目的对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法进行筛查,对HEV_(A71)阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_(A71)各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_(A71)进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_(A71)代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_(A71)分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_(4a)进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_(A71)在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_(4a)亚型HEV_(A71)在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。
目的对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT—PCR),对陕西省2009—2012年分离白手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区基因序列扩增。通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列。采用软件Sequeneher5.0和MEGA5.0对序列进行生物信息学分析。结果陕西省2009~2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苻酸序列同源性,为93.4%~99.4%;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系。陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3%~100%(平均97.3%)和98.3%~100%(平均99.4%)。但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大。结论陕西省2009~2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型。陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大。进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测。
Hand, foot, and mouth disease (HFMD) is a common contagious illness which occurs worldwide both sporadically and in epidemics. The disease mainly affects, children and the typical symptoms, which may resolve spontaneously, include mucocutaneous papulovesicular lesions on the hands, feet, mouth, and buttocks. In rare cases, however, the patients may also develop neurological complications such as neurogenic pulmonary edema,