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国家自然科学基金(20975011)

作品数:3 被引量:2H指数:1
相关作者:阎爱侠王凯朱金玉任晓婧胡小英更多>>
相关机构:北京化工大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
相关领域:自动化与计算机技术化学工程医药卫生更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇化学工程
  • 2篇自动化与计算...
  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇因特网
  • 1篇数据库
  • 1篇碳酸酐酶
  • 1篇磺胺
  • 1篇磺胺类
  • 1篇磺胺类药
  • 1篇磺胺类药物
  • 1篇基于因特网
  • 1篇多元线性回归
  • 1篇芳香
  • 1篇SUPPOR...
  • 1篇SVM
  • 1篇MLR
  • 1篇MOE
  • 1篇BLOCKE...
  • 1篇HERG
  • 1篇FINGER...
  • 1篇-BLOCK...

机构

  • 2篇北京化工大学

作者

  • 2篇阎爱侠
  • 1篇胡小英
  • 1篇任晓婧
  • 1篇朱金玉
  • 1篇王凯

传媒

  • 2篇计算机与应用...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 1篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2010
3 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
基于因特网的常用化合物活性数据库简介被引量:1
2010年
随着互联网技术的不断发展,使在线资源变得丰富而便于查询。对于科研工作者来说,在线免费检索化合物结构与活性变得更方便快捷。本文介绍了几个常用的化合物活性数据库,并对其站点,内容,检索方式以及各自特点等做了简要阐述。其中PubChem、ChemBank和ChEBI是关于小分子生物活性的公共数据库,eMolecules和ChemExper是关于商购化合物的数据库,他们的检索方式主要有文本检索和结构检索。DrugBank是1个包含药物的结构、药效、作用靶标等信息的综合数据库,有ChemQuery、TextQuery、SeqSearch和Data Extractor,4种检索形式。ZINC数据库是1个免费的用于虚拟筛选的化合物数据库,主要进行化合物结构检索。ADME/Tox Boxes和Molinspiration Cheminformatics是对分子性质进行计算和预测的数据库,用户可以通过分子结构的输入或SMILES进行检索。
王凯阎爱侠
关键词:数据库
Classification of blocker and non-blocker of hERG potassium ion channel using a support vector machine被引量:1
2013年
The human ether-a-go-go related gene (hERG) channel is responsible for the repolarization during the action potential, and blockage of that may result in severe cardiotoxicity and sudden death. In this study, a dataset containing 1969 compounds was compiled from literature and FDA-approved drugs. Using a support vector machine (SVM), two groups of computational models were built to distinguish whether a compound is a blocker or non-blocker of hERG potassium ion channel. These mod- els fit generally satisfactory. The 100 models built with MACCS fingerprints (Model Group A) showed an average accuracy of 90% and an average matthews correlation coefficient (MCC) value of 0.77 on the test sets. The 100 models built with selected MOE descriptors (Model Group B) showed an average accuracy of 89% and an average MCC value of 0.74 on the test sets. Molecular hydrophobicity and lipophilicity were found to be very important factors which lead to block the hERG potassium ion channel. Some other molecular properties such as electrostatic properties, features based on van der Waals surface area, the number of rigid bonds and molecular surface rugosity also played important roles in blocking bERG potassium ion channel.
XUAN ShouYiLIANG HuWANG ZhiYAN AiXia
芳香/杂环磺胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂的活性定量预测(英文)
2012年
对125个磺胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂的生物活性进行了预测研究。利用ADRIANA.Code软件计算得到了化合物的一系列2D和3D结构描述符,从中选用了12个描述符进行建模。分别用数学随机划分的方法和Kohonen自组织神经网络的方法把数据集划分成两组不同的训练集和测试集。对于这两组不同的训练集和测试集,分别利用多元线性回归(MLR)和支持向量机(SVM)的方法进行建模,共得到4个模型。其中SVM得到的2个模型,训练集的相关系数在0.92以上,测试集预测的相关系数都在0.90以上。所有模型可进一步用于碳酸酐酶Ⅱ抑制剂的虚拟筛选。
任晓婧朱金玉阎爱侠胡小英
关键词:磺胺类药物
共1页<1>
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