国家科技基础条件平台建设计划(2007DKA21002-11)
- 作品数：12 被引量：197H指数：8
- 相关作者：刘新龙马丽蔡青应雄美陆鑫更多>>
- 相关机构：云南省农业科学院云南省甘蔗遗传改良重点实验室联邦科学与工业研究组织更多>>
- 发文基金：国家科技基础条件平台建设计划南省应用基础研究计划重点项目国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 中国滇蔗茅种质资源遗传多样性的AFLP分析被引量：29
- 2009年
- 利用10对AFLP引物对来自国家甘蔗资源圃的41份滇蔗茅(Erianthus rockii)无性系进行扩增,获得860个片段,多态性条带629个,多态性条带比率0.73,特异片段54个。遗传相似性系数、UPGMA聚类和主效应分析表明,在相似系数0.52处做切割线,毛轴野古草、斑茅和滇蔗茅无性系分为3个类群;在相似系数0.715处做切割线时,又将41份滇蔗茅无性系划分为3个大类群,云滇07/23独自形成A类群,鉴于其叶鞘背毛,有待作进一步的分析;B类群3份无性系,主要来自云南西南部高海拔地区;C类群37份无性系,其中30份来自云南西南方向的保山、德宏地区,其他地区7份;在相似系数0.738处做切割时,将C类群37份无性系划分为4个亚类群,亚类群的划分反映出明显的地域分布规律,来自同一地区的无性系多聚为一类;在相似系数0.765处做切割可将C4亚类群划分为4个亚类群(C4-1,C4-2,C4-3,C4-4),其中C4-3亚类群中云滇07/9/1与云滇99/4分子聚类最为相似,可作为复份材料保存;C4-3亚类群在相似系数0.773处切割又可以分为3个分支类群,以上分析反映出同一地区无性系之间具有丰富的遗传变异;主效应分析反映的属间、种间、无性系之间的亲缘关系与分子聚类分析结果一致;由此可见,丰富的地理生态条件造就了滇蔗茅丰富的遗传多样性和明显的地域性分布规律。
- 刘新龙蔡青毕艳陆鑫马丽应雄美
- 关键词：AFLP
- 甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建被引量：34
- 2010年
- 采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F1群体,用F102/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BC1群体。利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分析,构建甘蔗分子遗传连锁图谱。用F1群体获得630个分离标记,经χ2检测,298个标记为单双剂量标记,占总标记数的47%;用BC1群体获得571个分离标记,有264个标记为单双剂量标记,占总标记数的46%;4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>ROC25。在LOD≥5.0,相邻标记遗传距离≤40cM的条件下,F1群体有134个单双剂量标记被纳入55个连锁群,其中39个连锁群归属8个同源组,16个未列入,总遗传距离为1458.3cM,标记间平均图距为10.9cM;BC1群体有133个单双剂量标记被纳入47个连锁群,其中34个连锁群归属于8个同源组,13个连锁群未列入,总遗传距离为1059.6cM,标记间平均图距为8.0cM。从4个亲本单双剂量标记进入的连锁群数来看,Co419最多,归入34个连锁群,其次为Y75/1/2,归入20个连锁群,第3为02/356和ROC25,归入19个连锁群。研究结果表明,从单双剂量标记比例、形成连锁群数量、总遗传距离来看,F1群体构图质量要优于BC1群体。
- 刘新龙毛钧陆鑫马丽Karen Sarah AITKENPhillip Andrew JACKSON蔡青范源洪
- 关键词：甘蔗遗传连锁图谱SSRAFLP
- 云南甘蔗品种表型性状的遗传多样性分析被引量：41
- 2010年
- 为了提高云南甘蔗品种资源的利用效率,为甘蔗遗传育种亲本的选择、杂交组合配制提供理论指导,本研究从18个质量性状和5个数量性状对73份云南甘蔗品种和27份中国历年主栽甘蔗品种(不包括云南选育的主栽品种)的遗传变异、遗传多样性、聚类关系等开展了研究。结果表明:云南甘蔗品种芽形、曝光后节间颜色、曝光前节间颜色、芽沟和57号毛群的多样性十分丰富;而数量性状的遗传变异主要来自叶片宽度和株高;相似性系数和聚类分析表明品种的相似性处于中等水平,可分成2个大类群4个亚类群及20个小类群,主成份分析表明云南甘蔗品种和中国历年主栽品种可划分为3个明显的基因库,与聚类分析结果基本一致。
- 刘新龙马丽蔡青应雄美陆鑫苏火生毛钧范源洪
- 关键词：质量性状数量性状
- 云南甘蔗自育品种DNA指纹身份证构建被引量：57
- 2010年
- 以云南27份甘蔗自育品种为材料，从国际微卫星协会提供的120对SSR引物中筛选出8对多态性丰富、品种聚类区分率高、易统计的引物组成核心引物。8对SSR引物共产生129条带，123个为多态带，多态条带比例为95．35％，多态信息量平均为0．9445，品种相似性系数在0．269～0．767之间，其中引物SMC1047HA，MSSCIR21不仅多态性丰富，而且单个引物就可区分所有品种，是最有效的核心引物。8对核心引物两两组合的效率分析表明，MSSCIR36／MSSCIR2、MSSCIR16／MSSCIR36和MSSCIR36／SMC336BS是高效引物组合，可以完全有效区分所有品种，且品种相似性系数较低；同时使用蔗区种植面积较大的10个主栽品种验证3个高效引物组合，结果表明，MSSCIR16／MSSCIR36是最佳引物组合，不仅能有效区分所有云南甘蔗自育品种，而且能将云南甘蔗自育品种与10个主栽品种最有效地区分开。使用品种的国圃号、国家地区代码、育种单位英文缩写、核心引物名称和分子数据组成云南甘蔗自育品种的DNA指纹身份证，不仅包含了品种的重要信息，而且其中的分子数据可用于品种的真伪鉴定和遗传关系分析，为品种的知识产权保护提供有效的科学依据。
- 刘新龙马丽陈学宽应雄美蔡青刘家勇吴才文
- 关键词：SSRDNA身份证
- 甘蔗国家自然科学基金项目资助情况分析
- 2010年
- 对近10年来国家自然科学基金对甘蔗专业的资助情况进行了统计,就每年资助项目的总金额、项目类别、研究领域分布、受资助单位类型、各省区占的比例等进行了分析,旨在使甘蔗专业的科研工作者了解国家自然科学基金的资助情况及国内的研究领域。
- 苏火生应雄美刘新龙陆鑫毛钧马丽蔡青
- 关键词：甘蔗国家自然科学基金
- 基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系被引量：8
- 2010年
- 以狼尾草属（PennisetumRich.）的象草（P.purpureum）为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族（Saccharinae）内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%~69.1%;ITS2序列长度为215~220bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%~73.4%;5.8sDNA序列长度为164bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%~58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富。属种间遗传距离表明芒属（Miscanthus）和荻属（Triarrhena）与甘蔗属（Saccharum）的亲缘关系最近,其次为蔗茅属（Erianthus）和河八王属（Narenga）;而莠竹属（Microstegium）、大油芒属（Spodiopogon）、白茅属（Imperata）与甘蔗属亲缘关系较远。根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅（E.arundinaceus）归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王（N.porphyrocoma）与滇蔗茅（E.rockii）亲缘关系较近,而与同属的金猫尾（N.fallax）亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究。
- 刘新龙苏火生马丽陆鑫应雄美蔡青范源洪
- 关键词：甘蔗ITS系统进化
- 甘蔗品种资源的表型遗传多样性被引量：35
- 2010年
- 为了提高甘蔗品种资源的利用效率,为甘蔗遗传育种亲本的选择、杂交组合配制及核心种质构建提供理论指导,我们利用17个质量性状和5个数量性状分析了来自13个国家共20个地区的1,160份甘蔗品种资源的遗传变异、遗传结构和遗传距离等。结果表明:5个数量性状在不同来源地品种群体之间的变异系数值(CV)变化较大,说明不同来源地品种群体的数量遗传变异有较大差异,其中来自海南的品种其群体遗传变异最丰富。质量性状的Shannon-Wiener多样性指数表明,来自美国的品种群体遗传多样性最高,其次为中国台湾,第三为澳大利亚,说明上述3个地区的甘蔗种质创新比较活跃,在遗传育种中使用了更多表型性状多样化的亲本。不同来源地品种其群体的遗传分化系数(Gst)和基因流(Nm)显示甘蔗品种群体表型性状的遗传变异主要来自来源地内部,且不同来源地品种群体之间存在较大的基因交流。遗传距离和UPGMA聚类分析结果表明,各来源地品种群体之间遗传距离在0.0261–0.2945之间,其中以福建和广东的品种最为相似,其次为古巴和美国、广西和云南、澳大利亚和菲律宾、江西和四川、巴西和法国,说明上述地区在杂交亲本的选择上比较相近。鉴于此,在遗传育种中应加大利用具有丰富遗传多样性的品种材料并尽量避免选择同一组的品种相互杂交,同时对于与其他来源地品种群体遗传距离较远的墨西哥品种群体在亲本选配时应给予更多关注。
- 刘新龙蔡青吴才文马丽应雄美陆鑫范源洪
- 关键词：数量性状质量性状来源地
- 混合黑穗病孢子侵染甘蔗品种NCO376的研究被引量：4
- 2011年
- 本研究利用对甘蔗黑穗病生理小种1和生理小种2免疫的甘蔗品种NCO376作为寄主材料,在云南开远蔗区搜集黑穗病孢子,依照浸渍、割苗涂抹、抖黑粉孢子、菌液浇灌等人工接种的方法进行甘蔗黑穗病菌的侵染实验,针对NCO376的抗性和黑穗病生理小种进行研究。结果表明,以5×106个孢子/mL的浸渍组试验中对照的侵染率为16%,割苗涂抹侵染率为25.8%,侵染率最高,菌液浇灌侵染率最低为2.5%;清水浸渍组试验中菌液浇灌侵染率为0,割苗涂抹侵染率为13%,抖黑穗孢子侵染率为0。材料NCO376在浸渍组中,割茎涂抹处理侵染率>抖黑穗病孢子处理>对照>菌液浇灌处理;清水浸渍组中,割茎侵染率较高,菌液浇灌和抖黑穗病孢子相对不容易侵染宿主材料。依据标准的浸渍组对照试验,云南开远蔗区可能有新的生理小种存在。
- 刘洪博吴才文蔡青应雄美刘新龙苏火生黄应昆
- 关键词：甘蔗黑穗病侵染
- 甘蔗分离群体的构建和评价被引量：4
- 2010年
- 分离群体是甘蔗基因发掘的重要前提条件,开展甘蔗分离群体数量性状及分子标记数据的评价研究,为甘蔗遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位及遗传育种提供依据。对甘蔗杂合商业品种与野生种割手密远缘杂交的F1群体(Co419×Y75/1/2)的产量性状(有效茎数、单茎重、株高、茎径、公顷产量)和糖分性状(蔗汁糖度、锤度、商业糖分)的频率分布、变异系数进行分析评价;同时对12对AFLP引物和36对SSR引物获得的505个分离标记进行χ2检测。研究结果表明,F1群体的产量和糖分性状符合正态分布,变异丰富,并表现为明显的超亲分离,属于多基因控制的数量性状。AFLP和SSR标记的分离比例检测表明,群体单双剂量标记的检出比例为52%,共获得179个单剂量标记和82个双剂量标记,其中有24对AFLP和SSR引物的单双剂量标记检出比例大于50%,属于比较有效的PCR引物。通过本研究,确认了该群体适合开展遗传连锁作图和数量性状基因定位研究;同时单双剂量标记的获得和高效引物的筛选都将为后续遗传学研究奠定基础条件。
- 刘新龙吴才文毛钧蔡青应雄美马丽陆鑫刘家勇赵俊赵培方范源洪
- 关键词：甘蔗数量性状AFLPSSR
- 割手密初级核心种质取样策略研究被引量：10
- 2011年
- 以国家甘蔗种质资源圃中596份割手密为研究对象,根据21个质量性状和6个数量性状,从分组原则、组内取样比例、组内取样方法3个层次探讨构建割手密初级核心种质的最佳取样策略,共形成50种取样策略;同时设10个总体取样量梯度,确定最佳的总体取样量。分组原则以采集地、海拔、茎径、纬度、生态区域、总体聚类进行分组及不分组的大随机;组内取样比例按组内个体数量的简单比例、平方根比例、对数比例和多样性比例确定;组内取样方法采用聚类和随机2种方法;10个总体取样量梯度为5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%和50%,应用变异系数、遗传多样性指数、表型保留比例、表型频率方差、表型方差等5个参数的主成分综合得分来检验各取样策略的优劣。结果表明,聚类取样优于随机取样;采集地分组和茎径分组都优于其他分组,组内取样比例以多样性比例最好;根据取样策略及总体取样量的分析结果最终确认,按15%总体取样量、以茎径分组、按多样性比例在组内聚类取样为构建割手密初级核心种质的最佳策略组合。在此初级核心种质的基础上,加入取样极易丢失表型性状的材料共计92份,组成最终初级核心种质,占总资源的15.44%。建立的初级核心种质库的遗传多样性、变异系数、表型频率方差、表型方差均明显优于总资源库,表型保留比例达100%,能较好代表总资源库。
- 苏火生刘新龙毛钧应雄美陆鑫马丽范源洪蔡青
- 关键词：割手密初级核心种质甘蔗
