国家自然科学基金(30260106)
- 作品数：5 被引量：48H指数：4
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- 相关机构：首都医科大学内蒙古大学内蒙古自治区医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 微生物基因分类鉴定的方法学进展被引量：11
- 2003年
- 鲁辛辛刘向祎李大为
- 关键词：分子生物学理论核酸杂交
- 16S～23SrDNA间区在链球菌和流感嗜血杆菌分类中的应用被引量：5
- 2003年
- 利用16S～23SrDNA间区(intergenicspacerregions,ISR)在不同细菌中拷贝数、碱基排列、序列长度及所含tRNA基因种类和数目的差异,对15株链球菌和流感嗜血杆菌进行属、种、型和株系的分类鉴定。在16SrDNA的3′端和23SrDNA的5′端的保守区中合成引物,PCR扩增16S～23SrDNAISR序列,对多态片段切胶纯化直接测序。在GenBank上查找对应细菌的ISR序列。用DNAMAN软件进行系统进化分析。链球菌属为单拷贝16S～23SrRNAISR、有一个tRNAAla基因编码区、分子大小在269～446bp之间,序列分成4个保守区和4个可变区,可变区碱基排列方式和数目的不同是种分类的依据。7株链球菌的同源率在78%～88%。同种异株的差异反映在碱基的插入和缺失上。流感嗜血杆菌各生物型均为2个拷贝的ISR,小片段为514～519bp,编码1个tRNAGlu基因,有3个狭窄可变区。大片段富含AT碱基,在I、II和IV型中分别是868、848和856bp,编码一个tRNAIle基因和一个tRNAAla基因。不同生物型小分子ISR与标准菌株比较,同源性在97.3%～99.6%之间。ISR作为细菌分类的目的基因具有属、种、型和株特异性与灵敏性。简单的基因分离分析技术为认识病原微生物提供了更多的机会。
- 鲁辛辛杨持杨宏欣
- 关键词：链球菌流感嗜血杆菌
- 细菌rDNA分类鉴定的方法学研究被引量：11
- 2006年
- 目的研究细菌rDNA快速鉴定方法。方法以细菌16S rDNA、16S-23S rDNA基因间隔区(ISR)和常见细菌耐药基因为对象,通过改进标本中细菌DNA提取方法,指纹分析、直接测序与多重聚合酶链反应(PCR)技术,建立快速细菌分子鉴定方法。结果细菌属种不同表现出独特的16S-23S rDNA ISR指纹,在分析软件指导下进行初步细菌鉴定和亲缘关系研究;16S rDNA和16S-23SrDNA ISR序列可确定细菌种与型;序列分析与生化鉴定一致。多重PCR可解决葡萄球菌16S rDNA与mecA基因、产超广谱β内酰胺酶菌16S rDNA与TEM和SHV基因同步检测。结论细菌rDNA分类方法,提高了非培养细菌的鉴定能力。
- 鲁辛辛黄艳飞田晓波
- 关键词：基因微生物学技术
- 医院耐甲氧西林葡萄球菌感染的生态学特征被引量：3
- 2005年
- 目的研究葡萄球菌医院感染的生态学特征,为β-内酰胺类抗生素过度使用导致的医院内肺感染提供预防措施。方法以多重耐药凝固酶阴性葡萄球菌作为主要研究对象,采用临床追踪、痰微生物种群定量分析、苯唑西林和头孢西丁耐药表型筛选以及mecA基因检测及序列同源性比较。结果30%(56/185)重症监护病人分离到耐药表型符合研究对象的葡萄球菌;感染与住院时间、病种、头孢哌酮/舒巴坦和亚胺培南使用有关,常与多重耐药鲍曼不动杆菌、阴沟肠杆菌、粪肠球菌、铜绿假单胞菌同时出现;当葡萄球菌超过细菌总数的50%时,应高度警惕继发感染和菌群失调;13%(24/185)病例以菌群交替为特征;64%(36/56)的病例凝固酶阴性葡萄球菌出现在亚胺培南或头孢哌酮/舒巴坦使用1周后;所有耐甲氧西林葡萄球菌菌株含1个533 bp的mecA基因;17株溶血葡萄球菌mecA基因间同源性为99.74%;56株葡萄球菌mecA基因的同源性是97.9%。结论从生态学的3个层面:宏观生态(医院环境、病人条件、抗生素使用等情况)、微生物生态(呼吸道微生物种群变化)、分子生态(mecA基因耐药基因同源性分析)分析葡萄球菌医院感染的特征,为控制医院感染提供新的思路。
- 鲁辛辛郭拥军田晓波董云秋孙淑美
- 关键词：医院感染生态学特征Β-内酰胺类抗生素
- 细菌核酸分类鉴定技术的研究进展被引量：20
- 2004年
- 鲁辛辛王玫周宇
- 关键词：传染病分子诊断技术
