福建省自然科学基金(B0320002)
- 作品数：4 被引量：17H指数：3
- 相关作者：刘华清王锋陈建民胡昌泉张晖更多>>
- 相关机构：福建师范大学福建省农业科学院福建农林大学更多>>
- 发文基金：福建省自然科学基金福建省科技重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 一个水稻胚乳特异表达基因的筛选及初步分析被引量：3
- 2009年
- 从一个水稻启动子捕获突变群体中筛选到一个T0及T1代GUS组织化学检测均表现胚乳特异表达的启动子捕获系w9101,其T0、T1代自交后代标记基因分离规律及Southern blot分析表明它是一个单T-DNA插入的启动子捕获系;通过TAIL-PCR获得其T-DNA插入的侧翼序列,并在NCBI上对其侧翼序列进行比对,发现该捕获系T-DNA插入位点位于一个推测的肽转运子基因(暂命名为Peptide transporter 9101,PTR9101)启动子内;w9101不同发育时期不同组织RT-PCR检测表明,PTR9101为胚乳特异性表达基因;生物信息学分析表明PTR9101蛋白整条肽链表现疏水性,其跨膜区域和CHL1(The Nitrate TransporterAtNRT1.1)一样有12个α-螺旋跨膜区,因此推测PTR9101是一个肽转运子基因。
- 张晖胡昌泉刘华清李素一刘次桃潘大仁王锋
- 关键词：水稻胚乳
- 三个基于水稻明恢86的SSR电子遗传图谱的构建被引量：11
- 2008年
- 本研究利用1103对SSR引物(其中716对来自已报道的SSR引物,387对新开发SSR引物)对明恢86与93-11、02428和中花15的多态性进行PCR分析,结果分别检测到多态性标记281个、473个和470个,多态性频率分别为25.48%、42.88%和42.61%。根据各标记在染色体上的电子遗传距离,利用Mapdraw.evenmarker软件,构建了3张基于明恢86的SSR电子遗传图谱。其中明恢86与93-11的标记间平均距离为5.3cM,而明恢86与02428和中花15的标记间平均距离仅都约为3.2cM。这3张高密度的电子遗传图谱的构建,为高通量初步定位明恢86背景下突变体基因创造了条件,同时也为另外3个水稻品种突变体基因的图位克隆提供了方便。
- 黄燕娟华亚鹏刘华清苏军陈建民王锋
- 关键词：水稻SSR图位克隆
- 一个水稻短生育期突变体sgp(t)的遗传分析及基因定位被引量：4
- 2008年
- 在优良迟熟恢复系明恢86的转基因后代中,发现了一个非T-DNA插入引起的短生育期突变体(暂命名short growth period,简称sgp(t)).该突变体对光周期反应不敏感,在不同生态区域与不同播种期,平均抽穗期(40.9±2.1)～(62.4±5.2)d,比野生型明恢86早35～50d.通过对sgp(t)突变体与29个不同遗传背景的亲本(包括感光和非感光的籼稻、粳稻及爪哇稻品种)杂交后代抽穗期分析,结果发现,在福州市夏季种植(4月30日播种),F1抽穗均表现较迟熟亲本早,而较sgp(t)略迟,平均抽穗期(52.0±1.3)～(63.4±2.3)d,表明sgp(t)是一个不完全显性突变体,能够显著地缩短水稻的生育期.进一步分析sgp(t)突变体与野生型明恢86,93-11,闽恢3301和博白B等4个品种的杂种F2群体抽穗分布发现,分离群体后代中出现极早熟、较早熟和迟熟3种类型,其极早熟和较早熟植株数之和与迟熟植株数之比符合3:1,进一步表明sgp(t)由一对不完全显性基因控制.以F2代(sgp(t)×93-11)中的极早熟株和迟熟株为定位群体,应用微卫星标记将sgp(t)基因定位在第6染色体的RM3628和RM439之间,随后利用已经公布的水稻基因组序列,在sgp(t)基因附近区域新开发了6个标记,将sgp(t)基因进一步定位在NSSR0617～NSSR0683之间,遗传距离分别为0.5和0.6cM,物理距离约436kb.定位结果显示sgp(t)不同于目前报道的所有早熟和迟熟基因,是一个控制水稻生育期的新基因.
- 刘华清顾丽清吴明基陈建民陈在杰王锋
- 关键词：水稻抽穗期基因定位
- 利用水稻启动子捕获系筛选水稻胚发育相关基因的初步研究
- 2009年
- 通过对2227个启动子捕获系中报道基因β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,gus)表达活性检测,筛选到7个水稻胚中表达GUS活性的启动子捕获系,对其中编号为W9154的捕获系作了进一步分析。Southern杂交分析表明W9154是一个单拷贝T-DNA插入系,其T-DNA插入在水稻基因组第3号染色体上一个未知蛋白基因的第2个内含子中。对该未知蛋白基因上游调控序列生物信息学分析显示,其调控序列除含有TATA-box和CAAT-box等常见启动子元件外,还含有RY基序、E盒、G盒及AACA等种子特异性启动子的特征性元件。表达特征分析发现,编码上述未知蛋白的基因在野生型水稻的胚和茎中表达,这与捕获系W9154中GUS表达活性完全一致。这些表明启动子捕获系w9154捕获的候选基因可能是一个水稻胚发育相关基因。
- 胡昌泉李素一刘华清刘次桃张晖潘大仁王锋
- 关键词：水稻
