广西壮族自治区自然科学基金(0991106)
- 作品数：4 被引量：14H指数：3
- 相关作者：陈晓汉马宁盛小伟高永华曾地刚更多>>
- 相关机构：广西水产研究所桂林理工大学更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金广西壮族自治区科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 凡纳滨对虾肌肉组织cDNA全长文库的构建被引量：3
- 2011年
- 【目的】为了在短期内获得大量凡纳滨对虾肌肉组织的功能基因表达信息,为深入了解功能基因在凡纳滨对虾肌肉组织中的表达提供分子生物学依据。【方法】通过构建凡纳滨对虾肌肉组织的全长cDNA文库,并进行EST测序分析。【结果】文库质量分析表明,初始文库库容约8.50×106CFU,重组率在95%左右,插入片断大小为0.5～4.0kb,多数在1.0kb以上。随机测序72条cDNA,可得到有功能注释的37条全长cDNA和18条编码未知蛋白的基因序列。通过Gene Ontology功能分类可将有功能注释的37个基因分为蛋白质合成、细胞骨架、细胞信号传导、代谢、转运、能量、转录、抗病及防御、生殖发育和未知功能基因等10类,其中蛋白质合成类基因最多(27.03%),与细胞骨架(13.51%)、细胞信号传导(13.51%)及代谢类基因(13.51%)共占67.56%。【结论】构建凡纳滨对虾肌肉组织的全长cDNA文库,可实现短期内获得大量凡纳滨对虾肌肉组织的功能基因表达信息。
- 熊建华高永华马宁盛小伟陈晓汉
- 关键词：凡纳滨对虾肌肉组织生长性状
- 凡纳滨对虾基因组fosmid文库的构建及钙离子通道基因的筛选被引量：6
- 2010年
- 本研究构建了凡纳滨对虾的基因组fosmid文库,该文库包含大约1.1×105个克隆,插入片段平均长度大于35 kb.根据和果蝇钙离子通道基因同源的凡纳滨对虾EST序列设计引物,对文库进行了PCR筛选,得到1个阳性克隆,测序结果显示该克隆包含有钙离子通道基因.研究结果为凡纳滨对虾的基因克隆和分子选育等研究奠定了基础.
- 马宁曾地刚陈晓汉
- 关键词：凡纳滨对虾FOSMID文库
- 凡纳滨对虾肌球蛋白轻链基因MLC的克隆及表达分析被引量：5
- 2011年
- 以生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,斑点杂交筛选获得MLC基因,克隆获得全长编码区序列。序列分析表明序列包含462 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为153氨基酸,预测的分子量为17.5ku,等电点为4.67。通过荧光定量PCR的方法研究了MLC基因在凡纳滨对虾不同组织和不同生长期的肌肉组织中表达情况,显示MLC基因在凡纳滨对虾的心脏、肝胰腺、肌肉、胃、肠、眼柄、鳃和血等组织或器官中都有表达,在肌肉组织中表达量最高,在肝胰腺中表达量最低;在日龄为45 d的对虾肌肉组织中表达量最高,在日龄为10 d的对虾肌肉组织中表达量最低。
- 李文兰盛小伟高永华陈晓汉马宁熊建华
- 关键词：凡纳滨对虾肌球蛋白轻链抑制性差减杂交荧光定量PCR
- 凡纳滨对虾兰尼定受体基因亚克隆文库的构建及部分序列的测定
- 2011年
- 将一个含有凡纳滨对虾兰尼定受体基因的fosmid克隆用DNA剪切仪进行片段化处理,回收3～5kb之间的DNA片段连接到pUC118HincⅡ/BAP载体上,构建了适合于鸟枪法测序的亚克隆文库.经鉴定,该文库滴度为5.0×104 cfu.mL-1,重组率达到90%,插入片段大小在3～5kb范围内.随机挑取100个阳性克隆进行两端测序,通过拼接得到一条兰尼定受体基因部分片段,该片段长2 550bp.通过比对分析,发现该基因片段推导的氨基酸序列与果蝇兰尼定受体基因有较高的相似性.
- 陈晓汉马宁曾地刚
- 关键词：凡纳滨对虾
