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国家重点基础研究发展计划(2004CB619201): 作品数：66 被引量：283H指数：10; 相关作者：邱冠周张成桂杨宇夏金兰刘新星更多>>; 相关机构：中南大学湖南科技大学东华大学更多>>; 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家自然科学基金创新研究群体项目更多>>; 相关领域：生物学冶金工程矿业工程环境科学与工程更多>>

硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁代谢基因表达的影响被引量：4: 2009年; 目的:探讨硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌生长及铁代谢基因表达的影响。方法:用血细胞计数板和重铬酸钾滴定法研究了不同浓度硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌生长的影响,采用实时荧光定量PCR技术研究了硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁代谢基因表达的影响。结果:硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌的生长有抑制作用,随着培养基中硫酸铁浓度的增加,抑制作用也越来越明显。实时定量PCR结果表明,用0.15M硫酸铁刺激细菌后,实验中所涉及的铁代谢相关基因表现出相似的表达趋势。刺激10min后,基因均发生明显的的表达上调,且表现为最大值。刺激时间延长,上调幅度逐渐减小。不同的操纵子基因表现出不同的上调幅度。结论:硫酸铁对嗜酸氧化亚铁硫杆菌的生长有明显的抑制作用,铁代谢相关基因对硫酸铁的刺激有积极的反应。; 戴艳霞刘宏伟廖立琴刘学端; 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌铁代谢实时荧光定量PCR

磁泳分离细菌新方法的研究被引量：10: 2006年; 从酸性矿坑水中富集培养分离到的嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,A． ferrooxidans)同趋磁细菌具有一定的相似性。通过显微镜观察发现,部分浸矿细菌在外加磁场的作用下具有微弱的趋磁性,基于菌种的这种特性,设计了磁泳分离仪,对其在磁场作用下泳动(磁泳)进行分析,经磁泳后的近磁、远磁菌的生理特性有较大的差异。从用涂布平板法获得的近磁菌纯培养A．ferrooxidans菌体中,分离得到纳米磁性颗粒,能谱分析表明,其主要成分为Fe和O元素。实验结果证明,A．ferrooxidans具有微弱趋磁性,采用磁泳分离该类菌体内含有磁性颗粒的细菌是可行的,这一分离技术的进一步完善和改进将为传统的微生物菌种分离提供一种新型分离技术,也将大大促进趋磁细菌的研究,而且它与浸矿工艺的结合将大大促进我国生物冶金的研究步伐。; 刘新星谢建平刘文斌霍强邱冠周; 关键词：菌种分离趋磁细菌

嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶的结构模建和底物分子对接(英文): 2009年; 极端环境微生物嗜酸氧化亚铁硫杆菌的谷胱甘肽还原酶(GR)可能在它的抵抗极端酸性,有毒和氧化性的生物浸出环境中发挥至关重要的作用。通过同源模建技术和分子动力学模拟,它的一个三维结构被构建,优化和检验了。获得的结构被进一步用于搜索绑定位点,跟辅因子黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)和底物谷胱甘肽(GSSG)进行分子柔性对接,并以此识别关键残基。对接结果显示,位于活性残基Cys42和Cys47之间的二硫键夹在FAD的活性位点和底物GSSG的二硫键之间。它们之间的距离非常靠近,这跟底物反应机理的初始步骤的情况十分一致。相互作用能表明8个酶中残基Cys42,Cys47,Glu443B,Glu444B,His438B, Ser14,Thr447B和Lys51是固定或激活GSSG的关键残基,这跟以前的实验事实相吻合。此外,根据相互作用能我们还新发现7个重要残基(Arg449B,Pro439B,Thr440B,Thr310,Val43,Gly46 and Val48)。所有这些残基在其它物种中的相应物中也都是保守的。这些结果有助于进一步的实验研究和理解其催化机理,进而揭示这种细菌的抗毒机理,服务于工业应用。; 刘元东曾乐平邱冠周; 关键词：谷胱甘肽还原酶嗜酸氧化亚铁硫杆菌分子对接

一株嗜酸化能异养菌产胞内聚合物的研究: 2009年; 目的:探讨Fe3+对嗜酸兼性异养菌产聚-β-羟基丁酸酯(PHB)的作用及其作用机制。方法:采用两种不同的培养基培养DX1-1,并利用浓硫酸煮沸法,定时检测菌体内PHB含量、细胞干种、培养基中剩余葡萄糖的含量变化。结果:在透射电镜照片中,我们发现细胞内聚集了大量的透明颗粒,并且已经鉴定为聚-β-羟基丁酸酯(PHB)。我们还发现,在Fe3+存在的情况下,细菌DX1-1产PHB的能力急剧下降,仅为细胞干重的14.2%;而无Fe3+存在的情况下,细菌产PHB的能力达细胞干重的40.9%。结论:Fe3+对DX1-1产PHB的能力有一定的抑制作用。; 贺治国邢庆华赵健存胡岳华

磁分离仪分离磁性细菌的新方法被引量：3: 2010年; 磁性细菌胞内可以产生磁性颗粒,因此具有趋磁性,基于这种特性,利用磁分离的原理,本研究开发了一种磁性细菌分离仪,提供了一种分离磁性细菌的新方法。以氧化亚铁硫杆菌为例,使用磁性细菌分离仪进行分离,可以得到强磁菌和弱磁菌。利用透射电镜观察,强磁菌胞内磁性颗粒明显多于弱磁菌;半固体平板磁泳实验也表明强磁菌趋磁性明显强于弱磁菌。各项实验结果表明磁性细菌分离仪可以有效地分离磁性细菌,这是一种分离磁性细菌的新方法,将促进磁性细菌分离培养的研究。; 刘新星郭宁杨英杰梁万洁张剑; 关键词：磁性细菌

氧化亚铁硫杆菌中磁小体形成相关基因mpsA在不同铁源刺激下的差异表达被引量：2: 2009年; 为研究氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)在胞内形成的电子致密的磁性颗粒的相关基因,对氧化亚铁硫杆菌标准菌株ATCC23270的全基因组的生物信息学进行分析,在ATCC23270的全基因组上查找与趋磁细菌中mpsA基因的同源基因ORF1622,并对其进行保守结构域、氨基酸序列比对以及蛋白质同源性分析。利用反转录PCR技术从转录水平研究mpsA基因在硫培养条件下分别用20mmol/LFeCl3和FeSO4·7H2O刺激时的差异表达以验证它们在磁小体形成过程中的作用。研究结果表明:ORF1622编码的蛋白含有PRK05724结构域,与mpsA序列相同度为48%,与acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha同源;氧化亚铁硫杆菌中的mpsA基因在转录层面的表达与亚铁有直接关系,并且氧化亚铁硫杆菌仅在亚铁培养下生成磁小体,因此,它与氧化亚铁硫杆菌中磁小体的形成相关。; 刘新星刘文斌闫颖武海艳邱冠周; 关键词：氧化亚铁硫杆菌生物信息学分析反转录PCR

嗜酸氧化亚铁硫杆菌启动子探针载体的构建被引量：1: 2008年; 目的:为了研究嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans)启动子结构与功能。方法:以pSV-β-galactosidase质粒为骨架,通过定点突变的方法引入一个新的BstBⅠ单酶切位点,构建能在大肠杆菌(Escherichia coli)中正常复制的启动子探针载体。利用PCR的方法将A.ferrooxidans菌cycA2基因上游5'段上游DNA片段克隆到探针载体β-半乳糖苷酶基因上游以替代其原有启动子(gpt启动子),并将重组的质粒转化E.coliDH5α菌株。通过检测宿主细胞的β-半乳糖苷酶活性,来鉴定启动子片段,并分析了启动子探针质粒载体的功能及启动子的强度。结果:pSV-β-galactosidase质粒被正确突变,成功构建了启动子探针载体pSVB。来源于A. ferrooxidans菌的启动子片段可驱动β-半乳糖苷酶基因在E.coli细胞中表达,转化子酶活性约为gpt 启动子驱动下活性的70 %。结论:启动子探针载体(pSVB)可用于A. ferrooxidans菌或者其它原核生物启动子的分离及进一步的分析研究。酶活性分析结果表明,来源于A. ferrooxidans菌cycA2基因上游5'段上游DNA片段具有显著启动子活性。; 杨宇黄芝英刁梦雪邱冠周; 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌 Β-半乳糖苷酶定点突变

Development and evaluation of whole-genome oligonucleotide array for Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270: 2008年; 为了有效地在 whole-genomic 监视 Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 的特征，铺平，整个染色体的 50-mer-based oligonucleotide microarray 基于 A 的 3 217 ORF 被开发。ferrooxidans ATCC 23270 染色体。基于人工的 oligonucleotide 探针，结果证明最佳的杂交温度是 45 ??????? 汯杩湯 ' 拙船樐??????; 李乾申丽罗海良尹华群廖立琴邱冠周刘学端; 关键词：ATCC 特异性灵敏性

阴离子对嗜酸氧化亚铁硫杆菌生长和硫氧化活性的影响被引量：19: 2009年; 以嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,ATCC23270)为对象,研究NO3-、SO42-、Cl-和PO43-对Acidithiobacillus ferrooxidans生长和硫氧化活性的影响。结果表明:不同阴离子对Acidithiobacillus ferrooxidans硫氧化表观活性的影响效应不同,其影响由大到小的顺序依次为Cl-,NO3-,SO42-和PO43-;在高浓度PO43-的胁迫(300mmol/L)下,细菌所表达蛋白质的总数量减少,但同时表达一些特异性蛋白质,这说明细菌可通过抑制一些在正常条件下表达的蛋白质,同时表达一些新的蛋白质来应对无机离子的胁迫效应。; 张成桂张倩王晶张瑞永何环夏金兰邱冠周; 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌阴离子胁迫效应

Expression,purification and molecular modeling of iron-containing superoxide dismutase from Acidithiobacillus ferrooxidans被引量：1: 2008年; 从 Acidithiobacillus ferrooxidans 的 superoxide dismutase (草皮) 可以在它的忍耐起一个重要作用到 bioleaching 的极其有毒、氧化的环境。这基因在 Escherichia 被克隆然后成功地表示了 coli。表示蛋白质被一步舞亲密关系层析最后净化到同质并且观察了根据 SDS 页和 MALDI-TOF-MS 更暗淡。金属内容决心和 recombinant 蛋白质的光系列结果证实蛋白质是包含铁的 superoxide dismutase。为蛋白质的分子的建模表明铁原子被 His26， His75， Asp158 和 His162 绑扎。; 刘元东高建邱冠周刘学端张成桂欧阳叙东蒋莹曾佳; 关键词：超氧歧化酶分子模型

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