国家自然科学基金(30700610)
- 作品数：4 被引量：19H指数：3
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- 两株蛋白核小球藻rbcS cDNA全序列的克隆和分析被引量：4
- 2010年
- 以2株蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)F-9和820为实验材料,根据已知绿藻rbcS基因设计简并引物,分别克隆到2条245bp的cDNA片段,以此片段为基础使用cDNA末端快速扩增(RACE)技术,获得了2条长度分别为861bp和907bp的rbcS基因。序列分析表明,蛋白核小球藻F-9和820的rbcS分别编码181和184个氨基酸,编码区具有与高等植物rbcS保守序列YYDGRYWTMWKLPMFG相类似的结构,起始密码子附近有Kozak保守序列(A/GXXATGG),3′非翻译区有加尾信号TGTAA。同源性分析结果表明,F-9与蛋白核小球藻(GenBank登录号BAE48226)的相似性最高(91%),而F-9与820、F-9和普通小球藻(C.vulgaris)的相似性分别为64%和50%。这2条rbcS基因与其他绿藻和高等植物也表现了广泛的同源性,但相似性不高。该研究旨在为rbcS基因的功能和表达研究奠定基础。
- 李春燕孙雪杨锐
- 关键词：蛋白核小球藻RBCSRACE
- 蛋白核小球藻核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶小亚基部分基因序列的克隆与分析被引量：9
- 2008年
- 以单细胞绿藻蛋白核小球藻(Chlorella pyrenoidosa)(藻株编号为NMBluh015-1)为实验材料,利用几种绿藻中的核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加氧酶(Rubisco)的小亚基(rbcS)的保守序列,设计简并引物,克隆到rbcS的一条cDNA(245 bp)和3条DNA序列(其编号为CP1、CP2和CP3,长度依次为1425 bp、810 bp、705 bp)。序列比较结果表明,该蛋白核小球藻rbcS cDNA核苷酸序列与普通小球藻(C.vulgaris)、杜氏藻(Dunaliella tertiolecta)(rbcS1和rbcS2)及蛋白核小球藻"太阳小球藻"株的相似性依次为93%、92%(91%)和90%,而其编码的氨基酸序列与杜氏藻相似性最高(80%);3条rbcS DNA序列与绿藻及高等植物rbcS部分序列表现了较高的同源性,其中2条DNA(CP2和CP3)部分区段同源性很高。实验结果表明扩增得到的cDNA和DNA序列为蛋白核小球藻rbcS基因。
- 孙雪马斌周成旭
- 关键词：同源性
- 蛋白核小球藻psbA基因的克隆及其在自养和异养培养的表达变化被引量：1
- 2011年
- psbA基因是高等植物和藻类中介导光合电子传递D1蛋白的编码基因,该基因受光照等因素的调控。以单细胞绿藻蛋白核小球藻为材料,克隆了psbA全编码序列并用荧光定量PCR的方法研究了自养和异养藻psbA基因转录水平的变化,以揭示不同培养方式下psbA基因表达变化规律。结果克隆到2 595 bp psbA序列,包括676 bp的5'-非翻译区和857 bp的3'非翻译区。该psbA基因开放阅读框编码353个氨基酸,A+T百分含量为58.0%,其成熟的D1蛋白加工方式与高等植物高粱相似。荧光定量结果表明,自养藻在光周期内psbA基因表达量先升高后下降,而异养藻psbA表达变化不明显。从自养转为异养2 h时psbA表达量略有升高,4 h后下降至转化前的0.41倍并缓慢下降,而从异养转为自养psbA表达量增加,4 h时增加至1.69倍,4 h后趋于稳定。不同浓度光合抑制剂DCMU降低自养小球藻psbA转录活性至未添加组的40%～59%,而不同程度地促进了异养藻psbA的转录表达。
- 孙雪吴晓微徐年军杨锐
- 关键词：蛋白核小球藻PSBA基因荧光定量PCR
- 小球藻核rDNA ITS与叶绿体rbcL基因序列分析及应用被引量：6
- 2009年
- 用核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）和叶绿体rbcL基因对小球藻属（Chlorella）6株小球藻的种间和种内关系进行了分析。克隆序列与GenBank数据库检索到的相关小球藻序列（ITS和rbcL序列各为15条）一起进行比较分析。结果显示：ITS序列长度在小球藻种内高度保守，在种间变异较大；而rbcL序列长度在种间和种内水平都高度保守。15株小球藻ITS序列间遗传距离在0．000～0．663之间；而15株小球藻rbcL序列间距离在0．000～0．216之间。6株实验藻中原始小球藻F-2与蛋白核小球藻F-5、F-9近似种内关系；蛋白核小球藻820与普通小球藻Cvq亲缘关系极近；椭圆小球藻Ce与其它5株小球藻亲缘关系最远。研究表明将变异程度较高的核ITS序列与相对保守的叶绿体rbcL基因相结合可以用于小球藻系统发生分析和分子鉴定。
- 孙雪吴晓微李兴文裴鲁青
- 关键词：小球藻内转录间隔区RBCL基因种间关系
