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国家重点实验室开放基金(2008-8)
国家重点实验室开放基金(2008-8)
作品数:
1
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相关作者:
严历
郭力
李晓霞
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2010
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分子动力学模拟软件GROMACS向GPGPU移植初探
被引量:1
2010年
GROMACS是著名分子动力学模拟软件之一,GPGPU技术能够使用图形处理器完成通用计算,是高性能计算的最新发展趋势。本文通过对Nvidia CUDA GPGPU编程模式以及GROMACS代码的研究分析,论证了将GROMACS移植到以GPGPU为计算核心的平台上的可行性,并通过算法和参数数据组织形式的改造实现了GROMACS中非键力计算函数从x86处理器向GPGPU的移植,获得显著的性能提升,计算加速比达到10倍以上,为GROMACS整体移植的实现奠定了基础。
严历
郭力
李晓霞
关键词:
分子动力学
GROMACS
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