福建省教育厅B类科技/社科项目(03BC727)
- 作品数：1 被引量：9H指数：1
- 相关作者：陈由强叶冰莹黄祖新黄镇更多>>
- 相关机构：福建师范大学教育部更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目公益性行业(农业)科研专项福建省教育厅B类科技/社科项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 宿根甘蔗根际土壤细菌多样性分析中培养法与非培养法比较研究被引量：9
- 2011年
- 采用培养法和非培养法提取甘蔗根际土壤微生物的总DNA,基于通用引物PCR扩增构建两种方法的细菌16SrDNA文库,并进行核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDRA),通过部分克隆序列测定构建细菌克隆文库的系统发育树,进而对基于传统的细菌平板培养法和直接提取总细菌DNA的非培养法进行比较分析.结果显示,非培养法文库的香侬–威纳指数、辛普森指数、丰富度分别为4.94、0.998、28.91,均高于培养法文库中相应的多样性参数(分别为4.27、0.996、16.79),均一度数值都>0.95.结合统计学数据和序列测定信息,反映出甘蔗根际土壤存在着丰富的细菌多样性,但平板培养法所展现的多样性低于直接提取法,表明前者存在着很大的局限性,而非培养法文库中主要是未培养微生物的16S rDNA序列,这从一个侧面反映了土壤样品中未培养微生物占很大比例.因此,在土壤微生物群落研究中,必须结合新的分子生态学技术手段,如采用直接提取总DNA的方法进行研究,才能比较全面地认识土壤微生物多样性.
- 黄祖新黄镇叶冰莹陈由强陈如凯
- 关键词：甘蔗根际土壤微生物细菌群落ARDRA
