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环二鸟苷酸——新型的细菌第二信使被引量：9: 2009年; 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是新近发现的在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、从运动状态到生物被膜状态的转变、致病因子产生等.基于其对细菌抗生素耐药的物理屏障—生物被膜形成的影响,c-di-GMP的研究越来越受到人们的关注.细胞内c-di-GMP的产生受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)合成和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)降解两条途径调控.在结构上,通常DGC含有GGDEF结构域,PDE含有EAL结构域.c-di-GMP的作用靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型.本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机理、生物学功能等方面的最新研究进展,并对c-di-GMP在今后研究中的应用和发展趋势进行展望.; 路新枝刘湛军于文功; 关键词：第二信使细菌生物被膜

海洋细菌QY202产κ-卡拉胶酶的分离纯化和性质研究被引量：5: 2010年; 为获得高效降解卡拉胶菌株,从青岛太平角海域采集的角叉菜表面分离到1株高产κ-卡拉胶酶的海洋交替假单胞菌（Pseudoalteromonas sp.）QY202,经硫酸铵沉淀、脱盐、DEAE阴离子交换层析等步骤从该菌株发酵液上清中分离纯化得到1种专一性降解κ-卡拉胶的κ-卡拉胶酶,并研究了该酶的基本酶学性质。结果表明该酶被纯化了23.1倍,回收率为43.9%,分子量大小为33.2 kDa。酶的最适反应温度为40℃,最适反应pH为8.0,在0-40℃,pH=7.0-8.0之间酶活力较稳定。酶对底物κ-卡拉胶的米氏常数Km值为1.6 mg/mL。Na^＋、K^＋对酶活有促进作用,而Hg^2＋、Cu^2＋强烈抑制酶的活性。酶解κ-卡拉胶的主产物为硫酸新κ-卡拉二糖和硫酸新κ-卡拉四糖。; 段高飞苏贝韩峰于文功; 关键词：交替假单胞菌分离纯化

一氧化氮(NO)在微生物中的作用研究被引量：6: 2010年; 一氧化氮(nitric oxide NO)是微生物中重要的生物活性分子,在细菌生长、生物被膜形成、细胞保护以及耐药性等方面均能发挥重要作用。研究表明,微生物能够感受外源NO的作用,也可以通过自身的一氧化氮合酶(NOS)以及硝化和反硝化过程产生NO,本文将对近年来有关微生物中NO作用的研究进行概述。; 侯方杰路新枝姜鹏于文功; 关键词：一氧化氮微生物耐药性细胞保护

核糖开关——药物开发的新靶点被引量：1: 2010年; 核糖开关是mRNA上能够与自由代谢产物或其他小分子配体结合或由于环境条件变化而引起构象变化从而调控基因表达的RNA结构元件.核糖开关广泛存在于G+及G-细菌代谢相关基因中,在真菌、植物和高等动物人的血管内皮生长因子基因中也有发现.核糖开关控制生物体内许多重要基因的表达,调节体内基础代谢,信号传递以及氨基酸、核苷酸、辅酶、金属离子的摄取.核糖开关在生物代谢调控、信号传导中的重要作用使其成为一类新型的药物作用靶点,为新型抗生素研发开辟了新的领域.本文综述了核糖开关的研究进展、作用机制、结构功能以及其在开发新型药物方面的研究策略.; 刘湛军路新枝姜鹏于文功; 关键词：核糖开关基因表达调控药物靶点

金黄色葡萄球菌hmp基因缺失突变株的构建及抗一氧化氮能力分析被引量：3: 2011年; 【目的】构建金黄色葡萄球菌RN6390黄素血红蛋白(flavohaemoglobin,HMP)基因缺失突变株,研究其抗一氧化氮(Nitric Oxide,NO)能力及其在细菌生物被膜形成中的作用。【方法】根据同源重组技术的原理,利用PCR扩增RN6390的hmp基因上下游同源臂,经过抗生素和温度交替培养筛选hmp基因缺失突变株,利用基因组PCR、定量PCR对突变菌株进行鉴定。以硝普钠(SNP)为NO供体,检测了hmp基因缺失菌株的抗NO能力,并初步研究了hmp基因在生物被膜形成中的作用。【结果】成功构建了RN6390的hmp基因缺失突变株,外源NO能够诱导菌株hmp基因的表达,hmp基因缺失菌株抗NO能力明显下降,但其生物被膜形成能力有明显提高。【结论】获得了RN6390的hmp基因缺失突变株,该突变株的获得为进一步研究hmp基因的生物功能,以及细菌内源性NO的作用奠定了良好的技术平台。; 姜鹏路新枝侯方杰刘湛军于文功; 关键词：金黄色葡萄球菌缺失突变株一氧化氮生物被膜

细菌调节蛋白Hfq研究进展被引量：1: 2009年; Hfq是一个高度保守的RNA结合蛋白,最初被发现是作为大肠杆菌(E.coli)RNA噬菌体Qβ复制所必需的管家因子,现在则被认为是细菌基因转录后调控的关键因子,广泛参与细菌多种生命活动的调控。与真核生物中Sm和Sm样蛋白相似,Hfq可以通过形成同源六聚体结合富含A、U的单链RNA参与RNA间互作。同时Hfq蛋白还可与体内的多种RNA调节蛋白如polyA聚合酶(IPAPI)、多聚核苷酸磷酸化酶(PNP)、RNA酶E(RNaseE)等并调节他们的活性。此外,Hfq对自身的表达也具有回馈抑制作用。本文主要结合Hfq的研究历史和最新进展,对其分子结构、作用机制、生理功能以及系统进化中的地位做一综述。; 苗翠翠程汝滨宫倩红于文功; 关键词：HFQ 转录后调控系统进化

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国家高技术研究发展计划(2007AA091506)