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国家重点基础研究发展计划(2010CB126205)

作品数:6 被引量:48H指数:5
相关作者:徐建红薛庆中张传溪李欣卢凯更多>>
相关机构:浙江大学中山大学更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 6篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 4篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 3篇基因
  • 3篇基因组
  • 2篇植物
  • 2篇功能基因
  • 2篇功能基因组
  • 1篇代谢
  • 1篇代谢产物
  • 1篇代谢组学
  • 1篇稻瘟
  • 1篇稻瘟病
  • 1篇稻瘟病菌
  • 1篇稻纹枯病
  • 1篇遗传学
  • 1篇数据处理
  • 1篇数据库
  • 1篇水稻
  • 1篇水稻挥发物
  • 1篇水稻纹枯病
  • 1篇水稻纹枯病菌
  • 1篇糖苷

机构

  • 5篇浙江大学
  • 1篇中山大学

作者

  • 3篇薛庆中
  • 3篇徐建红
  • 2篇张传溪
  • 1篇解晓军
  • 1篇周强
  • 1篇周嘉良
  • 1篇戚舒
  • 1篇王庭璋
  • 1篇胡望雄
  • 1篇卢凯
  • 1篇李欣
  • 1篇周国艳
  • 1篇单杲
  • 1篇刘秋香

传媒

  • 2篇遗传
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇科学通报
  • 1篇浙江大学学报...
  • 1篇Journa...

年份

  • 2篇2015
  • 2篇2014
  • 2篇2013
  • 1篇2010
6 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
被子植物DNA去甲基化酶基因的进化分析被引量:6
2014年
DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用,而DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化过程中起到关键作用。文章以已知的10个DNA去甲基化酶基因为参照,鉴定出两种单子叶植物(水稻和高粱)、两种双子叶植物(拟南芥和毛果杨)中所有的DNA去甲基化酶同源基因,其中新鉴定出两类DNA去甲基化酶类似基因DML4和DML5。基于保守的糖苷酶结构域序列的系统进化分析以及基因在染色体上的位置分析表明,植物中DNA去甲基化酶基因存在串联复制、染色体区段复制和全基因组复制而导致基因的新功能化和亚功能化。文章还进一步分析了DNA去甲基化酶基因在不同组织中的表达情况,旨在理解DNA去甲基化酶基因的功能与进化的关系,以期为DNA去甲基化酶基因在植物中的利用提供参考。
刘秋香薛庆中徐建红
关键词:进化
中国农业昆虫基因组学研究概况与展望被引量:18
2015年
昆虫种类繁多,变异惊人,是地球上最大的动物类群,其中不少种类是农业上的重要害虫或益虫。自从2000年黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因组发表以来,当代的昆虫学研究已经越来越多地依赖于从基因组和转录组所获得的信息。为了更好地理解昆虫生物学特性和增强应对那些严重影响人类健康、粮食供应和经济安全的各种卫生、农林害虫的能力,更好地利用那些在维持自然和农业生态系统不可或缺的昆虫以及那些为人类提供丝、蜂蜜和药品的昆虫,需要了解它们的基因组和转录组信息。目前世界上已经有50多种昆虫的基因组被报道,近10年来中国科学家也已经完成了家蚕(Bombyx mori)、小菜蛾(Plutella xyllostella)、东亚飞蝗(Locusta migratoria manilensis)、榕小蜂(Ceratosolen solmsi)和褐飞虱(Nilaparvata lugens)的基因组测定和分析,还有一批重要农业昆虫的基因组正在分析中,这其中包括烟粉虱(Bemisia tabaci)、斜纹夜蛾(Spodoptera litura)、二化螟(Chilo suppressalis)、白背飞虱(Sogatella furcifera)、灰飞虱(Laodelphax striatellu)和若干寄生蜂种类。自从2010年中国率先在国际上报道了2种昆虫(烟粉虱和褐飞虱)的转录组和表达谱以来,短短几年仅国内就已经有上百个昆虫转录组得到分析。同时,家蚕、东亚飞蝗和褐飞虱的功能基因组研究也取得了很大的进展,例如,用40个品系重测序揭示了家蚕在驯化过程中相关的基因变化,通过信号通路分析解析了东亚飞蝗散居型和群居型转换的分子机制,以及发现了2个胰岛素受体是控制稻飞虱长、短翅型可塑性发育的"分子开关"。在基因组和转录组基础上,通过基因功能的研究和挖掘,结合应用新的基因组定点编辑技术和RNAi技术,将使害虫的防治和益虫的利用出现革命性的变化。
张传溪
关键词:农业昆虫基因组功能基因组学
基因组规模DNA甲基化测序数据处理及其表观遗传分析被引量:5
2013年
鉴定DNA甲基化胞嘧啶(mC)并能制作基因组规模甲基化图谱的新方法——BS-Seq,最近已被开发,它是基于新一代高通量测序结合DNA亚硫酸氢盐转换技术,不仅可以从基因组规模洞察不同生物之间在DNA甲基化水平和模式上的差异,也能从不同基因组区域,包括基因、外显子、重复序列等方面,阐明DNA甲基化环境和核苷酸偏好上的保守性,加深理解DNA胞嘧啶(C)甲基化在调控基因表达和沉默转座子等重复序列中所起的表观遗传学影响。文章举例介绍了DNA甲基化位点数据预处理的具体步骤,通过处理分别将参考序列中的胞嘧啶(C)替换成胸腺嘧啶(T),鸟嘌呤(G)替换成腺嘌呤(A),而将读序列中的胞嘧啶(C)替换为胸腺嘧啶(T)。文章综述了全基因组DNA甲基化分析的主要内容,包括:(1)不同序列环境下的胞嘧啶甲基化;(2)全基因组上的甲基化的分布情况;(3)DNA甲基化环境和核苷酸的偏好;(4)DNA-蛋白质互作位点上的DNA甲基化;(5)不同基因结构元件的胞嘧啶甲基化程度。DNA甲基化分析技术为研究不同物种的表观基因组,环境和表观互作提供了强大的工具,并为进一步发展人体疾病诊断和治疗方法提供理论基础。
王庭璋单杲徐建红薛庆中
关键词:DNA甲基化数据处理表观遗传学
整合多个组学(omics)分析植物代谢产物及其功能被引量:7
2013年
对生物体在体内生命过程中产生的一系列代谢产物做全面分析将有助于揭示生物基因型和表型之间的联系。代谢组学是应用"组学",包括基因组学、转录组学和蛋白质组学,综合分析代谢产物的方法;通过使用先进的分析技术结合应用新一代测序和统计学方法来提取信息,对数据诠释,实现细胞代谢物识别和量化,从而理解生物体对环境刺激或基因干扰的生物学反应。今简介代谢组学的数据库资源及研究方法,并以最近3~5年的应用实例来诠释植物代谢组学最新进展,包括植物在非生物胁迫下的响应及代谢谱的变化,诱发突变和转基因事件对代谢谱的影响,代谢产物的鉴定及其进化。
周国艳胡望雄徐建红薛庆中
关键词:植物代谢组学转录组学数据库
Molecular Characterization and Functional Analysis of Krüppel-homolog 1(Kr-h1) in the Brown Planthopper, Nilaparvata lugens(Stl)被引量:2
2014年
The brown planthopper, Nilaparvata lugens(Stl), is the most serious insect pest of rice. It has developed high resistance to traditional insecticides because of their intensive use. Juvenile hormone(JH) analogs have been used successfully to control this species and other pest insects. However, the molecular mechanism of JH signaling is not well understood. Krüppel-homolog 1(Kr-h1) is a transcription factor involved in the JH pathway. In this study, the Kr-h1 cDNA was cloned and characterized from N. lugens by rapid amplification of cDNA ends(RACE) and reverse transcription PCR(RT-PCR). Its spatial and temporal expression profiles were examined by real-time quantitative PCR, and its function was also studied by RNA interference(RNAi). The open reading frame of NlKr-h1 is 1 833 bp encoding for 611 amino acids. The protein contains eight conserved zinc-finger motifs. NlKr-h1 was expressed at all life stages, with the highest mRNA level in the 4-day embryo. NlKr-h1 mRNA levels rose during each nymphal molt after the 2nd instar. In the adults, the mRNA level in males was significantly higher than that in females of either the macropterous or brachypterous type. The highest expression was observed in the female midgut. NlKr-h1 was activated by juvenile hormone III(JH III) in the 3rd-5th instar nymphs. Disruption of Nlkr-h1 expression by RNAi caused stunted wing development and malformations of both male and female external genitalia. Our findings suggest that Kr-h1 may be a useful target for pest insect management.
JIN Min-naXUE JianYAO YunLIN Xin-da
虫害诱导的水稻挥发物抑制水稻病原菌的生长被引量:10
2010年
虫害诱导的植物挥发物在调节植物、植食性昆虫及其天敌的相互关系以及植物与植物之间的化学通讯中有重要作用.为了阐明植物挥发物功能的多样性,研究了虫害诱导的水稻挥发物对植物病原菌生长的影响.结果表明,供试的7种虫害诱导的水稻挥发物对稻瘟病菌Pyricularia grisea Sacc.和水稻纹枯病菌Rhizoctonia solani Kuhn.的生长均有抑制作用.挥发物的种类以及不同的处理浓度导致了抑制作用间的差异,其中绿叶性气味物质(E)-2-己烯醛和(E)-2-己烯-1-醇对病原菌抑制作用最强,另外萜烯类物质中芳樟醇对其也有明显的抑制.虫害诱导的挥发物对植物病原菌生长的抑制说明了植物间接防御物质具有对植物病原菌直接防御的功能,植物挥发物在植物病虫害防治中的潜力巨大.
卢凯李欣周嘉良解晓军戚舒周强
关键词:水稻挥发物虫害诱导稻瘟病菌水稻纹枯病菌
褐飞虱功能基因组及其在害虫防治上的潜在应用价值
<正>水稻是亚洲地区超过世界半数人口的主食来源。而褐飞虱(半翅目:飞虱科)已经成为我国及东南亚水稻产区的主要害虫,其密集刺吸水稻汁液为害会造成水稻枯萎(即"虱烧"),还传播水稻齿叶矮缩病毒和草丛矮缩病毒,常对水稻生产造成...
张传溪
文献传递
共1页<1>
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