国家高技术研究发展计划(2006AA10Z1E3)
- 作品数：6 被引量：16H指数：2
- 相关作者：潘玉春王起山白春艳张向喆赵洪波更多>>
- 相关机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 缺氧诱导因子在血管生成中的研究进展被引量：1
- 2009年
- 目前已发现的缺氧诱导因子(HIFs)有3个,即HIF-1、HIF-2和HIF-3。它们广泛存在于人和哺乳动物的细胞内。HIFs由对氧敏感的功能性亚基(α亚基)和构建性表达的结构亚基(β亚基)组成,它们调节的目标基因的表达涉及血管生成、红血球生成、能量代谢、细胞增殖和凋亡等生物学过程。介绍了近年来HIFs及其在血管生成中的研究进展,以便对HIFs进行更深入、广泛的研究。
- 张向喆王起山潘玉春
- 关键词：缺氧诱导因子缺氧诱导因子靶基因血管生成
- 基因表达谱分析牛早期胚胎发育过程的调控机理被引量：2
- 2010年
- 早期胚胎的死亡会给畜牧业的发展带来巨大的经济损失,特别是对于母牛生产来说更是如此,因此研究早期胚胎发育过程具有极为重要的价值。文章从公共数据库GEO中选取了关于牛早期胚胎发育过程的一套基因表达谱数据,通过显著性分析及聚类分析来研究牛早期胚胎发育过程中不同时期的基因组表达模式。结果表明:整个牛早期胚胎发育过程大致可划分为3组不同的基因组表达模式阶段;同时,差显基因在不同时期表达量的波动情况表明8-细胞期和16-细胞期在牛的整个早期胚胎发育过程的重要性。另外,通过进一步的功能注释和通路分析表明在牛胚胎早期发育不同阶段时期存在着一些重要因子及相关通路。
- 何侃赵洪波白春艳王起山潘玉春
- 关键词：早期胚胎基因表达谱
- 生物医学文本中命名实体识别研究被引量：7
- 2010年
- 生物命名实体识别是对生物医学文本进行信息处理的关键技术。准确的生物命名实体识别工具是对文本进行后续工作如信息提取或文本分类等的先决条件。经过多年的研究,生命科学领域生物命名实体识别取得了一定的进展。本文总结了生物命名实体的特征,分析了基于不同方法的生物命名实体识别系统,及生物命名实体识别方法在提取蛋白质互作等方面的丰富应用,并展望了未来的发展趋势。
- 张向喆王明辉赵洪波王起山潘玉春
- 关键词：生物信息学生物医学文献
- VEGFA,HIF1A和EPAS1基因多态性与猪繁殖性状的相关研究(英文)
- 2014年
- 在梅山猪保种群和法系大白猪群体中采用直接测序法和PCR-RFLP法对基因VEGFA、HIF1A和EPAS1进行了基因多态位点的寻找及多态性检测并对不同基因型的总产仔数、产活仔数等繁殖性状进行了相关分析。在所获得的基因VEGFA的扩增片段中共检测到17个多态位点,其中有4个位点可进行PCR-RFLP检测,分别为BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32I-RFLP和BcnI-RFLP,而在HIF1A和EPAS1扩增片段中未获得可进行PCR-RFLP检测的多态位点。在2个实验猪群中对VEGFA基因的4个多态位点进行基因型及等位基因频率分析,结果表明:VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI 3个多态位点在梅山猪群体中A等位基因占优势,BcnI多态位点在梅山猪群体中B等位基因占优势,而在法系大白猪群体中VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI和BcnI 4个多态位点的相关基因型和等位基因分布极不均衡。BstH2I和PspEI多态位点相关的A等位基因频率在法系大白猪群体中为0,而Eco32I和BcnI多态位点相关的A、B等位基因频率在法系大白猪群体中不到1%。单倍体型推断结果表明VEGFA基因4个多态位点在梅山猪群体中共存在10种单倍体型,而在法系大白猪群体中只存在2种单倍体型BBBA和BBAB,且只有一个个体的单倍体型是BBAB。通过性状关联分析,发现梅山猪群体中VEGFA基因单倍体型BBBA对初产总仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BABA对经产总仔数和经产活仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BBAA对初生窝重影响显著(P<0.05)。使用辐射杂种克隆板将基因VEGFA定位于SSC7q11-12;基因HIF1A定位于SSC1;基因EPAS1定位于SSC3q11-14。而所获得的基因HIF1A和EPAS1的扩增片段无PCR-RFLP可识别的SNP位点。研究结果表明猪VEGFA基因具有成为影响猪繁殖性状分子遗传标记的潜力。
- 张向喆杨仑陈强谭桂芳陈剑严国祥潘玉春
- 关键词：VEGFA基因多态性繁殖性状
- 促肾上腺皮质激素释放激素结合蛋白基因的研究进展被引量：6
- 2008年
- 促肾上腺皮质激素释放激素结合蛋白(CRH-BP)是分子量为37千道尔顿的N-糖基化蛋白。它能够与促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)结合使CRH失活,而脑垂体细胞能够在CRH诱导下分泌促肾上腺皮质激素(ACTH),进而调节应激反应中产生的各种生理现象。对CRH-BP基因的研究为CRH在生殖生理、药理学、动物应激反应等方面的研究开辟了新方向。本文介绍了近年来CRHBP基因在小鼠、人类上的研究进展,以便对该基因进行更深入的研究。
- 李媛媛白春艳吴潇潘玉春
- 关键词：促肾上腺皮质激素释放激素应激
- 猪CRHR1、CRHR2基因的全长编码序列的克隆及分析
- 2009年
- 应激时,下丘脑-垂体-肾上腺(HPA)轴兴奋,促肾上腺皮质激素释放激素(CRH)分泌增加。CRH在应激时对HPA轴调节具有重要作用,而CRH是与促肾上腺皮质激素释放激素受体(CRHR)相互结合发挥其作用的。本文以猪为研究对象,利用同源克隆与电子克隆相结合的方法首次从猪脑组织中克隆得到CRHR1、CRHR2基因的全长编码序列(CDS)。CRHR1基因包含一个长为1248 bp的开放阅读框,编码415个氨基酸。CRHR2基因包含一个长为1236 bp的开放阅读框,编码411个氨基酸。结合已有的数据库对这两个基因的序列进行分析,发现了6个单核苷酸多态性(SNP)位点。
- 李媛媛白春艳吴潇王起山潘玉春
- 奶牛能量负平衡的基因集富集分析
- 引言奶牛繁殖力低的最常见原因之一,是能量供给不能满足它的需求或是能量处于负平衡状态(NEB)。长时间营养不良或者急性限饲,容易导致能量负平衡的发生。在泌乳早期,大多数奶牛由于不能摄入足够的能量而总是处于
- 赵洪波王起山潘玉春
- 关键词：奶牛能量负平衡
- 文献传递
