3处碱基突变,引物P3有6处碱基突变,这些突变分别产生了3种和8种基因型。在P1位点樱桃谷鸭和苏牧麻鸭偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),金定鸭基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),在P3位点3个群体均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。同时,这些基因型在不同群体中分布存在显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01)。最小二乘分析显示,肌内脂肪和血清甘油三酯含量在各群体中有显著差异(P<0.05),P1和P3位点各基因型对肌内脂肪含量无显著影响(P>0.05),仅在P3位点CD基因型个体血清甘油三酯含量显著高于其他基因型个体(P<0.05)。结果提示,鸭A-FABP基因内含子1多态对血清甘油三酯含量有一定影响,但是否影响鸭肌内脂肪沉积,还需进一步研究。
- 张海波徐琪张依裕段修军孙莉陈国宏
- 关键词：A-FABP基因肌内脂肪血清甘油三酯
