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国家重点基础研究发展计划(2005cca04500)
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
相关作者:
张鹏
李明
朱大铭
栾峻峰
郝凡昌
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相关机构:
山东大学
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1篇
2010
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被引量排序
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通过交互式移位-插入-删除进行基因组排序的较快算法
被引量:1
2010年
多染色体基因组进化问题中常见的重组事件就是移位(translocation),对此已有很多研究成果.但事实上更为普遍的情况是2个基因组包含不同基因,这需要考虑插入和删除事件.对于"通过移位-插入-删除进行基因组排序(简称SG-TID)"这个问题,此前已有一个求解移位-删除(或者移位-插入)序列的近似算法,以及求解SG-TID问题的启发式算法.在给出了移位-插入-删除距离的表达公式后,给出了在增加O(n)存储空间的条件下,O(n2)时间内求解该问题的精确算法.该算法比此前给出的算法要快.
郝凡昌
栾峻峰
朱大铭
张鹏
李明
关键词:
基因重组
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