北京市自然科学基金(5982006)
- 作品数：5 被引量：43H指数：3
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- 茄子品种遗传多样性的RAPD检测与聚类分析被引量：20
- 2007年
- 用RAPD分子标记的方法对来自不同国家的34份茄子品种进行遗传多样性分析,从120条RAPD引物中筛选出有效的22条引物分别对34份茄子品种进行扩增,共检测出232个等位基因位点,每条引物平均检测出10.5个,其中192个为多态位点,多态位点比率为82.76%。POPGENE结果分析表明,Nei's基因多样性H为0.2756,Shannon指数为0.4145,显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331～0.805,根据Jaccard相似系数和组内连接法建立的系统聚类图,34份茄子大致可分为两大类型:圆茄类型和长茄类型,这与经典的形态学分类基本上相符,从而从分子水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。
- 王秋锦高杰孙清鹏杨爱珍赵福宽
- 关键词：RAPD茄子聚类分析
- 茄子IRAP分子标记体系的建立与优化被引量：9
- 2008年
- 为确保茄子IRAP反应结果的稳定性和重复性,进而为茄子遗传多样性分析和品种鉴定提供可靠的新方法,按照已报道的马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计IRAP引物,以茄子品系HL-01为试材,对影响茄子IRAP反应的重要因素进行了初步研究,建立并优化了茄子IRAP分子标记技术体系。优化的茄子IRAP分子标记体系为:20(l反应液中,10×反应buffer(100mmol/L Tris-HCl,100mmol/L KCl,80mmol/L(NH4)2SO4,pH9.0,NP-40)2μl,2mmol/L MgCl2,0.2mmol/L dNTPs,Taq-l.0U,0.4μmol/L引物,DNA模板50ng。PCR反应程序为:94℃预变性4min,然后按94℃变性30s,45℃退火30s,72℃延伸2min,进行32个循环,最后72℃延伸10min。
- 赵海艳王秋锦孙清鹏杨爱珍赵福宽
- 关键词：茄子分子标记IRAP
- 茄子反转录转座子基因片段的克隆及序列分析
- 2006年
- 根据己报道的反转录转座子的序列设计合成一对特异引物,以西安绿茄基因组DNA为模板,采用PCR扩增的方法扩出一条DNA特异片段并克隆到pMD18-T载体中.用PCR法和酶切分析法对克隆片段进行鉴定并进一步进行核苷酸序列分析.序列测定该片段长为518 bp.用GenBank中的BLAST程序分析表明,该片段与马铃薯(Solanum demissum)反转录转座子的gag-pol聚合蛋白90-243aa区域氨基酸同源性为43%.
- 赵海艳孙清鹏秦勇赵福宽
- 关键词：茄子反转录转座子克隆
- 茄子抗冷细胞变异体的RAPD分析及自交一代株系的抗冷性鉴定被引量：15
- 2003年
- 以茄子品系E 9903花药低温胁迫培养获得的抗冷细胞变异体为试材,用SDS方法从茄子幼嫩叶片提取DNA,选用40个长度为10个碱基的寡聚核苷酸(OPK01-OPK20,OPJ01-OPJ20)作为RAPD引物进行PCR扩增反应,并测定抗冷细胞变异体自交一代株系的冷害指数。结果表明:以OPK12为PCR反应引物时RAPD扩增谱带在抗冷性植株与同品系的对照株之间存在多态性差异,抗冷细胞变异体自交一代株系的冷害指数显著低于同品系的对照。
- 赵福宽高遐虹程继鸿范双喜于颖
- 关键词：茄子变异体RAPD分析抗冷性鉴定
- 茄子反转录转座子基因片段克隆中的2种DNA回收方法的效果比较
- 2006年
- 根据已报道的反转录转座子的序列设计合成一对引物,以西安绿茄基因组DNA为模板,采用PCR扩增的方法扩出一条DNA特异片段并克隆到pMD18-T载体中。采用一种新建立的在可见光下参照位置标记方法回收目的DNA片段,并与常规的在紫外光下回收的目的DNA片段进行了克隆效果比较。结果表明,在紫外光下回收的茄子反转录转座子基因片段易出现目的DNA片段断裂,而在可见光下参照位置标记回收DNA的方法能保证目的DNA片段的完整性。
- 赵海艳孙清鹏秦勇赵福宽
- 关键词：茄子反转录转座子克隆回收方法
