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广州市医药卫生科技项目(2008-YB-074)
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
相关作者:
陈伟烈
魏绍静
唐漾波
唐小平
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相关机构:
广州市第八人民医院
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发文基金:
广州市重大科技攻关项目
广州市医药卫生科技项目
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陈伟烈
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2010
1篇
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长期不进展人类免疫缺陷病毒-1感染者准种膜蛋白V3环氨基酸特点分析
被引量:1
2010年
目的 了解长期不进展HIV-1感染者HIV-1准种膜蛋白V3环氨基酸序列特征及变异特点.方法 应用终点有限稀释套式PCR方法,对5例长期不进展HIV-1感染者不同时间点单个HIV-1前病毒env基因c2-v3-c3区域进行扩增和序列测定,用序列确证分析技术分析env基因区V3环氨基酸序列特征.结果 5例患者不同随访时间点获得的准种序列中,V3环35个氨基酸中出现多样性的位点分别有1~10个不等,同一患者不同随访时间点准种优势株序列完全一致或仅有1~2个位点不同;4例患者V3环顶端四肽为GPGR,1例患者为GPGK,同一患者不同随访时间点V3环顶端四肽一致;根据V3环11和25位氨基酸及V3环的电荷推测HIV-1辅助受体均为趋化因子受体(CCR)5.结论 长期不进展HIV-1感染者V3环序列存在不同程度变异,顶端四肽稳定性高,感染的HIV-1毒株可能为非合胞体诱导型毒株.
陈伟烈
唐小平
唐漾波
魏绍静
关键词:
HIV-1
病毒包膜蛋白质类
氨基酸类
检测HIV-1准种的终点有限稀释PCR技术的建立
被引量:1
2009年
目的建立1种基于实时PCR的检测HIV-1准种的终点有限稀释PCR技术并评价其应用价值。方法采用基于第2轮实时和常规PCR的多重有限稀释巢式PCR、终点PCR及测序等技术对3例低病毒载量HIV-1感染者不同时间点PBMC中的HIV-1前病毒准种ew基因e2-v3-c3区域和gag基因p17区域进行扩增和序列测定;序列经确证后进行系统进化树分析并对氨基酸序列进行比对;用QUALITY程序计算HIV-1DNA拷贝数。结果3例患者所有随访时间点标本共进行1207个巢式实时PCR,从第二轮常规巢式PCR共获得65条c2-v3-c3准种序列、101条p17准种序列;HIV-1前病毒水平介于1.34~53.76拷贝/10。个PBMC之间。c2-v3-c3及p17核苷酸序列系统进化树分析表明,不同患者的序列分开、同一患者的序列特异聚集在一起。氨基酸序列比对分析表明,HIV-1感染早期患者体内HIV-1准种序列比较单一,随着感染时间的增加,HIV-1准种趋于复杂化。结论本研究建立的独特终点有限稀释PCR技术检测HIV-1准种灵敏度高、特异性好、高通量,可用于低水平病毒载量HIV-1感染者HIV-1准种研究。
陈伟烈
唐小平
唐漾波
魏绍静
关键词:
HIV-1
聚合酶链反应
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